Upload alter Proteine

[Rechtsconsulter]

Hallo allerseits!

Ab kommendem Dienstag soll es ja nunmehr möglich werden, auch die alten Proteine noch hochzuladen. Die Rede ist dabei von "a few days".
Bei dem derzeitigen Protein mit 163 Aminosäuren kommt ja keiner auf schlechte Gedanken, aber folgende Möglichkeit:
Bei einem Wechsel von einem kleinen auf ein großes Protein läßt jemand den Client mit dem alten Protein weiterrechnen. Die Auswirkung auf die Quantität des Ergebnis wäre z.B. beim letzten Wechsel (83 zu 163) gravierend.
Dies wäre im Gegensatz zum mehrfachen Hochladen der Proteine (siehe Thread) nicht einmal nachvollziehbar, insbesondere wenn die Systemzeit noch um einen Tag oder mehr zurückgesetzt werden würde.
Ich weiß, alle hoffen auf Ehrlichkeit, aber einem Unehrlichen wird Tür und Tor geöffnet.
Ich darf noch anmerken, dass ich niemandem etwas unterstellen möchte. Dies soll nur ein Hinweis auf die eröffnete Möglichkeit sein.

Tschau RC

[Sven]

Wo ist denn da das Problem? Oder besser, das größere Problem sind doch die, die bei der bestehenden Regelung mal eben stundenlang für nichts gerechnet haben!
Und man müßte ja entweder gebannt beim Wechsel neben dem Rechner sitzen (was ja die wenigsten Teilnehmer tun) oder schon vorher wissen ob die nächste Struktur größer ist.

Und mal ganz davon ab, das spielt doch nur bei den ständigen Wechseln während des CASP-Tests eine Rolle. Die finden doch in Zukunft wieder in längeren Abständen statt, oder habe ich irgend etwas nicht mitbekommen?

Tschüs, Sven.

[Michael H.W. Weber]

1) Ob schon ab Dienstag dieses "feature" zum "upload" der alten WUs bereitsteht, müssen wir abwarten, nachdem ja der letzte Proteinwechsel ein einziges Chaos mit den neuen Serversystemen war. Ich drücke die Daumen und hoffe, daß der augenblickliche Testlauf bis dato in ein funktionierndes System verwandelt wurde.
2) Wenn es denn funktioniert, kann wohl niemand davon abgehalten werden, apäter ggf. noch ein wenig auf einem der evt. kleineren Proteine "herumzukauen". Das schadet ja nicht dem Projekt, sondern generiert schlicht mehr Strukturen - wenn auch für das Vorgängerzielprotein. Aber das sollte jawohl jedem selbst überlassen sein, für welches Protein er/sie rechnet - schließlich zahlen wir ja auch die Stromrechnung. Ich bin nur froh, daß dann endlich Schluß damit ist, daß haufenweise generierte Proteinstrukturen den Ausguß runterfließen. Auch muß man sich dann ja weniger um den Klienten kümmern.

Michael.

[Michael H.W. Weber]

Aha. Also schon ab heute soll wohl das Hochladen alter Proteine möglich sein und zwar zu folgenden Bedingungen:

Es wird NUR das zuletzt ausgegebene Protein (und natürlich das neue) angenommen - keine älteren. Die Annahme ist nach Proteinwechsel befristet auf 48 Stunden. Danach wird das alte Protein nicht mehr angenommen. Das "crediting" erfolgt innerhalb der ersten 24 Stunden nach Proteinwechsel normal, innerhalb der weiteren 24 Stunden erhält man für die abgelieferten Strukturen nur noch den halben "credit". Damit soll vermieden werden, daß Leute länger auf evt. kleineren Vorgängerproteinen herumrechnen, um ihre Statistiken zu optimieren.

Desweiteren interessant für Leute mit großen Rechnerfarmen dürfte es sein, daß man den neuen Client ab NÄCHSTE (!) WOCHE programmgesteuert zunächst nur auf einen Server (der die Rechnerfarmklienten bedient) lädt. Dieser verteilt dann das "update" an die Rechner über das LAN. Dazu hat Howard Feldman wohl eine Art Daemon (ich hab' leider keine Ahnung, was das ist) geschrieben, der augenblicklich noch getestet wird. Vorteil ist, daß der Netztraffic damit erheblich reduziert wird (um z.B. derartige Desaster zu vermeiden, wie sie letzten Dienstag auftraten). Genauere Details sind in der unten angegebenen Quelle zu finden.

Quelle: http://bane.free-dc.org/forum/showthrea ... genumber=1

Michael.

[Rechtsconsulter]

Klasse Regelung!

Ergänzend ist hinzuzufügen, dass wohl nur die pseudo-energy für das neue Protein gutgeschrieben werden wird.

Tschau RC

[Bananeweizen]

Aha. Also schon ab heute soll wohl das Hochladen alter Proteine möglich sein

Nein. Aus dem selben Thread (vom 11.7.):

This will be effective AFTER the next protein update (so the current protein will still be invalid as soon as we changeover).
Ciao, Michael.

[S_Garbe]

Server temporarily down while we change to a new protein. Please check back in an hour

Gruß
Stefan

[Michael H.W. Weber]

@Bananeweizen: Du hast Recht - alte Proteine werden erst NACH dem heutigen Wechsel - also ab nächster Woche - angenommen. Ich konnte eben dennoch scheinbar sämtliche alten Daten hochladen (über 1 Stunde nach Proteinwechsel). Zumindest finde ich nicht die üblichen Dateileichen in meinem DF-Folder und sehe auch bei dem sich schnell schließenden W2K-Konsolenfenster keine Fehlermeldung. Komisch. Oder werden die neuerdings gelöscht?
Der Server ist im Augenblick noch "down". Mal sehen...

Michael.

[Pascal]

Der Server ist im Augenblick noch "down". Mal sehen...

Michael.

Also ich hab schon den neuen Client und bin am Falten.

[Michael H.W. Weber]

Also ich hab schon den neuen Client und bin am Falten.

Jawoll - ich jetzt auch. 85 Aminosäuren - cool.

Michael.

[LIWI]

werdein der Arbeit direkt 2 Rechner anschmeissen gibt wieder einen guten Wochenschnitt die gehen ja ab wie nix

Gruss Stefan

[Pascal]

@LIWI: Guck mal in den Stats, du bist in den besten RMSD !!!