SIMAP@HOME

[laguna]

Irgendwie bin ich zu doof...

Hab die app_info.xml im Projektverzeichnis erstellt und beide exe Datein bei Simap gezogen. Also die mit "without SSE".

Heute morgen komm ich an den Rechner und der hat die WU schon wieder geschreddert.
Nach genauerem Hinsehen hab ich gemerkt das er sich die "with SSE" exe selbstständig heut Nacht wieder geladen hat....

Wie geht das?!

Hast Du sicher die .exe für die Hmmer WUs geladen?
Ich hab beim ersten Mal auch aus Versehen die normale SIMAP App gezogen...

[Hermes]

Irgendwie bin ich zu doof...

Hab die app_info.xml im Projektverzeichnis erstellt und beide exe Datein bei Simap gezogen. Also die mit "without SSE".

Heute morgen komm ich an den Rechner und der hat die WU schon wieder geschreddert.
Nach genauerem Hinsehen hab ich gemerkt das er sich die "with SSE" exe selbstständig heut Nacht wieder geladen hat....

Wie geht das?!

Hast Du sicher die .exe für die Hmmer WUs geladen?
Ich hab beim ersten Mal auch aus Versehen die normale SIMAP App gezogen...

Also ich würde uneingeschränkt eines der Archive mit allen relevanten Applikationen und Hilfsdateien (appinfo.xml) empfehlen. Da entfällt diem Möglichkeit ein Programm oder die korrekten Versionsnummern in der appinfo-Datei zu vergessen.

[scsimodo]

Ätsch, leergerechnet

October 12, 2006
BOINCSIMAP wird zu einem periodischen Projekt: Wie im Projektstatus und im Batchmonitor zu sehen, ist die Arbeit fü simap und hmmer auf einige verbleibende Workunit-Serien beschränkt. Die hmmer-Berechnungen liefen durch die Performance-Optimierungen an der Applikation viel schneller als wir erwartet hatten. Dadurch werden unsere Datenbanken für Protein-Ähnlichkeiten und -Domänen bald vollständig und aktuell sein. Wir feiern diesen sehr wichtigen Meilenstein und danken allen BOINCSIMAP-Usern die dies erst möglich gemacht haben. Wir werden uns nun darauf konzentrieren, SIMAP in mehr Bioinformatik-Methoden, -Portale und -Datenbanken zu integrieren - und damit den Einfluss unseres Projektes auf die Computerbiologie und die Lebenswissenschaften zu erhöhen. K&uum;nftig wird SIMAP Eure Unterstützung benötigen um regelmäßig Aktualisierungen zu berechnen. Monatlich werden neue Sequenzen und Domänen in Workunits geschrieben, die berechnet werden müssen. Wir würden uns sehr freuen, wenn Ihr mit unserem Projekt verbunden bleibt und uns helft diese periodisch anfallende Arbeit zu berechnen.

Wenn's nix mehr zu tun gibt dürfen wir dann vermutlich alle 6 Millionen Proteine falten

[Rincewind]

Na super, ausgerechnet mein Lieblingsprojekt!

ich werde mir wohl mal die ein oder andere WU auf Vorrat ziehen *g*





Hätte man da nicht Seti "periodisch" machen können?:angel2:

[Uwe Sänger Herzke]

Wenn's nix mehr zu tun gibt dürfen wir dann vermutlich alle 6 Millionen Proteine falten

Schön auf DIN A4, und dann in den Schrank legen

Aber ich denke, das wird für tatsächlich hoffentlich einigen anderen Faltprojekten einen kleinen Schub geben, und nicht einfach die Rechner zum Aufgeben verleiten.

[Bananeweizen]

So, und jetzt sage nochmal jemand, unsere Taskforce dort zur Stabilisierung unseres Teamranges hätte sich nicht gelohnt...

Michael.

[Rincewind]

joah, Rang 2 ist nicht verkehrt!

1 Planet 3DNow! 4,045,858.48
2 Rechenkraft.net 3,050,417.53

Und die 1.000.000 Punkte holen wir auch noch auf *g*

[yoyo]

Sollten wir da jetzt nicht noch die letzten SIMAP WUs saugen?
yoyo

[scsimodo]

Und die 1.000.000 Punkte holen wir auch noch auf *g*

Da müssen aber viele Sequenzupdates her Und auf dem 2. Platz "überwintern" ist bei der Konkurrenz keine schlechte Leistung, möchte ich mal meinen...

[vfrey]

ich werde am Montag sogar einige WUs wieder in den freien Umlauf geben, da ich auf diesem Rechner knapp 4 Stunden für eine HMMER-WU brauche und bei 40 am Stück heruntergeladenen WUs bei einigen davon die Deadline nicht schaffen werde...

[scsimodo]

Sollten wir da jetzt nicht noch die letzten SIMAP WUs saugen?
yoyo

Wozu die Eile? Vom vorletzten Batch sind noch rd. 25.000 übrig, dann kommt nochmal einer mit rd. 50.000 und noch ein paar Updates. Da müssten wir aber ganz gewaltig bunkern. Wenn grob geschätzt die letzten 10.000 "unterwegs" sind kann man mal drüber nachdenken. Aber wozu? Der zweite Platz ist stabil und andere Projekte haben auch schöne WUs Ich habe mir 3 Tage Bunker geladen und habe mich hinterher gefragt wozu eigentlich? Na ja, schaden kann's nicht, aber wenn die WUs alle sind, dann sind sie halt alle.

BTW: Was nehmen wir als Ersatz? Unser Ranking bei WCG sieht ziemlich mies aus. Wollte ich nur mal nebenbei erwähnen Hat nur den Nachteil, dass WCG mickrige Credits vergibt, aber die bekommen die anderen ja auch... Aber in den Top20 würde ich RKN schon gerne sehen...

[scsimodo]

ich werde am Montag sogar einige WUs wieder in den freien Umlauf geben, da ich auf diesem Rechner knapp 4 Stunden für eine HMMER-WU brauche und bei 40 am Stück heruntergeladenen WUs bei einigen davon die Deadline nicht schaffen werde...

Das ist der Sch*** mit diesem dämlichen result duration correction factor. Da wenn man nicht aufpasst müllt man sich alles zu und bekommt es innerhalb der Deadline nicht mehr raus. 40 WUs sollten bei 24x7 aber kein Problem sein, bei einem Teilzeitrechner hast Du in der Tat ein Problem


[EDIT] Warum gibt's Du die überzähligen WUs nicht gleich frei? [/EDIT]