Simap hat wieder sporadisch Arbeit

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
Nachricht
Autor
gardenone

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#361 Ungelesener Beitrag von gardenone » 29.08.2009 14:33

Mach mal'n Foto - en Foto is immer gut!


Heute auf Platz 4 vorgerückt.
:)

Leider habe ich meinen Server immer noch nicht am laufen. Ich hab das Ding zwar mittlerweile durch auseinandernehmen anderer Systeme zum leben erweckt, die OS-Installation ist aber noch nicht so weit.
Im Moment kämpfe ich noch mit den blöden Treibern für die Festplatten, jetzt fehlt noch so'ne txtsetup.oem.

Ich glaub das gibt zur laufenden Simapaktion nichts mehr.

Sparrow
Mikrocruncher
Mikrocruncher
Beiträge: 24
Registriert: 21.07.2009 20:52

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#362 Ungelesener Beitrag von Sparrow » 29.08.2009 15:05

Was ist ist denn hier los? SIMAP hat schon Arbeit verteilt? Ich dachte es geht immer erst am Abend des letzten Tages im Monat los!?

Na was solls, ein bisschen was kann ich vielleicht noch abstauben...

Benutzeravatar
Ritschie
Team-Joker
Team-Joker
Beiträge: 313
Registriert: 31.05.2009 09:32
Wohnort: Bayreuth

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#363 Ungelesener Beitrag von Ritschie » 29.08.2009 15:34

Mich hat SIMAP diesmal auch ganz schön überrascht. Sind auch einige unplanmäßige Wutzen dabei:
Further workunits calculate the similarities of domain superfamilies. This dataset has been prepared in co-operation with the Gene3D team and initiates a novel aspect of SIMAP. It will be used to construct new versions of the Gene3D database.
Aber zum Bunker voll machen langt's auch bei Dir sicherlich noch :rainbowafro:

Gruß,
Ritschie
Bild

Sparrow
Mikrocruncher
Mikrocruncher
Beiträge: 24
Registriert: 21.07.2009 20:52

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#364 Ungelesener Beitrag von Sparrow » 29.08.2009 15:40

EdmundBlackadder hat geschrieben: Simap läuft auf 64bit Linux 15% schneller.
Ich wünschte ich könnte das bestätigen :-(

Bei mir läuft unter Linux 64bit alles langsamer als unter WinXP 32bit. Einzig Rosetta hält in etwa seine Geschwindigkeit. Aber QMC und SIMAP verlieren stark an Geschwindigkeit. Für eine SIMAP WU brauche ich jetzt 68 statt 53 Minuten, das bedeutet 28% länger. Bei QMC geht es auch in diese Richtung.

Auf der Startseite von SIMAP steht unter "Software Status", dass für Linux die Version 5.11 aktuell ist. Verwenden tut er bei mir aber 5.10. Ist das bei euch auch so?
Meldung aus dem BOINC Manager:
Sa 29 Aug 2009 16:01:49 CEST|boincsimap|Started download of simap_5.10_x86_64-pc-linux-gnu

Benutzeravatar
X1900AIW
TuX-omane
TuX-omane
Beiträge: 2967
Registriert: 05.01.2008 16:34

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#365 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 29.08.2009 15:49

Man beachte die untertischig vorbereitete Schlauchrolle für spätere Wasserkühlung, Modell Gardena Superflow, heheheh :biggrin8: ... alles läuft über einen einzigen Switch und eine FritzBox per WLAN-Anbindung (meckert ruhig, s.u. das hat System :lol: ). Stromaufnahme liefere ich nach, sobald die Verkabelung etwas aufgeräumt ist.

Bild Bild

Aus der Rudelhaltung von Crunchrechnern ist bekannt, daß Vielfalt der Gehäuseformen intensive Netzwerkverbindungen fördert, sich unterschiedliche CPUs (auf unterschiedlichen Taktraten) wohler fühlen, weniger Konkurrenzkämpfe führen und insgesamt der Output spürbar ansteigt, verschiedenfarbige Netzwerkkabel steigern die wahrgenommene Individualität und verleiten die Komponentenkonglomerate zu Höchstleistungen. Bei homogenen Zusammenstellungen wurden bei Vergleichsobjekten Tendenzen zur Durchschnittsleistungen beobachtet, Diversität hingegen entwickelt ein konstruktives Eigenleben, begrenzt durch überschaubare DSL- und Stromverbindungen versteht sich eine örtliche Rechengruppe nach nur wenigen Tagen als Überlebens- und Schicksalsgemeinschaft, die ihre knappen Ressourcen (Strom, Funknetz, kühle Luftzufuhr) auf optimale Weise zu nützen vermag. Eine direkte Konfrontation der Kommunikationsschnittstellen ist zu vermeiden, gleichwie der Atem- äh ... Luftstrom ungehindert fließen können soll. Ausreißer, Sonderlinge und Anwandlungen von Exzentritratrallalatrizität müssen hingegen eingehend observiert und ggf. per Undervolting und Lüftermontage neue Grenzen gesetzt werden (aus: DC-Knigge, Wohlbefinden und Glücklichsein von Rechenkisten).

