Datenbank für Krankheitserreger-Biomarker für schnellere Diagnose

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X1900AIW
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Datenbank für Krankheitserreger-Biomarker für schnellere Diagnose

#1 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 19.05.2025 07:23

"Krankheitserreger bestimmen: Diagnose in Minuten - statt Tagen", 19.05.2025
https://www.tagesschau.de/wissen/gesund ... n-100.html
(...) Das Problem: Bei bakteriellen Infektionskrankheiten muss zur Bestimmung des Erregers immer erst eine Bakterienkultur angelegt werden. "Der Prozess dauert dadurch mindestens 24 Stunden, bis man dann die isolierte Kultur hat und an dieser Kultur dann weitere Tests machen kann", erklärt Nicole Strittmatter von der Technischen Universität München (TUM).

Neuer Ansatz könnte Diagnostik revolutionieren

Doch damit soll bald Schluss sein. Die Professorin für Analytische Chemie hat mit ihrer und einer Arbeitsgruppe vom Imperial College London eine Methode entwickelt, die diesen Schritt umgeht. Das könnte die Diagnose bestimmter Erkrankungen geradezu revolutionieren: Zum Beispiel bei Tuberkulose, die durch sogenannte Mykobakterien verursacht wird. Diese Bakterien teilen sich nur sehr langsam. Manchmal dauert es bis zu drei Wochen, bis eine für eine Bestimmung ausreichende Menge herangezüchtet ist.

Ein Blick auf ihre Ausscheidungen

Um diese Zeit einzusparen, schauen sich die Forscherinnen und Forscher nicht die Bakterien selbst an, sondern ihre Stoffwechselprodukte, die sich je nach Bakterienart voneinander unterscheiden. Sie finden sich in Gewebe-, Urin- oder Stuhlproben der Patienten. Mithilfe sogenannter Massenspektrometer werden die Bestandteile der Proben in Atome und Moleküle zerlegt. So kann ihre genaue Zusammensetzung bestimmt werden.

Die Strukturen der Bakterienausscheidungen werden dann als Biomarker in einer Datenbank gespeichert und stehen danach zum Abgleich bereit. Bislang sind hier 232 medizinisch besonders wichtige Bakterienspezies erfasst. Über 1.400 sollen es einmal werden. Damit könnte in Zukunft jede bislang bekannte Bakterienart, die Krankheiten hervorruft, eindeutig identifiziert werden. (...)
Bild

Link:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55457-7
https://www.professoren.tum.de/strittmatter-nicole
https://www.dzif.de/de/ueber-uns/mitarb ... lena-biehl
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Michael H.W. Weber
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Re: Datenbank für Krankheitserreger-Biomarker für schnellere Diagnose

#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 19.05.2025 16:48

...das Problem ist, dass man oftmals eben nicht nur die Information benötigt, um welches Bakterium es sich handelt, sondern vor allem auch wissen muss, ob und gegen welche Antibiotika es resistent ist. Und genau hierzu könnte man einen Machine Learning Ansatz einsetzen, an dem ich derzeit herumschraube. :wink:

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yoyo
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Re: Datenbank für Krankheitserreger-Biomarker für schnellere Diagnose

#3 Ungelesener Beitrag von yoyo » 19.05.2025 19:02

Antibiotika Resistenzen werden an das RKI übermittelt. Alle die Reserveantibiotika einsetzen (das sind im wesentlichen alle Krankenhäuser) sind verpflichtet ermittelt Resistenzen an das RKI zu übermitteln. Damit sieht man dann, wo welche resistente Bakterienstämme unterwegs sind.
HILF mit im Rechenkraft-WiKi, dies gibts zu tun.
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