WCG Projektstatus

[Michael H.W. Weber]

Und hier ist die URL zum Artikel: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/quer ... med_docsum

Michael.

[yoyo]

Kann das mal einer für Nicht-Biologen übersetzen?
yoyo

[Dennis Kautz]

Help Cure Muscular Dystrophy hat begonnen, den letzten Batch Workunits für Phase I zu versenden. Es wird erwartet, dass dieser Batch etwa 20 Tage dauert, wie die vorhergehenden. Im Anschluss werden nur noch WUs versendet, die aufgrund nicht korrekter Ergebnisse erneut berechnet werden müssen. Mit dem Ende von Phase I wird allen, die HCMD als einziges Projekt aktiviert haben, empfohlen, auch Arbeit von anderen Projekten zu akzeptieren. Dies könnt Ihr in eurem Profil machen.

http://www.worldcommunitygrid.org/forum ... stpage=yes

[Dennis Kautz]

Das World Community Grid hat Phase I von Help Cure Muscular Dystrophy abgeschlossen. Es wird in Kürze einen Newsletter mit weiteren Informationen, unter anderem zur später stattfindenden Phase II geben.

http://www.worldcommunitygrid.org/forum ... read=14142

Damit verbleiben für's erste noch folgende aktive Projekte auf dem WCG:

* FightAIDS@home
* Human Proteome Folding Project (Phase II)
* Genome Comparison

Abgeschlossen wurden:

* Help Cure Muscular Dystrophy (Phase I)
* Help Defeat Cancer
* Human Proteome Folding Project (Phase I)

Ein weiteres Krebsdiagnoseprojekt soll noch im dritten Quartal 07 online gehen.


Anmerkung: Phase I und II sind im Wiki nicht getrennt, daher dort die Projekte bitte nicht auf "beendet" setzen!

[Michael H.W. Weber]

Ich habe in den letzten vier Wochen auch noch geholfen, die letzten HCMD-WUs abzuarbeiten. Hatte mich schon gewundert, warum die Clients vor wenigen Tagen sämtlichst auf "pause" gingen...

Michael.

[Dennis Kautz]

Gerüchten zufolge wird demnächst ein Projekt gegen Dengue-Fieber starten - etwa zeitgleich mit dem nächsten Krebsprojekt im späten Sommer. Phase II von HCMD wird erst Anfang nächsten Jahres beginnen.

http://www.worldcommunitygrid.org/forum ... read=14083

[Dennis Kautz]

Hier nun (aus einem Newsletter des WCG anlässlich der Beendigung von HCMD Phase 1) eine offizielle Verlautbarung zur nahen Zukunft:

We still need your help with other ongoing projects! World Community Grid continues to run the FightAIDS@Home, Genome Comparison, and Human Proteome Folding - Phase II projects. In a few months, we'll be launching new projects for cancer, dengue fever, and climate prediction. All of these important projects need your computer time.

Es wird also in wenigen Monaten neue Projekte gegen Krebs, Dengue-Fieber und zur Klimavorhersage geben.

[Dennis Kautz]

Genome Comparison nähert sich dem Projektende:

Thanks to our members for their generous contribution to the Genome Comparison project which is very near completion. This weekend we expect to see the steady outflow of work units on this project go down to a trickle as we finish the last remaining batches of work. Within about 3 weeks, all of the final results should be in and returned to the researchers and at that time no further work units will need to be sent for this phase of the project. However, there may be some future point in time at which we revive this project when more sequenced genes become available for comparison.

We will soon be sending a news email about this project's completion along with news about other recent project completions and provide more information about future projects launching soon on World Community Grid.

Some of you who have set your preferences to only contribute to this project will find that your agent may go into a paused state. If that is the case, we encourage you to change your settings to contribute to the other projects. At some point we may reset the preferences for users contributing only to the Genome Comparison project back to the default of contributing to all projects, so that their agents do not become totally idle.

