DF-Endergebnisse des CASP5 Projekts

[Michael H.W. Weber]

Die vom DF-Team eingereichten Strukturen können jetzt hier angesehen werden: http://206.248.62.8/results.html

Es ist zu jedem CASP5-Zielprotein nicht wie erwartet bloß die beste Struktur eingereicht worden, sondern die TOP5 aller gemachten Vorhersagen. Ich bin ja schon gespannt, was die Endauswertung im Dezember ergeben wird...

Was mich etwas stört ist, daß auf der oeben angegebenen Seite nicht der Benutzer aufgelistet ist, der das jeweilige Proteinmodell generiert hat. Ich denke, da werde ich bei Gelegenehit nochmals ins DF-Forum rüberdüsen und fragen, ob die das nicht wenigstens machen können.

Michael.

[edit] Ok, hier die Anfrage: http://bane.free-dc.org/forum/showthrea ... eadid=1474

[Pascal]

Wenn du ins Forum gehst, sag Jodie bitte einen schönen Gruß von mir.

[huraxprax]

Pascal:

Aber auf jeden Fall ist es gut wenn man mal Ergebnisse sehen kann. Auch wen n ich nichts damit anfangen kann weiß ich zumindest daß da was gemacht wird.

aber Platz 100 scheint doch etwas schwerer zu sein...

[Michael H.W. Weber]

Gut, also es bestehen noch Hoffnungen, daß die Alias/User-Namen der DF-Ergebnislieferer nach Einreichung der letzten Strukturen in die Ergebnisliste aufgenommen werden.
Ich finde es allerdings schon etwas armseelig, daß man da erst drauf hinweisen muß, statt daß die DF'ler mal selbst darauf kommen...

Michael.

[Michael H.W. Weber]

Hier die neusten Nachrichten aus der DF "news"-Sektion:

"- Our final CASP5 target has been submitted. The remaining targets will be added to the Results section shortly. It has been a fun and exciting CASP season, and we thank everyone who has helped out in this prediction experiment. We look forward to getting the results in early December at the CASP5 meeting in Pacific Grove, California.

- Now we resume our previous experiment - large-scale sampling of a protein of known structure. The protein is 1KPT chain A, a small, virally encoded killer toxin, secreted by fungi. From this point on new protein updates will occur when the target amount of structures is reached (see the thermometer on the stats page) though we may wait until the Tuesday afternoon following the goal since that seems to work well. We expect it to take several weeks to reach the goal of 10 billion structures for this protein, and we expect at least one structure within 6-8A RMSD to be in a sample of this size."


Michael.

[Michael H.W. Weber]

Inzwischen kann man in der DF-Ergebnissektion auch die Namen derjenigen Leute sehen, die das jeweilige Strukturmodell abgeliefert haben: http://206.248.62.8/results.html

Allerdings nur für die jeweils beste der fünf pro CASP5-Target eingereichten Strukturen. Ich habe mich gewundert, daß auch Saint2002 aus unserem Team nicht dabei ist, obwohl ich genau weiß, daß er für eines der "targets" die beste "pseudo-energy" abgeliefert hat. Also habe ich nochmal im DF Forum darum gebeten, auch die Namen der jeweils anderen vier Rechenkönige zu nennen: http://bane.free-dc.org/forum/showthrea ... #post12345


Michael.