neues Projekt unter WCG: Nutritious Rice for the World

[Dennis Kautz]

Hat WCG gerade ein Problem mit Nutritious Rice:

24.11.2008 11:39:21|World Community Grid|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 125025 seconds of work, reporting 0 completed tasks
24.11.2008 11:39:26|World Community Grid|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
24.11.2008 11:39:26|World Community Grid|Message from server: Server can't open database

yoyo

Das passiert ab und zu, aber normalerweise klappts dann beim nächsten Versuch.

[CurlyM]

Das Projekt wird nach Angaben von WCG-Tech "Viktors" etwas heruntergefahren, da sich die Forscher schwer tun, genügend Speicherplatz für die berechneten WUs bereit zu stellen.

[laguna]

Das Projekt wird nach Angaben von WCG-Tech "Viktors" etwas heruntergefahren, da sich die Forscher schwer tun, genügend Speicherplatz für die berechneten WUs bereit zu stellen.

Wie jetzt?
Sind Festplatten neuerdings so teuer geworden?

[scsimodo]

Sind Festplatten neuerdings so teuer geworden?

Ich denke wir reden hier nicht von einer externen Aldi-Super-Duper-1TB-Festplatte, sondern von ausgewachsenen RAID-Systemen mit ordentlichen Platten. Ja, damit bist Du schnell bei ein paar tausend Euro. Und gesichert will sowas auch noch werden, da kostet die Hardware auch nochmal teuer Geld.

[Michael H.W. Weber]

...darueber sollte man sich natuerlich vorher im Klaren sein.

Michael.

[Dennis Kautz]

...darueber sollte man sich natuerlich vorher im Klaren sein.

Michael.

DDDT ist immer noch inaktiv, was dazu geführt hat, dass Rice jetzt schon viel weiter fortgeschritten ist, als eigentlich geplant. Da hat man sich wohl ein wenig verkalkuliert.

[Basler]

Sind Festplatten neuerdings so teuer geworden?

Ich denke wir reden hier nicht von einer externen Aldi-Super-Duper-1TB-Festplatte, sondern von ausgewachsenen RAID-Systemen mit ordentlichen Platten. Ja, damit bist Du schnell bei ein paar tausend Euro. Und gesichert will sowas auch noch werden, da kostet die Hardware auch nochmal teuer Geld.

Naja, hoffentlich schnallen die auch, dass RAID zwar schön ist, aber mit Backup-Strategien absolut nichts am Sträusschen hat, wenn man seine Systemen vernünfig aufsetzt.

Pascal.

[DDD]

Hallo!
Weiß einer, warum der Bildschirmschoner so stark ruckelt? Bei mit bewegt er sich zw 0.3 und 0.9 FPS

PS: Ja, ich hab ne Grafikkarte drin

[X1900AIW]

Willkommen im Forum !

Hast du die Bildruckler nur bei WCG und speziell diesem Projekt ? Andere Projekte auch ?

[DDD]

Bei yoyo@home (evo@home) hab ich durchgehend 30fps, und ein anderes WCG-Projekt hab ich grad nicht am laufen

[CurlyM]

Project Status Update vom 08.04.2009!

http://protinfo.compbio.washington.edu/rice/status.html

Apr 8, 2009 - We have begun to analyze the protein models generated by Nutritious Rice for the World volunteers. The next step is to use sophisticated methods to select the top protein models for each gene. This will let us focus on a more manegable number of protein structures from the billions generated so far. Rice proteins are very different from what has been previously studied and only 1% of the proteins we're working on have segments which are significantly similar to proteins of known structure. That is why computer modeling is necessary and why this project is important. It also means that we have a lot of hard work ahead of us still!

In general, when proteins have similar amino acid sequences, they also have similar structures. The small number of cases where at least part of the protein sequence is similar to one where the structure is known are thus very useful. We have a good idea what those regions of the protein structure model should look like and this allows us to optimize and validate the tools that we use to pick the best models. That is what we are currently doing. Once we finish this, we will start processing the data and publish the best structures for each gene online.

[CurlyM]

Project Status Update vom 15.09.2009!

http://protinfo.compbio.washington.edu/rice/status.html

Sep 15, 2009 - Most of our efforts in the fast few months have been spent trying out to tease more domains from the rice protein/proteome to increase the size of the project. These domains have been packaged into work units and are now crunching. So we have raised the number of protein structure predictions from roughly 40,000 initially to about 65,000 when all the larger sequences have been processed. Of these, we have roughly 35,000 completed so we still have about 30,000 to go (so it looks as though we're about halfway done now).

The logic and goal here is that the more comprehensive picture of the individual protein domains in rice we have, the more we can use that to inform us about the structures of other unknown domains in rice as well as other food crops. That is, partial information is much better than zero information. This enables us to obtain a better understanding of the pathways involved at atomic level detail.