DF "kicks ass"

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Michael H.W. Weber
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DF "kicks ass"

#1 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 22.07.2002 14:42

Ab kommendem Dienstag (also morgen Abend ca. 18:00 Ortszeit) wird eine neue DF-Clientversion vorliegen, die nach Codeverbesserungen doppelt so schnell rechnen wird wie bisher. :crazyeyes: Ursache ist das komplette Laden der "protein.trj" ins RAM. Da kommt Freude auf! :grinsanta: :popcorn: :smilered:

Gruß,
Michael.

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S_Garbe
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#2 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 22.07.2002 15:02

ich würde denken, das DF bei mir jetzt schon alle benötigten Komponenten komplett im RAM hat - die Festplatte wird bei mir jedenfalls nur angesprochen wenn neue Bestwerte vorliegen oder ein 10000er Block fertig ist - wenn sich also die Geschwindigkeitssteigerung nur darauf bezieht, wird sich da nicht viel tun - damals mit dem entpacken der protein.trj ist ja auch eine Geschwindigkeitssteigerung versprochen worden.

ich denke die Geschwindigkeitssteigerung wird hauptsächlich die betreffen, die etwas knapp mit RAM versorgt sind - bei denen wird wahrscheinlich die protein.trj nicht im Cache gehalten - das könnte natürlich auch nach hinten losgehen - wenn der Rechner dann anfängt wie wild rumzuswappen weil der RAM nicht mehr für alle Programme ausreicht

Gruß
Stefan
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Michael H.W. Weber
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#3 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 22.07.2002 15:20

Ich kann nur weitergeben, was Howard Feldman im DF Forum sagte - der Link ist ja oben angegeben. In der Tat war das Entpacken der von Dir genannten Datei damals eine Ente - WIR haben es ja sogar zuerst nachgemessen und den DF'lern mitgeteilt. Ich gehe allerdings davon aus, daß Howard daraus etwas gelernt hat und den Kram zuvor bei sich genaustens durchgemessen hat. Wir werden sehen. In einer Hinsicht hast Du auf jeden Fall Recht: Die neue DF-Version wird knapp 150 MB RAM alleine für sich beanspruchen - wenn man den "2x schneller switch" aktiviert (ist wohl optional).

Michael.
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Arnim Weber

#4 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 22.07.2002 16:38

Autsch. Das mit dem RAM ist ja der Hammer. Wer hat schon so mal eben 150 MB RAM über ??? :worry:

Pascal

#5 Ungelesener Beitrag von Pascal » 22.07.2002 16:38

@MHWW: dann werde ich mal wieder zwei Clients laufen lassen, ein 2x geswitchter und ein normaler Textclient.
Oder wie macht ihr es dann?

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S_Garbe
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#6 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 22.07.2002 17:20

viel wichtiger als ein schnellerer Client wäre für meinen Bedarf ein schnellerer Server oder eine dickere Leitung auf der Gegenseite - oder was noch besser wäre - eine stärkere Datenkompression für die Ergebnisse - ich hab jetzt mit 4 Clients in knapp einer Woche ca. 100 MB Daten erzeugt - und hab ca. 6 Stunden gebraucht um das Ganze loszuwerden - DF ist ganz schön teuer - wenn ich mal alle Rechner auf DF ansetzen würde, dann käme ich so auf 1GB pro Woche - und falls der Client wirklich doppelt so schnell werden würde wären das schon 2GB - hochgerechnet von meinen heute benötigten 6 Stunden würde ich dann 120 Stunden zur Datenübertragung brauchen :evil:

Gruß
Stefan
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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 22.07.2002 17:20

@Arnim: Mit 'nem fiesen 256er Modul komme ich da locker hin. :smilered:

@Pascal: Ich lassen bloß einen Klient pro Kiste laufen. :wink:

@Stefan: Die haben doch auch auf der Serverseite Verbesserungen eingeführt. Mit den anfallenden Upload-Mengen ist es natürlich wirklich für manche ein Problem. Ich wünschte allerdings erst mal, ich hätte soviele Kisten auf DF laufen. :evil2:

Michael.
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Arnim Weber

#8 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 22.07.2002 20:18

@Mikel: Is schon klar. aber in der Uni habe ich noch zwei mittelalterliche Rechnixe, die nur 128 MB RAM besitzten. Wenn ich da dann weiter DF laufen lassen will, reissen mir meine Laborkolegies den Popo auf ... Die sind sowieso schon am meckern ...
Dies wird natürlich von mir ignoriert, da es sowieso alles nur Jungdoktoranden sind, die sowieso nix zu sagen haben :lol:
Spass muss sein :evil2:

Arnim Weber

#9 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 22.07.2002 20:20

@Mikel: Meld dich doch mal bei mir !!! :lol: Oder moment: ich ruf mal eben durch ... :D

Gast

#10 Ungelesener Beitrag von Gast » 22.07.2002 20:44

Michael H.W. Weber hat geschrieben:@Arnim: Mit 'nem fiesen 256er Modul komme ich da locker hin. :smilered:

Michael.
Da brauche ich mir bei 1024 MB wohl keine Sorgen machen! :smoking:

GOLDENBALLSAINTYORK

DF if you've got the RAM

#11 Ungelesener Beitrag von GOLDENBALLSAINTYORK » 23.07.2002 02:11

Liebe Michael!
With the latest news from Brian, and having 384MB RAM at my disposal, I shall have to leave TSC... :(
I think this is a good project, but as I have iterated on a new thread on that messageboard, I need to utilise the computing power I have.
Forgive me...but you at Rechenkraft seem to have a very large number of projects on board across a very large spectrum of Science....
I long ago gave up SETI...ECCp and Mersenne..
I believe the Biological based projects are 'nearer too home' as one says.. and more likely to bear fruit for the common good..
But then:' Each To Their Own'
Regards.
Ian (GBSY)

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