GENE@Home

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GENE@Home wird als Teil des TN-Grid betrieben.

Es ist das erste laufende Projekt von TN-Grid, welches in Zusammenarbeit mit der Fondazione Edmund Mach (FEM) und dem Department of Information Engineering and Computer Science (DISI) der UNITN durchgeführt wird.

Gene@home analysiert genetische Regulationsnetzwerke. Konkret wird die Pflanze Arabidopsis thaliana (Schotenkresse) untersucht. Schaut man sich die WU-Bezeichnungen an, so erkennte man darin Namen von Genen, die üblicherweise in Bakterien vorkommen (z.B. "uspG"). Mit gene@home wird basierend auf einer iterativen Variante des sogenannten PC-Algorithmus untersucht, inwiefern das Hinzufügen neuer Gene (hier z.B. aus dem Darmbakterium E. coli) eine Veränderung des regulatorischen Gen-Netzwerkes in Arabidospis thaliana verursacht.

Wer sich dafür interessiert, was die in den einzelnen WU-Namen angegebenen Gene für Funktionen haben, der kann dies hier recherchieren:


E. coli (Stamm: MG1655): https://ecocyc.org/ A. thaliana (Stamm: col): https://www.biocyc.org/organism-summary?object=ARA


Gebt einfach mal die Gen-Namen eurer WUs dort oben rechts ein. Es scheint übrigens auch RNA WUs zu geben.


Inhalt

Projektübersicht

InfoIcon.png GENE@Home
Name GENE@Home
Kategorie Biologie
Ziel Analysation genetischer Regulationsnetzwerke
Kommerziell   nein
Homepage gene.disi.unitn.it/test/genehome/en/hf


 
Italy01.gif    Dieses Projekt wird in Italien durchgeführt.
Uni.jpg DISI
Universität Trento, Italien


Projektstatus

InfoIcon.png Projektstatus
Status   aktiv
Beginn 12.12.2013
Ende noch aktiv

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Clientprogramm

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Client-Eigenschaften

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Normal ausführbares Programm Checkbox 1.gif
Als Bildschirmschoner benutzbar Checkbox 1.gif
Kommandozeilenversion verfügbar Checkbox 0.gif
Personal Proxy für Work units erhältlich   Checkbox 0.gif
Work units auch per Mail austauschbar Checkbox 0.gif
Quellcode verfügbar Checkbox 0.gif
Auch offline nutzbar Checkbox 0.gif
Checkpoints Checkbox 1.gif

Veröffentlichte Versionen

Die jeweils aktuellen Versionen können hier eingesehen werden.

Installation

GENE@Home benutzt die BOINC-Infrastruktur. Die Anmeldung, Installation und Konfiguration sind auf der allgemeinen BOINC-Seite beschrieben.


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Publication about Vitis vinifera (Wed, 24 Oct 2018 10:47:47 GMT)

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