Bester RMSD mit 3.731695 von Huraxprax !!!

[M. Franckenstein]

oooh, sorry ich habe auf edit gesrückt und nicht auf zitat (glaube ich) ... wird wohl so gewesen sein !!!! ist mir aber nicht aufgefallen .... habe versucht das rückgängig zu machen Michael!!!! Das war wirklich keine Absicht.... sorry (meine Antwort war ja auch nicht soooo ernst gemeint!!!!)

Ich hoffe das ist nicht zu schlimm jetzt!!!!

JE1SUS

[bluumi]

@Je1sus
jo, sowas ist mir auch schon mal passiert ..

Ich hatte damals aber mehr Glück als Du.
Du darfst nun Michael eine ganze Kiste Bier und eine Kiste Zigarren spenden...

[huraxprax]

wie schon vermutet war es zu schön um wahr zu sein, deswegen auch mein "huch" am Anfang.
Peinlich ist mir das aber nicht, solang ich noch nicht weiß was und welcher Rechner das war kann man das noch nicht auf meinen rechner und 67 mhz zuviel schieben.
Und Cheating war das definitiv nicht.
Howard hat mir eine mail geschrieben dazu, dann werden wir näher sehen woher das kommt.

[Michael H.W. Weber]

Da löscht der Bursche doch meine Beiträge... köstlichst. Ich schreibe mir die Finger wund und der... -click- ...und weg ist's. Mein schöner "rampage" gegen "overclocking" bei FAH, GAH, DF und die "docking" Programme... Naja... ich werd's überleben! (obwohl 'n Kasten Bier auch nicht schlecht wäre, muahahahaha...)

Michael.

[M. Franckenstein]

das war wirklich keine absicht !!!!

[Michael H.W. Weber]

Scheint bei Benno wohl ein Problem beim Berechnen des RMSDs gegeben zu haben udn das ist offensichtlich schon anderen passiert.

Für den genauen Zusammenhang, schaut bitte hier: http://bane.free-dc.org/forum/showthrea ... eadid=1857

Michael.

Zitat:
"That is exactly how I compared it actually (SwissPDB), good guess So yes, it takes me 2 minutes to check, although usually visual inspection is enough even since a 3.7A structure should look VERY similar to the native structure, both of which are viewable with Cn3D from the stats page.

Anyhow, it is indeed difficult, I have found, to code software and account for all the possible things that can go wrong when you account for faulty RAM, cosmic rays, overclocking, CPU bugs and so on. Thanks to users I have put in warning/error messages that catch many of these problems, such as the bzip2 decompression errors, or things like that that occur with bad RAM. Nevertheless, its not perfect. For example, besides the 3.7A structure, there were 2 0A structures uploaded in the 3 billion or so we've sampled so far of this protein. Again, this is because the routine which computes RMSD failed on two users' machines, once. Why this occurs is almost impossible to say. I have used the routine myself thousands or even millions of times, and never had a problem. But when you scale up to billions of times, one or two errors once in a while become probable, rather than impossible, it seems. The RMSD calculation is a complex matrix computation using what's called SVD. It has to take into account many rare special cases (like when certain matrix elements work out to be exactly zero, etc.) so it is quite possible that 1 in a billion times there is a case which fails.
IF it does not happen repeatedly to the same user, I would not worry too much about it as it is very easy to identify and fix."
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Howard Feldman