neues BOINC Projekt: SIMAP@home

[yoyo]

Hallo,
bei SIMAP@home http://217.160.138.71/wiki/index.php?title=SIMAP%40home können jetzt auch Accounts angelegt werden. Leider ist mir nicht klar, was das Projekt berechnet?

yoyo

[Michael H.W. Weber]

Anhand der URL kann man allerdings entnehmen, daß es sich um ein deutsches Projekt der TU München handelt. Habe mich vorab mal um einen Account bemüht...

Michael.

[SpeedKing]

Aufgrund irgendwelcher Umstellungen gibts bis Anfang September erstmal keine WUs. Anmelden funktioniert aber.

[Hermes]

Das Projekt leidet an dem typischen Boincstandardinstallationsproblem:

Es gibt keinen Hinweis, geschweige denn eine vernünftige Erklärung, was die tun wollen. Bei SIMAP gibt es noch nicht einmal ein Forum in dem man Fragen könnte. Aber bei Boincprojekten ist so was ja nicht nötig um Rechenkraftspender anzuwerben, da es genügend Leute gibt, die sich ohne nachzudenken auf alles stürzen, was unter Boinc läuft.

mfG
Stephan

[Dennis Kautz]

Anhand der URL kann man allerdings entnehmen, daß es sich um ein deutsches Projekt der TU München handelt.

Frag doch mal dein Bruderherz, ist ja immerhin seine Uni

Account hab ich, im Team bin ich auch...

[SpeedKing]

Aber Hermes, dafür gibts doch in unserem Wiki eine Seite zu SIMAP@home, auf der sich ein Link auf eine Seite findet (http://mips.gsf.de/services/analysis/simap), auf der alles erklärt wird...

[nightfolder]

...um alle Diskussionen zu dem Projekt etwas zu entschärfen:

SIMAP ist ein Projekt der TU München, genauer gesagt eine Kooperation zwischen dem Lehrstuhl für Bioinformatik der TUM am Wissenschaftszentrum Weihenstephan (WZW) und der GSF. Wenn Ihr wollt, kann ich gerne in Zukunft bzgl. des Projekts die Kommunikation mit den Projektbetreibern übernehmen - ich kenne die Leute persönlich, weil ich und auch vollpreller am WZW Biologie studieren. Bezüglich der Inhalte des Projektes kann ich gerne um nähere Informationen bitten.
Wegen des Anmeldeproblems habe ich bereits deren Chef per email hingewiesen und von einem seiner Mitarbeiter diese Antwort erhalten:

danke fuer Dein feedback und die Bereitschaft bei SIMAP mitzurechnen.
Der Fehler ist neu und war mir bisher nicht bekannt. Es liegt offenbar an neuen Apache- und PHP-Versionen, mit denen BOINC nicht mehr korrekt funktioniert. Momentan liegen keine Workunits auf dem Server, so dass wir es selbst noch gar nicht bemerkt haben. Wir stellen momentan die SIMAP-Hitdaten auf ein neues Format um und haben daher die Berechnung unterbrechen muessen. Die Umstellung ist nun geschafft und wir richten gerade die Software entsprechend ein. Die Berechnungen via Boinc werden mit einem neuen compute-client im September wieder anlaufen. Ich stelle vorher auch die Boinc-Server-Software auf die aktuelle Version 4.45 um, damit sollten die Anmeldeprobleme dann behoben sein.

Sobald die updates erledigt sind, informiere ich Dich per e-Mail.

Ich kann auch noch nicht genau abschätzen, ob das Projekt selbst vielversprechend ist - falls ja, sollte man dieses als deutsches Projekt aber kräftig unterstützen.

Gruss

Alex

[vfrey]

SIMAP ist ein Projekt der TU München, genauer gesagt eine Kooperation zwischen dem Lehrstuhl für Bioinformatik der TUM am Wissenschaftszentrum Weihenstephan (WZW) und der GSF. Wenn Ihr wollt, kann ich gerne in Zukunft bzgl. des Projekts die Kommunikation mit den Projektbetreibern übernehmen - ich kenne die Leute persönlich, weil ich und auch vollpreller am WZW Biologie studieren.

...

Ich kann auch noch nicht genau abschätzen, ob das Projekt selbst vielversprechend ist - falls ja, sollte man dieses als deutsches Projekt aber kräftig unterstützen.

na, klingt doch wie ein potenzielles neues Lieblingsprojekt...

[Michael H.W. Weber]

Herrlich - ich kenn einige Leute von der Uni in Freising und werde mich in dieses Projekt voll reinhängen. Klingt auch sehr interessant, was die dort vorhaben. Es geht um die Einordnung neu gefundener Proteine im Vergleich zu bekannten Proteinsequenzen. Dabei konzentriert man sich anscheinend vornehmlich auf solche Proteine, die nur geringe offensichtliche Homologien zu bekannten anderen Proteinen haben. Diese einzuordnen, erfordert einen höheren Sequenzanalyse- und damit Rechenbedarf. Es soll eine Datenbank entstehen, die sämtliche Informationen bereitstellt, ohne daß man selbst den Vergleich einer Proteinsequenz mit bekannten Proteinen - wie bislang - von Hand initiieren und entsprechend der Aufgabenkomplexität auf ein Ergebnis warten müßte. Account habe ich bereits - meine Clients warten auf WUs.

Ich würde sogar so weit gehen, hier von Anfang an einen Taskforceeinsatz vorzuschlagen - sobald klar ist, ob der Client stabil läuft. Das hätte den Vorteil, daß wir uns gleich von den restlichen Teams absetzen und den Betreibern schnell ein Feedback liefern können. Es ist außerdem ein deutsches Projekt und sollte daher bevorzugt behandelt werden angesichts der Tatsache, daß die meisten anderen ja leider aus England bzw. Amerika stammen. Ich weise noch drauf hin, daß auch Evolution@home aus Freising stammte.

Michael.

[aalerich]

Ich bin zwar ab Sonntag wieder weg und falle daher vorläufig aus, aber für ein wirklich sinnvolles deutsches Projekt aus der Medizinrichtung könnte auch ich mich begeistern. Und ich bin mir sicher, daß man damit auch erheblich einfacher Werbung für Rechenkraft machen kann.
Kurzum: Sobald als möglich werde ich dabeisein.

Mit freundlichen Grüßen
aalerich

[yoyo]

In welcher der wiki Projektkategorien (http://217.160.138.71/wiki/index.php?ti ... kategorien) soll SIMAP nun ein?
yoyo

[Dennis Kautz]

In welcher der wiki Projektkategorien (http://217.160.138.71/wiki/index.php?ti ... kategorien) soll SIMAP nun ein?
yoyo

Würd auf die Beschreibung von Bioinformatik passen, denk ich