offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

[Matthias Lehmkuhl]

Ich rechne gerade an folgender WU
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330488
Die üblichen 30 sec. habe ich schon gut überschritten, aber für 5 erfolgreiche results reicht es nicht mehr.
Fehler Zu viele Fehler (evtl. ein Bug)

Kannst Du die trotzdem validieren lassen?

OK, jetzt hat der den ersten Snapshot (nach 10 min.) auch noch geschafft.

[ChristianB]

Lass die laufen ich setze die WU mal zurück dann validieren die auch.

[Uwe Sänger Herzke]

Lass die laufen ich setze die WU mal zurück dann validieren die auch.

Hättest Du das nicht früher sagen können? Dann hätte ich vorhin nicht meine 5h Gesamtrechenzeit weggeworfen, die nicht mehr validierbar erschienen.
Na ja, shit happens, auf zu neuen Ufern, äääh Wutzen

Edith fragt:
Kannst Du das mit den beiden aus diesem Beitrag auch machen?

Bei der hier waren Norman und ich erfolgreich, aber die Wutz ist wegen zu vielen Fehlern invalidiert worden. Tim rechnet noch vergeblich.

Edith sagt: bei der hier desgleichen.

Die sind sonst auch für'n Hintern.

[ChristianB]

Habe ich noch geändert. Damit verabschiede ich mich aber schonmal ins vorgezogene Wochenende. Wir lassen die jetzt mal alle durchlaufen und am Montag schauen wir mal was sich ergeben hat.

[Nemac]

Ich hab auf der Win-Kiste 2WUs heile abgeliefert

mal sehen wies weiter geht

[Norman]

was ist mit der ?
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330483
soll ich die abbrechen ? ich bin da fleissig am knuspern

edit: ok, ich breche sie ab.. scheint sinnlos zu sein

[[SG-FC]shka]

Von den ersten 44 bei mir haben 20 nen Fehler (19 * nach 30sek, eine nach 12k Sekunden) und 20 sind valide, 4 liegen im Pending.

Skeptisch bin ich bei der hier http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330523, die hat nach 4h 4,75% und eine ähnliche Laufzeitschätzangabe wie die, die mein Vorposter abgebrochen hat (gut 3 Tage).
Soll ich die laufen lassen oder besser kicken?

[Uwe Sänger Herzke]

Meine aktuelle Wutz scheint auch ein Kernelupdate mit dem dann üblichen, oben schon genannten "sudo /etc/init.d/vboxdrv setup" einschließlich 5-minütigem Warten und vergeblichem Startversuch mit fehlerhafter VBox überstanden zu haben.
Sie läuft jedenfalls wieder, und hier sind die Meldungen aus BOINC:

Code: Alles auswählen

Fr 13 Sep 2013 06:42:40 CEST | RNA World | [task] ACTIVE_TASK::start(): forked process: pid 4703
Fr 13 Sep 2013 06:42:40 CEST | RNA World | [task] task_state=EXECUTING for cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 from start
Fr 13 Sep 2013 06:42:40 CEST | RNA World | Restarting task cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 using cmsearch3 version 101 (vbox64) in slot 4
Fr 13 Sep 2013 06:43:56 CEST | RNA World | [task] Process for cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 exited, status 0, task state 1
Fr 13 Sep 2013 06:43:56 CEST | RNA World | [task] task called temporary_exit(300.000000)
Fr 13 Sep 2013 06:43:56 CEST | RNA World | [task] task_state=UNINITIALIZED for cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 from temporary exit
Fr 13 Sep 2013 06:52:04 CEST | RNA World | [task] ACTIVE_TASK::start(): forked process: pid 5924
Fr 13 Sep 2013 06:52:04 CEST | RNA World | [task] task_state=EXECUTING for cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 from start
Fr 13 Sep 2013 06:52:04 CEST | RNA World | Restarting task cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_1379006666_29_1 using cmsearch3 version 101 (vbox64) in slot 4

Mal sehen, wie das dann in der stderr aussieht.

[Dunuin]

Sagt ihr bescheid wenn es neue WUs gibt? RNA holt sich hier nicht automatisch WUs ab. Da kommt immer RNA habe nicht genug Priorität, weshalb ich da dann immer extra alle anderen Projekte (bis auf WUProp) deaktivieren muss. Und das ist wieder doof wenn sich dann der Rechner langweilt, weil es keine WUs mehr für RNA gibt.

[Norman]

Von den ersten 44 bei mir haben 20 nen Fehler (19 * nach 30sek, eine nach 12k Sekunden) und 20 sind valide, 4 liegen im Pending.

Skeptisch bin ich bei der hier http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330523, die hat nach 4h 4,75% und eine ähnliche Laufzeitschätzangabe wie die, die mein Vorposter abgebrochen hat (gut 3 Tage).
Soll ich die laufen lassen oder besser kicken?

Die sieht doch noch recht gut aus. keine abbrüche oder fehler zu erkennen.
würd ich laufen lassen.

[ChristianB]

Alle WUs mit einer Paket ID <= 6330502 können abgebrochen werden. Alles was drüber ist sollte ordentlich durchlaufen. Der Rechner kann auch munter abends runtergefahren werden oder sonstwas probiert werden. Das werte ich dann nächste Woche alles aus. Bis dahin wird es keine neue Arbeit geben. Ich werde auch nächste Woche erst dazu kommen eine kleine Zusammenfassung zu den Ergebnissen des Tests zu schreiben.

[Norman]

könnte man dann den benötigten RAM bitte etwas kleiner schrauben, damit auch weniger gut bestückste systeme eine chance haben einige WU zu rechnen?
32-bit variante evtl. auch noch testen ?