CASP9

[hias]

... da sie bereits schüchtern angekündigt haben, evtl. zum Start von CASP mit einem GPU-Client aufzuwarten...

Da tät ich ja glatt mal meine betagte 8800 Ultra entstauben und von Spinnweben befreien

Pro POEM (auch wenn ich - trotz lesen der Beschreibung von CASP auf der Rechenkraft.net Seite - immernoch keinen Dunst hab, was CASP ist).

Gruß,
Ritschie

Ich hab da noch eine Erklärung im Kopf, sie ist zwar sehr laienhaft und vll auch nicht 100% korrekt, dafür verständlich.

CASP9 ist ein Wettkampf, bei dem über einen bestimmte Zeitraum mehrere Proteine bekannt gegeben werden. Diese müssen dann durch die Proteinvorhersagesoftware des jeweiligen Projekts (z.B. Poem, Rosetta...) in ihren Strukturen vorhergesagt werden. Am Schluss werden die Vorhersagen mit den tatsächlichen (=experimentell bestimmten???) Ergebnissen verglichen, und das Projekt mit der höchsten Genauigkeit gewinnt.

Problem dabei ist, dass manche Projekte in der kurzen Zeitspanne nicht alle Proteine vorhersagen können (so auch Poem) und deswegen unausweichlich auf den hinteren Plätzen landen, weil einfach zu wenig Rechenkraft dahinter steckt.

[Ritschie]

Das ist doch mal ne Erklärung, die auch ich verstehe

Danke und Gruß,
Ritschie

P.S. hab ich schon erwähnt: POEM!

[dexter]

gute erklärung

sowas nenne ich mal einen erklärbär

[MonsieurPoot]

Nochmal als Hinweis aus dem POEM-Forum:

Hi everybody,

yes - we will take part in CASP9. But although the organizers said that first workunits will be released from may 3 onwards, don't expect too many targets just then.

Experience of the last CASP showed, that computing power is needed especially during the final CASP stages in June -> July.

Thanks for your support,
Timo

http://boinc.fzk.de/poem/forum_thread.php?id=403

- Poot

[vfrey]

das ist leider mal wieder die klassische Informationspolitik von POEM. Während Rosetta quasi Generalmobilmachung für CASP betreibt, kriegt man hier nur zu hören "erwartet Euch bloß nichts".

Egal, ich werde mein Rechnerlein ab nächste Woche auf POEM umstellen, mal schauen, was rumkommt.

[Michael H.W. Weber]

das ist leider mal wieder die klassische Informationspolitik von POEM. Während Rosetta quasi Generalmobilmachung für CASP betreibt, kriegt man hier nur zu hören "erwartet Euch bloß nichts".

Nein, damit meinten die doch bloß die Zahl der Targets in der Anfangsphasen.

Michael.

[vfrey]

hier nochmal eine aktuelle Einschätzung von Timo Strunk.

We will definitely inform everybody once we got CASP workunits. Although CASP9 should already start on the 3rd of May, we think that the workunits related to CASP will not stock up until at least the middle of May.

[vfrey]

Rosetta@Home hat seit gestern übrigens CASP-WUs im Angebot - hat schon jemand bei POEM was entsprechendes erhalten?

[Torbjörn Klatt]

Wie Timo schon im POEM-Forum geschrieben hatte:

Message 3540 - Posted 1 May 2010 8:41:54 UTC

Hi everybody,

We will definitely inform everybody once we got CASP workunits. Although CASP9 should already start on the 3rd of May, we think that the workunits related to CASP will not stock up until at least the middle of May.

Have a nice weekend,
Timo

Qulle: http://boinc.fzk.de/poem/forum_thread.p ... =true#3540

Also schön Geduldig sein

[yoyo]

Hab mal schon eine Challenge angemeldet:
http://boincstats.com/bam/challenge.php ... ls&chid=29

yoyo

[vfrey]

Also schön Geduldig sein

Hallo Bohne,

was Du da von Timo zitierst, hatte ich zwei Posts vorher auch schon zitiert - mir ging es nicht darum, mich über POEM zu beschweren (ausnahmsweise ), ich wollte nur wissen, ob es evtl. doch schon CASP-WUs gibt, da ich aktuell noch mit anderen Projekten beschäftigt bin.

[Torbjörn Klatt]

Also schön Geduldig sein

Hallo Bohne,

was Du da von Timo zitierst, hatte ich zwei Posts vorher auch schon zitiert - mir ging es nicht darum, mich über POEM zu beschweren (ausnahmsweise ), ich wollte nur wissen, ob es evtl. doch schon CASP-WUs gibt, da ich aktuell noch mit anderen Projekten beschäftigt bin.

Sry, manchmal bin ich einfach zu blind...

Um aber auf das Wesentliche zurückzukommen: Ich bin mir sicher, dass die das ganze in die Projekt-News schreiben. Also mal den RSS-Feed abonnieren und bereit halten.