Neues Molekül

Medikamentensuche durch "Docking"-Simulationen (Mapping Cancer Markers, FightAIDS@home, Smash Childhood Cancer, ...)
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Bommer
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#1 Ungelesener Beitrag von Bommer » 28.10.2001 10:58

Hallo



Hab gerade ein neues Molekühl namens C-ABL Tyrosine Kinase zugeteilt bekommen. Bin mal gespannt was da so rauskommt. (Rechenzeit, Hits)



Weiterhin allen viel Spass beim Rechnen.



Cu

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M. Franckenstein
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#2 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 28.10.2001 12:30

Hallo,



ich habe es schon etwas länger. Gerade mal 2 HITS, 22 Std. für jetzt 96% und sonst auch nicht gerade das tollste...



JE1SUS

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vfrey
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#3 Ungelesener Beitrag von vfrey » 28.10.2001 20:35

1,5 Stunden für die ersten 92 %, nochmal 17 Stunden bis 93 % und dann 5 Minuten bis 100 %. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_worry.gif" alt="Worried"> Und dann 11 Hits dabei. Naja, besser als COX, da gibt's fast gar keine Hits. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_cry.gif" alt="Crying (very sad)">

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M. Franckenstein
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#4 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 28.10.2001 21:42

ich stelle auch gerade eine Verbesserung fest. Eine Stunde für die ersten ~50% und bis jetzt (61%) weitere 4 Stunden und 50 Minuten. Ganze 13 HITS bis jetzt. Ob dieses Molekül was bringt? Ich bezweifel es... Die lange Bearbeitungsdauer liegt aber eher an den Progs die ich nebenbei laufen lasse, oder?

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Bananeweizen
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#5 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 30.10.2001 19:57

Ich habe die Screenshots upgedatet und wüßte gerne mal, ob es noch weitere Proteine außer den 4 gibt, die ich bisher abgebildet habe.



Ich habe da nicht ganz den Durchblick, da ich nicht so oft UD rechne.



Ciao, Michael.

Pascal

#6 Ungelesener Beitrag von Pascal » 30.10.2001 21:18

Habe bei C-ABL grade 2 hits bei aktuell 94% <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/crying.gif" alt="weinen"> <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/crying.gif" alt="weinen"> <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/crying.gif" alt="weinen">

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M. Franckenstein
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#7 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 30.10.2001 21:38

@ Bananeweizen

hallo, ich glaube ich habe schon mehr als 4 Proteine gehabt.



@ Pascal_25

hallo, mit dem Protein läuft es wohl bei keinem richtig gut, obwohl ich schon ein gutes Ergebnis erzielt hatte - nun wieder "nur" 96% und 22 HITS





JE1SUS

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vfrey
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#8 Ungelesener Beitrag von vfrey » 30.10.2001 22:01

Hallo Michael, meines Wissens gab es bisher 6 Proteine: VEGF und SOD (beide abgeschlossen), RAS, Tyrosine Kinase (hab' ich ganz selten gehabt), und als neueste Cyclooxygenase (6COX)und BCR-ABL Tyrosine Kinase (welches momentan dauernd kommt).



Schön zu ersehen unter: http://www.chem.ox.ac.uk/cancer/targetproteins.html <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_smile.gif" alt="Smile">

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Bananeweizen
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#9 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 31.10.2001 00:12

Hat da eventuell jemand noch Screenshots (nach Möglichkeit unkomprimiert!) zu den fehlenden zwei Proteinen? Ich laß den Agent jetz auch mal bei mir laufen, vielleicht kriege ich ja noch eines der beiden Proteine rein...



Ciao, Michael.



PS: Die Liste bei der Uni Oxford kenne ich, deswegen frage ich ja, ob die alle schon am Laufen waren...



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#10 Ungelesener Beitrag von vfrey » 31.10.2001 00:18

Zumindest haben alle sechs meine PCs schon beschäftigt...solte ich einen der fehlenden bekommen, schicke ich Dir gerne einen Screenshot. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/wavey.gif" alt="winken">

<font size=-1>[ Diese Nachricht wurde geändert von: vfrey am 31.10.2001 00:18 ]</font>

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#11 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 31.10.2001 00:20

Danke für das Angebot.



Auch sonstige fehlende Screenshots zu anderen Projekten nehme ich gerne entgegen. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_smile.gif" alt="Smile">



Ciao, Michael.

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#12 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 31.10.2001 00:29

ich kann mich nicht an diese Farben bzw. Form der Proteine erinnern, aber versuch mal diese Seite



http://www.chem.ox.ac.uk/cancer/proteinimages.html



oder die Hauptseite "davor"



http://www.chem.ox.ac.uk/curecancer.html



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