Achtung! Proteinwechsel!

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Namanao
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#73 Ungelesener Beitrag von Namanao » 23.07.2002 10:36

Michael H.W. Weber hat geschrieben: :D Ärgerlicherweise kann ich schon den ganzen Morgen nichts hochladen. Ich vermute, die Server sind überlastet. :worry:
Das mußte ich auch schon feststellen.
Hin und wieder läuft es aber (mehr oder weniger gut).

Namanao

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S_Garbe
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#74 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 23.07.2002 11:12

@Michael - ich hab zum Glück alles schon gestern hochgeladen - im Moment rechnen die DF-Kisten an Genome :)
mal schauen wie das neue Protein aussieht - vielleicht bleibe ich auch etwas bei Genome - das macht wenigstens keinen Ärger

Gruß
Stefan
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Michael H.W. Weber
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#75 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 25.07.2002 12:47

Ihr müßt unbedingt den "switch" -rt in eure "foldit.bat" eintragen. Damit wird der Klient in der Tat doppelt so schnell. :D

Ansonsten war der Proteinwechsel mal wieder eine einizige Katastrophe. :worry: Kein einziges altes Protein wurde angenommen. Stattdessen wurden die Daten einfach gelöscht. Ich habe das im DF-Forum auch schon bemängelt. Also hoffen wir auf ein Neues, daß es nächste Woche klappt. :roll:

Michael.
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#76 Ungelesener Beitrag von Rechtsconsulter » 25.07.2002 17:09

Michael H.W. Weber hat geschrieben: Kein einziges altes Protein wurde angenommen. Stattdessen wurden die Daten einfach gelöscht.
Jau, das haben die Jungs von DF auch wieder schlau hingekriegt.
Kündigen lang und breit an, dass die alten Proteine angenommen werden würden und schreiben dann NACH dem Update (grrrr) in den News, dass man die alten Proteine sichern muß und erst nach dem Update hochladen kann. :silly:
Da waren dann bei mir ja nur so um die 150.000 Strukturen im Nirvana, da ich aus Zeitgründen erst nach 18 Uhr zum Hochladen kam... :crying:
Schöner Mist!

Tschau RC

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#77 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 25.07.2002 18:59

Ja. Und wie meine Untersuchungen ergeben haben, ist auch das nachträgliche Schicken gesicherter Daten NICHT möglich! :worry:
Hoffe aber, es wird nächste Woche klappen...

Michael.
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#78 Ungelesener Beitrag von cannibal » 25.07.2002 20:18

äääääääääh

Meine alten wurden gezählt.



Und was wie wo umschreiben.Bitte genaue Anleitung.

Servus

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#79 Ungelesener Beitrag von BaRu » 25.07.2002 23:21

Bei mir hat das mit den alten Strukturen auch geklappt :lol:

Die Änderungen in der foldit.bat sollten etwas so aussehen :

:donename
if EXIST donename.dat del tmpfoldit.bat
if EXIST donename.dat del donename.dat
.\foldtrajlite -f protein -n native -df -g 0 -rt -p -5 -s 10000
if EXIST doupdate.txt goto doupdate
goto end

der Schalter -rt bewirkt, dass Du mehr Arbeitsspeicher nutzt. Siehe auch die readme...

Wenn Du genügend RAM hast bewirkt dies eine Verdoppelung der Rechenleistung :angel2:

Gruss
Rüdiger

Pascal

#80 Ungelesener Beitrag von Pascal » 26.07.2002 10:50

im Forum von DF wurde erwähnt, daß es eine GUI für DF gibt :wink:
http://bane.free-dc.org/forum/showthrea ... eadid=1249

http://gilchrist.ca/jeff/dfGUI/

Aktuelle Version ist die V 1.71 (hab ich seit gestern. Ich finde, das Teil taugt was.
Aber denkt dran: Änderungen werden nach dem Neustart des Clients erst aktiviert, also erst die Häkchen setzen und dann START

Viel Spass

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#81 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 26.07.2002 12:43

Pascal hat geschrieben:http://gilchrist.ca/jeff/dfGUI/

Aktuelle Version ist die V 1.71 (hab ich seit gestern. Ich finde, das Teil taugt was.
Aber denkt dran: Änderungen werden nach dem Neustart des Clients erst aktiviert, also erst die Häkchen setzen und dann START
Dat Ding'n is absolut goil! Da macht dat Strukturenwegknacken wieder doppelt Spaß! :D :party: :popcorn: :angel3: :grinsanta: :smilered:

Michael.

[edit] Hmmmm, ich mußte feststellen, daß mit dfGUI wieder diese olle "progress.txt" angelegt wird. Das kostet Performance und läßt die Platte rödeln. Man kann recht unten zwar "progress update" auf Null setzen, das hat dann aber zur Folge, daß der Monitor als Anzeigeinstrument nutzlos wird, da er sich an genaue dieser Datei orientiert. :roll: Hab's dem Programmierer mal gemailt...
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#82 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 30.07.2002 10:33

So, heute Abend ca. 18:00 ist es wieder soweit. Bitte lest euch die unten abgedruckten Neuigkeiten durch. Ihr solltet - damit die alten Proteine wirklich angenommen werden können - VOR DEM PROTEINWECHSEL :attention: euren Client aktualisieren, sonst werden die alten Ergebnisse beim Update wieder gelöscht. Geht dazu bitte hierher http://www.distributedfolding.org/news.html und ladet euch den benötigten Kram herunter.

Bin schon gespannt, wie groß das neue CASP5-Protein sein wird. :P

Michael.

P.S.: Der rot markierte Teil dürfte für die Großfarmer interessant sein und bestätigt etwas, das ich auch schon erlebt habe (und leider nicht ernst genug genommen habe, da es bloß einmal vorkam).

Zitat:
"07/29/2002

- Ok, the new binaries are now up that avoid deleting old protein data when a new update is detected. This is the only change so you only need to grab a new version if this issue concerns you. Either grab a new copy from the Downloads page, or grab just the new executable with the following links if you are running the client on Windows, Linux gcc or Linux icc.

07/26/2002

- We have fixed the client/screensaver to now keep old files when a new update is detected. Also if you upload an expired protein, it will appear to be accepted but if you check the error.log you will see a message to the effect that the protein was expired and thus you will not receive credit for it. The new binaries will be posted on Monday so please check back here for them then.

- Some potential problems in the back-end tallying of results uploaded have been resolved as well. Previously, there was a chance that if one user had several machines all uploading results simulataneously, that user might receive less credit than the sum of the individual uploads. Users uploading from a single machine would not be affected. Also, the integrity of all uploaded data has been maintained, it is only the statistics for number of structures contributed that may be slightly off. we believe the error was at most 10% (so if the statistics said we made 1 billion we may really have made 1.1 billion. Thanks to several users with lots of computers (you know who you are) for helping to track this problem down."
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#83 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 30.07.2002 18:57

Das neue Protein hat 157 Aminosäuren. Auch das Autoupdate inkl. Hochladen der alten Strukturen war diesmal erfolgreich, sofern man die aktuellste Klientversion zuvor installiert hatte (siehe oben). :P

Michael.
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#84 Ungelesener Beitrag von Rechtsconsulter » 30.07.2002 20:02

Ach was war das schön mit dem verbesserten Client.
Das Laden des Updates dauerte ca 10 Sekunden und dann wurden die alten Strukturen anstaltslos hochgeladen - und sogar gezählt! :good:

Das neue Protein ist zwar etwas länger, wird aber dafür ganz schön schnell berechnet. Irgendwie passen da die Aminosäuren wohl besser...

Tschau RC

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