Wie lange dauert eine WU?

[Passiver Camper]

Das ist einfach

Vorher: 2.552,86 Punkte bei 92 Genen
Nachher: 2.577,73 Punkte bei 93 Genen

Das ergibt 24,87 Punkte bei einem Gen mit >120 AS

Wenn mich meine Erinnerung jetzt nicht trübt, waren das vor wenigen Tagen noch Gene mit <70 AS ?!

[Michael H.W. Weber]

Hm, Ich kann mich nur auf die von FahlogStats angegebenen Punkte beziehen. Da werden bei einer 65-68er WU immer ca. 5-7 Punkte angegeben. Irgendwas ist da faul. Gut ist, daß es alle gleich trifft. Aber ich kann bei Gelegenheit mal genauer nachhaken.

Michael.

[Patrick Keller]

Zieht euch mein GAHPunktenerator rein ... der läuft richtig, nach der original Formel
(Hab ich auch nachgeprüft)

[Passiver Camper]

@Michael:

Meinst du die FAHlog.txt? Wenn ja, wo genau würden denn die Punkte stehen? Bin da etwas ratlos bei den vielen Angaben...

Ich hatte ja bisher immer solche WUs (<70 AS), die im Schnitt etwas mehr als 27 Punkte gebracht haben. An der Punkteverteilung hat sich auch bei WUs mit mehr als 120 AS anscheinend nichts geändert, nur daß ich dafür jetzt ca. 4 mal so lange dafür rechnen muß.

Vielleicht sollten die ihr Punktesystem einmal anpassen, damit der, der mehr AS pro Gen hat, auch mehr Punkte erhält, sonst wird der Punktefortschritt quäääälend langsam und ich kann dich schließlich nicht so schnell einholen

[Patrick Keller]

Die Punkte werden anhand der Chainlength generiert mit folgender Formel:
(0.0025*chainlength*chainlength + 0.05*chainlength)*1.8
Zusäzlich gibt es für extrem große WUs auch noch nen Punktebonus ... Wahrscheinlich hängt nur wieder denen ihr Statserver ...

[Michael H.W. Weber]

Meinst du die FAHlog.txt?

Nein, ich meine einen Monitor namens FahLogStats v0.69. Allerdings scheint der laut Kellers Angaben Mist zu rechnen. Nach seiner Formel komme ich für eine 68er WU auf 26,928 Punkte. Demnach muß eine 125er WU 81,5625 Punkte haben. Wann hast Du denn die WU abgeschickt und wann die Punktezunahme kontrolliert? Du weißt ja, daß die Punkte oft erst später in den Statistiken erscheinen.

Michael.

[Passiver Camper]

Nach seiner Formel komme ich für eine 68er WU auf 26,928 Punkte. Demnach muß eine 125er WU 81,5625 Punkte haben. Wann hast Du denn die WU abgeschickt und wann die Punktezunahme kontrolliert?

Die Übermittlung der >120AS WU war heute. Heute ist noch eine mit mehr als 130 AS übermittelt worden.

Ich halte mal fest:

für die >120 24,87 Punkte
für die >130 77,95 Punkte

Gleicht sich wohl irgendwann wieder aus, wenn wieder "korrigierend" in die Statistik eingegriffen wird....hatten wir ja während des TF-Einsatzes ja auch schon mal

Ich werde auf jeden Fall für GAH weiterrechnen und bis zu einer Korrektur heißt es erst einmal: Don't Panic...

[Michael H.W. Weber]

Kannst Du hier bitte den "header" des "logs" von der 120er WU posten, damit die genaue Bezeichnung klar ist? Die WU ist von Stanford ganz offensichtlich falsch bepunktet. Gut, daß Du das bemerkt hast. Sobald Du die Infos hier postest, werde ich es in Stanford melden.

Michael.

[Passiver Camper]

Bin mir jetzt nicht ganz sicher, ob das die hier ist oder eine andere auf meinem Firmenrechner (da komme ich vor Montag jetzt nicht ran).

[09:42:58] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[09:42:58]
[09:42:58] Proj: work/wudata_05
[09:42:58] Finding work files
[09:42:58] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[09:42:58] Checking frame files
[09:42:58] - Couldn't open work/wudata_05.chk
[09:42:58] Starting from initial work packet
[09:42:58]
[09:42:58] Updating shared core-client information
[09:42:58] - Writing "work/wudata_05.key": (overwrite)successful.
[09:42:58] Key file to update shared file: work/wudata_05.key
[09:42:58] keyfile: 0 122 200 15 2 1 0
[09:42:58] Protein: Des2/pdb1qto.32.spa
[09:42:58] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[09:42:58] - Dynamic steps required: 120000
[09:42:58]
[09:42:58] Printed current.prm
[09:42:58] Writing local files:
[09:42:58] - Writing "work/wudata_05.key": (overwrite)successful.
[09:42:58] - Writing "work/wudata_05.xyz": (overwrite)successful.
[09:42:58] - Writing "work/wudata_05.prm": (overwrite)successful.
[09:42:59] Starting design engine
[09:42:59] [SPG] project name: work/wudata_05.
[09:42:59] [SPG] 1 0
[09:42:59] [SPG] Initializing protein design engine
[09:42:59] [SPG] seed = 0
[09:42:59] [SPG] Initialization complete
[09:42:59] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 122
[09:42:59] [SPG] Writing current.xyz
[09:42:59] [SPG] Preprocessing . . .
[09:42:59] [SPG] 122 positions in protein
[09:44:47] [SPG] Preprocessing complete
[09:44:47] Iterations: 0 of 600
[09:44:48] Finished

Da ich noch eine recht übersichtliche Anzahl von Genen in meiner Statistik habe, kann man es eventuell über diese Angaben auch nachvollziehen, welches Gen es letztendlich ist (ich denke mal, daß irgendwo die Anzahl der AS herauszulesen ist). Wenn mir jemand sagt, wo man diese Infos sehen kann, kann ich mit dem bereits hier erwähnten Berechnungsschema einmal die Punkte überprüfen.

[Michael H.W. Weber]

Bin mir jetzt nicht ganz sicher...

Also sicher mußt Du Dir da schon sein. Sonst macht es keinen Sinn.

[09:42:59] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 122
[09:42:59] [SPG] Writing current.xyz
[09:42:59] [SPG] Preprocessing . . .
[09:42:59] [SPG] 122 positions in protein

Dies gibt Dir die Anzahl an Aminosäuren in dem Protein an.

Michael.

[Dennis Kautz]

Ich hab gerade bei GAH eine mit chainlength=146 abgegriffen... Zeit auf meinem Celeron 1700: 130min/Sequenz

[Hydrox]

chainlegth: 141
CPU: 1,5GHz Pentium-M
Dauer: ca. 70min/sequenz