The researchers will be providing more information about this project's results soon. Thank you again for your spare computer cycles which have made this project possible!

https://secure.worldcommunitygrid.org/f ... read=14904

Die letzten Workunits werden werden in naher Zukunft verschickt - bis die fertigen WUs zurück sind, rechnet man mit ca. drei Wochen. In Kürze wird es einen Newsletter zur Beendigung von GC geben.
Wer Genome Comparison als einziges Projekt aktiviert hat, sollte dies nun ändern, sonst besteht die Gefahr, dass die Computer ohne Arbeit dastehen.

[Dennis Kautz]

In einem Newsletter meldet das World Community Grid die Beendigung des Projekts Genome Comparison, sowie das Erreichen der Marke von 100.000 CPU-Jahren!

[Dennis Kautz]

Es gibt Neuigkeiten von den Wissenschaftlern des Human Proteome Folding Project:
http://www.worldcommunitygrid.org/forum ... read=15221

Hello crunchers,

We've made significant progress on many fronts of the HPF project in the last few months. Much of the progress is a result of the grid continuing to grow (thanks to you guys and girls) and more and more work units being returned at a break-neck speed. biggrin A few tests still need to be run but it appears the FIRST folding portion of the malaria dataset is complete. This is a fantastic achievement in the given amount of time. Gram-negative organisms are being crunched now and results from these calculations will clue researchers into the function of many functionally-unknown proteins in some of the worlds nastiest bugs. sick

While you have been hard at work so have we. Some excellent progress has been made in combining the results from the grid with the limited information we know about specific proteins. This is starting to uncover and refine the global picture of these individual proteins. Work still needs to be done however but preliminary results are promising and we'll be sure to update you with more of the details of the method in the future.

Another front we have made significant progress on is the web interface and backend of our database. Many of the advancements have been "behind the scenes" advancements so they're not as obvious to users immediately but they will be evident once the database is in full use. Lars has been hard at work refactoring the database to increase speed of querying, increasing ability in compiling result summaries of full genomes and making the database easier to maintain.

Also, Mike has been working on some of the more obvious enhancements to the web interface including a new search page which allows researchers to search by a specific organism, GO annotation or GO evidence code. These "searchables" are common to many web based data sets and therefore users will already be familiar with the layout. Also, these additions will be very useful to first time users and will allow all users to go from a set of genes they are interested in to a set of predicted functions with just a few clicks.
Search Form (note: currently only Saccharomyces cerevisiae is uploaded to the database).

Again, we appreciate all of your compute cycles and your interest in our research.

Es wäre nett, wenn jemand, er versteht, worum es geht, eine Kurzzusammenfassung auf deutsch geben könnte, damit ich's ins Wiki übernehmen kann. Mein Fachchin^H^H^englisch reicht dafür leider nicht.

[Obi]

Hello crunchers,

We've made significant progress on many fronts of the HPF project in the last few months. Much of the progress is a result of the grid continuing to grow (thanks to you guys and girls) and more and more work units being returned at a break-neck speed. biggrin A few tests still need to be run but it appears the FIRST folding portion of the malaria dataset is complete. This is a fantastic achievement in the given amount of time. Gram-negative organisms are being crunched now and results from these calculations will clue researchers into the function of many functionally-unknown proteins in some of the worlds nastiest bugs. sick

While you have been hard at work so have we. Some excellent progress has been made in combining the results from the grid with the limited information we know about specific proteins. This is starting to uncover and refine the global picture of these individual proteins. Work still needs to be done however but preliminary results are promising and we'll be sure to update you with more of the details of the method in the future.

Another front we have made significant progress on is the web interface and backend of our database. Many of the advancements have been "behind the scenes" advancements so they're not as obvious to users immediately but they will be evident once the database is in full use. Lars has been hard at work refactoring the database to increase speed of querying, increasing ability in compiling result summaries of full genomes and making the database easier to maintain.

Also, Mike has been working on some of the more obvious enhancements to the web interface including a new search page which allows researchers to search by a specific organism, GO annotation or GO evidence code. These "searchables" are common to many web based data sets and therefore users will already be familiar with the layout. Also, these additions will be very useful to first time users and will allow all users to go from a set of genes they are interested in to a set of predicted functions with just a few clicks.
Search Form (note: currently only Saccharomyces cerevisiae is uploaded to the database).