Noch auf Bild
Zusammenkommen ist ein Beginn, Zusammenbleiben ist ein Fortschritt, Zusammenarbeiten ist ein Erfolg.
Henry Ford

quadgrid
PDA-Benutzer
PDA-Benutzer
Beiträge: 35
Registriert: 23.08.2008 20:28

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#366 Ungelesener Beitrag von quadgrid » 29.08.2009 16:34

@X1900AIW,

schön, das nenne ich mal eine feine Cruncherfarm. Der Luftstrom geht in Raum. Da haben es die Krabbeltiere schön warm im Winter. Ich hoffe, deine Frau sieht Dich ab und zu nochmal, außerhalb des Kellers. :D
Danke für die Bilder.

Gruß Ralf

Benutzeravatar
EdmundBlackadder
Task-Killer
Task-Killer
Beiträge: 784
Registriert: 20.02.2008 17:56

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#367 Ungelesener Beitrag von EdmundBlackadder » 29.08.2009 17:15

Sparrow hat geschrieben:
EdmundBlackadder hat geschrieben: Simap läuft auf 64bit Linux 15% schneller.
Ich wünschte ich könnte das bestätigen :-(
Bei mir läuft unter Linux 64bit alles langsamer als unter WinXP 32bit. Einzig Rosetta hält in etwa seine Geschwindigkeit. Aber QMC und SIMAP verlieren stark an Geschwindigkeit. Für eine SIMAP WU brauche ich jetzt 68 statt 53 Minuten, das bedeutet 28% länger. Bei QMC geht es auch in diese Richtung.
Auf der Startseite von SIMAP steht unter "Software Status", dass für Linux die Version 5.11 aktuell ist. Verwenden tut er bei mir aber 5.10. Ist das bei euch auch so? Meldung aus dem BOINC Manager:
Sa 29 Aug 2009 16:01:49 CEST|boincsimap|Started download of simap_5.10_x86_64-pc-linux-gnu
Ja. Ich habe zuerst dem planet3dnow Forum und Wiki geglaubt. Meine Erkenntnis jetzt: Simap ist auf Linux 64bit arschlangsam. Ich prüfe jetzt noch Linux 32bit. Zum Glück listet Simap die Laufzeiten von WUs für 30 Tage auf. Ich mache später mal eine Tabelle dazu.
So oder so muss ich X1900AIW meinen 2. Platz überlassen. Hat einfach mehr im Keller stehen. "Schatz, lass nur, ich hänge die Wäsche gerne im Keller auf!" Sie kommt nach 4 Stunden in den Keller um nachzusehen. Wäschekorb steht voll neben den PCs, während Ihr Mann am SIMAP frickelt. "Äh, Schatz, die Wäsche ist jetzt trocken!" :rofl:
Verschenke 2 Stück Lenovo T400 (Screen defekt) 4GB Laptops mit Dockingstation und 17" Monitor.
Ritschie hat geschrieben:Ich will ja nicht nur für Credits rechnen, sondern 'nen sinnvollen Beitrag leisten.

gardenone

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#368 Ungelesener Beitrag von gardenone » 29.08.2009 17:55

Die Wasserkühlung ist das beste! LoL
:D

Du hast aber auch gar kein Vertrauen in die Technik - was soll denn da abfackeln?

Die Lüfter zur Raumseite sind dann wohl der Wäschetrockner - die Leinen werden noch davor gezogen und die Wäsche wird schön durchgeblasen. Soll einer sagen DC verbrauche unnötig Energie.
Must halt nur schön gleichmäßig Wäsche waschen damit die Leinen immer schön voll sind, am besten noch für die Nachbarn mit damits keinen Leerlauf gibt.
:wink:


@Sparrow:
Da isser ja wieder - ich hatte Dich schon vermißt!
Hoffentlich kannst Du noch genug Futter für Deinen Rechner ziehen.

Benutzeravatar
X1900AIW
TuX-omane
TuX-omane
Beiträge: 2967
Registriert: 05.01.2008 16:34

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#369 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 29.08.2009 18:02

:tongue: in Abwandlung von Mundstuhl: mein Keller ist stärker als deine Garage...
Boah, ist es hier kalt Bild, gestern noch bin ich von ausblasenden Lüftern weggerückt, heute suche ich Wärmespender, meine Forumsaktivitäten werden ab sofort eingeschränkt, morgen werden die beiden 260 GTX hochgetaktet und zumindest die 9800GX2 wieder eingebaut (wo hab ich die eingegraben ?), ein einziger Rechner (im Bild ganz rechts) bläst mehr als warme Luft aus, dachte von der Wand her kühlt er von alleine, hm, das Netzteil unten ist von außen fast kalt, da steckt der Q6700@3,3 GHz drin, das kommt´s her. Am ersten Tag kann ich schon sagen, es hat sich gelohnt, alles beieinander zu haben, zum Tippen ist aber kaum Platz, naja.

