TN-Grid Challenge, 10.-16.12.2016

[respawner]

ich habe wieder den Trick mit <ncpus> in der cc_config.xml gemacht. Meine 8 vKerne haben vorgestern Abend mit 128 über 400 WUs gezogen und rechnen nun ohne Netzwerkzugriff. Die anderen Rechner rechnen noch andere Projekte bzw. schon TN-Grid ohne bunkern.

Gut dass ich noch mal nachgesehen habe, sonst hätte ich wohl morgen früh die WUs rausgelassen statt ab 17:00

[Michael H.W. Weber]

Obwohl ich das Projekt gerade über BAM! für den Cluster-Account angemeldet habe, kann ich es nicht auf dem RNA World Server in der Auswahlliste sehen und somit auch nicht dafür rechnen. Was ist da wohl los? Wieder ein "weak account key"-Problem, wie bei Rosetta@home, sodass man über BAM! nicht fernsteuern kann?

Michael.

[gemini8]

Noch vier Stunden.

[respawner]

so meine Bunker sind geöffnet. Wir sind momentan auf Platz 7.
Beinahe wäre mein Haupt-PC leer gelaufen (wenn der Start der Challenge 3 Stunden später gewesen wäre).
Ich hoffe es haben noch mehr RKNler gebunkert.

[gemini8]

Ich habe auf sieben Rechnern (sechs Core2Duo, ein Opteron) einen guten Tag gebunkert.
Der i7 läuft seit eben wieder, aber Boinc wollte ein paarmal nicht starten, weswegen er in der Bunkerphase aus war.
Ich hatte nicht gedacht, daß er jetzt wieder läuft, aber ich wollte es noch einmal probiert haben - und ich hatte Glück!

[Michael H.W. Weber]

Bin auch gerade am Hochladen...

Michael.

[gemini8]

So - da ich das Eingangsposting nicht editieren kann (sollte in diesem Bereich vielleicht erlaubt werden), habe ich meine Signatur etwas verändert.

[gemini8]

Boinc Italy will's wirklich wissen, wie?

Code: Alles auswählen

Date			2016-12-10	2016-12-09	2016-12-08	2016-12-07	2016-12-06	2016-12-05	2016-12-04	2016-12-03	2016-12-02	2016-12-01
Total credit	65,286,850	65,023,733	64,810,945	64,564,384	64,046,922	63,626,162	63,244,166	62,961,056	62,720,664	62,579,074
Credit per day	263,117		212,788		246,561		517,463		420,760		381,996		283,110		240,392		141,590		72,655

Seit dem 01.12. scheint sich da irgendetwas Heftiges eingeklinkt zu haben. Im November waren die Tagescredits grundsätzlich unter 100k.

@ Christian (falls du hier mitlesen solltest):
Du kannst nicht zufällig das Rechenzentrum zuschalten? *liebguck*

[Michael H.W. Weber]

Bei uns sollten noch ein paar mehr rechnen. Wir halten zwar Rang 7, was gut ist, aber da ginge nch mehr. Der Anmeldungscode steht ja auf der Projektwebseite. Also mal ran an die Bouletten. Sind nur noch 5 Tage, da kann man doch mal umschwenken...

Michael.

[Michael H.W. Weber]

Auf deren Webseite wird angegeben, dass Arabidopsis thaliana (Kresse) untersucht wird. Das wage ich zu bezweifeln, denn die WUs haben Gennamen, z.B. "uspG", die in A. thaliana nicht definiert sind.
Man findet sie stattdessen in Bakterien, wie z.B. E. coli. Wen es interessiert, der kann hier die Gennamen checken:

E. coli (Stamm: MG1655): https://ecocyc.org/
A. thaliana (Stamm: col): https://www.biocyc.org/organism-summary?object=ARA

Gebt einfach mal die Gennamen eurer WUs dort ein - die von mir rausgesuchte Datenbank ist recht informativ.
Es scheint übrigens auch RNA WUs zu geben.

Michael.

P.S.: Ich vermute, dass die Webseite einfach etwas veraltet ist.

[edit]: Nee, alles gut. Was sie offenbar machen ist, dass sie das Hinzufügen von EXTERNEN Genen zu dem genetischen Netzwerk in A. thaliana untersuchen. Die Gennamen in den einzelnen WUs dürften also die Gene von E. coli sein, die im Rahmen der betreffenden WU dem A. thaliana Gennetzwerk hinzugefügt werden, um zu untersuchen, wie dieses dadurch moduliert wird. Ganz interessantes Projekt.

[Jkcapi]

Moinmoin, werde ein paar WUs mitrechnen

[Kolossus]

Boinc Italy will's wirklich wissen, wie?
Seit dem 01.12. scheint sich da irgendetwas Heftiges eingeklinkt zu haben. Im November waren die Tagescredits grundsätzlich unter 100k.

@ Christian (falls du hier mitlesen solltest):
Du kannst nicht zufällig das Rechenzentrum zuschalten? *liebguck*

Nu keine Panik. Wir werden das Kind schon schaukeln.....