Again, we appreciate all of your compute cycles and your interest in our research.

Die (möglichst genaue) Übersetzung (bin mir bei "Gram-negative" mit der Übersetzung unsicher, weiter habe keine Ahnung was "backend of our database" und "refactoring the database" meint):

Hallo Crunsher,

Wir haben in den letzten paar Monaten Signifikante Fortschritte an vielen Fronten des HPF Projektes gemacht. Viel jenes Fortschrittes resultiert auf dem fortwährendem Wachstum des Grids (danke an euch Frauen und Männer) und es werden mehrund mehr Work Units mit halsbrecherischem Tempo zurückgesand. Einige Tests müssen noch laufen aber es scheint die ERSTE zu faltende Portion des Malaria Datensatzes ist komplett. Das ist eine fantastische Leistung für den gegebenen Zeitraum. Gramm-negative(?) Organismen sind nun berechnet und die Resultate dieser Kalkulationen werden Forschern Hinweise zu den Funktionen, vieler "Funktions-Unbekannter" Proteine, in einigen der weltweit gefährlichsten Insekten, geben.

Während Sie hart gearbeitet haben, haben wir dies ebenso. Es wurden einige exzellente Fortschritte beim kombinieren der Resultate des Grids, mit den limitierten Informationen, die wir über spezifische Proteine haben, gemacht. Dies beginnt das globale Bild dieser individuellen Proteine aufzudecken. Einige Arbeit muss jedoch noch erledigt werden, aber die einleitenden Informationen sind vielversprechend und wir werden Sie in der Zukunft mit mehr Details der Methode, auf dem Laufenden halten.

Eine weiteren Front an der wir bedeutende Fortschritte gemacht haben ist das Web-Interface und hinter(?) unserer Datenbank. Viele der Verbesserungen fanden "hinter dem Vorhang" statt, sie sind also dem Nutzer nicht sofort ersichtlich aber sie werden offensichtlich, sobald die Datenbank voll genutzt wird. Lars hat hart daran gearbeitet, die Datenbank zu entsplittern(?), um die Abfragegeschwindigkeit zu erhöhen, die Kompilierfähigkeit der Resultaten von Zusammenfassungen ganzer Genome, zu beschleunigen und die Datenbank leichter handhabbar zu machen.

Weiterhin hat Mike an einigen der deutlicher sichbaren Verbesserungen des Web-Interfaces, einschließlich eriner neuen "Such-Seite" gearbeitet, die Forschern erlaubt nach einem bestimmten Organismus zusuchen, "GO" Anmerkungen oder "GO" Beweiscode. Diese "suchbaren" sind vielen web-basierte Datensätzen ähnlich und folglich werden Benutzer bereits mit dem Layout vertraut sein. Außerdem werden diese Ergänzungen für Erstnutzer sehr hilfreich sein und allen Nutzern erlauben, mit nur ein paar Klicks, von einem Satz von Genen, an dem sie interessiert sind, zu einem Satz von vorausgesagten Funktionen zu gehen.
Suchform (Annmerkung: zurzeit sind nur "Saccharomyces Cerevisiae" auf die Datenbank geladen).

Erneut, wir schätzen alle Ihrer Computerzirkel und Ihr Interesse an unserer Forschung.

Sodann, irgentwer gegenlesen und gegebenenfalls korrigieren (Vorallem die drei Satzabschnitte die mir Kopfzerbrechen bereiten). Zusammengefasst wird hier eigenständig (is ja nicht mit Rundumbedienung ).

[Dennis Kautz]

Das WCG hat angekündigt, in Zukunft ganz auf die BOINC-Infrastruktur zu wechseln, da der UD-Client vom Hersteller nicht mehr supported wird. Bleibt zu hoffen, dass man bald auch mit BOINC-Accountmanagern zusammenarbeiten kann und es fixed Credits gibt.