Bild
EdmundBlackadder hat geschrieben:Meine Erkenntnis jetzt: Simap ist auf Linux 64bit arschlangsam. Ich prüfe jetzt noch Linux 32bit. Zum Glück listet Simap die Laufzeiten von WUs für 30 Tage auf. Ich mache später mal eine Tabelle dazu.
Was mir aufgefallen ist: langsamere Rechner (CPU run time) bekommen mehr Punkte, kann das sein ? Dieser (112168, Q6600@2,4GHz, Vista/64) bekommt mehr gutgeschrieben als dieser (154127, Q6700@2,66, Linux/64). Linux/32 habe ich leider nicht zum Vergleichen.
Zusammenkommen ist ein Beginn, Zusammenbleiben ist ein Fortschritt, Zusammenarbeiten ist ein Erfolg.
Henry Ford

Sparrow
Mikrocruncher
Mikrocruncher
Beiträge: 24
Registriert: 21.07.2009 20:52

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#370 Ungelesener Beitrag von Sparrow » 29.08.2009 19:11

X1900AIW hat geschrieben: Was mir aufgefallen ist: langsamere Rechner (CPU run time) bekommen mehr Punkte, kann das sein ? Dieser (112168, Q6600@2,4GHz, Vista/64) bekommt mehr gutgeschrieben als dieser (154127, Q6700@2,66, Linux/64). Linux/32 habe ich leider nicht zum Vergleichen.
Ich denke da täuschst du dich. Die haben doch beide für die bis zum 27.08. geschickten WUs etwa 30 bis 40 Credits bekommen. Die "normalen" WUs, die es ab gestern wieder gibt, gehen schneller und bringen nur ca. 20 Credits.

Sparrow
Mikrocruncher
Mikrocruncher
Beiträge: 24
Registriert: 21.07.2009 20:52

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#371 Ungelesener Beitrag von Sparrow » 29.08.2009 23:00

Oh, hoppla. Vielleicht muss ich mich revidieren was die SIMAP-Performance unter Linux 64bit angeht. Ich sehe gerade dass ich gut 30 Credits für die simap WUs bekommen habe. Wenn mich nicht alles täuscht, habe ich letzten Monat für die simap WUs nur ca. 20 Credits bekommen. Für die hmmer WUs gab es glaube ich ca. 30 Credits, die haben aber auch länger gedauert. Also entweder es gibt jetzt einfach mehr Credits als letzten Monat, oder die simap WUs sind aufwändiger. Das würde die verlängerte Bearbeitungszeit natürlich erklären...

Benutzeravatar
EdmundBlackadder
Task-Killer
Task-Killer
Beiträge: 784
Registriert: 20.02.2008 17:56

Re: Simap hat wieder sporadisch Arbeit

#372 Ungelesener Beitrag von EdmundBlackadder » 29.08.2009 23:25

Die aktuellen WUs sind nach meiner Auffassung noch nicht die SIMAP. Siehe auch Projektnews. Die SIMAP sind in Warteschlange. Deshalb ist es schlecht, diesen Monat mit vergangenen Monaten zu vergleichen. Ich kann bald die Tabelle erstellen. Daten der letzten 36h habe ich gesammelt. Im Planet3D Forum wird eigentlich nur behauptet, die SIMAP-hmmer-WUs würden auf Linux 64bit schneller sein. Diese WUs sind jedoch selten. Vieleicht 5% der Masse. Nur deshalb würde sich eine Umstellung nicht lohnen. Es sei denn, man löscht alle anderen WUs. Aber das wurde woanders bereits als unsportliches Verhalten zu Recht gerügt.
Leider reichen meine Daten noch nicht, um Laufzeiten zu vergleichen, da unterschiedlichste WUs berechnet wurden. Ich lasse jetzt auf je 1 Kern parallel rechnen.
Bisherige Erkenntnis: E8600 @ 4 GHz: Linux x64 33% mehr Credit bei nur 5% mehr Laufzeit ggü. XP x64. Die werden doch nicht Linux bevorzugen? :uhoh: Ich will schnellere Wissenschaft, nicht mehr Punkte! :cry2: :cry3: :crying:
Verschenke 2 Stück Lenovo T400 (Screen defekt) 4GB Laptops mit Dockingstation und 17" Monitor.
Ritschie hat geschrieben:Ich will ja nicht nur für Credits rechnen, sondern 'nen sinnvollen Beitrag leisten.

Zurück zu „Protein- und Nukleinsäureforschung“