SIMAP (beendet)/br

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SIMAP (Similarity Matrix of Proteins, pt: matriz de similaridade de proteínas) é um banco de dados para homologias calculadas de seqüências de proteínas e fornece ferramentas de consulta especializadas pronto para usar os dados de forma eficaz. Para mais de 4 milhões de seqüências de proteínas, a similaridade para cada par de duas seqüências deve ser calculada. Esta informação é importante porque a pesquisa médica sobre certas proteínas pode ser aplicada a seqüências de proteínas semelhantes. Por exemplo, muitos resultados da pesquisa genética com ratos são transferíveis para seres humanos.

Depois que o SIMAP foi capaz de processar os dados de inventário já existentes dos vários bancos de dados de proteína mais rapidamente do que se supunha anteriormente devido às otimizações do cliente, somente as atualizações precisam ser feitas em intervalos mensais. Isso significa que às vezes não há trabalho para este projeto. Novos unidades de trabalho são anunciados muito cedo na página inicial.

Mais informações estão disponíveis em nosso FAQ do projeto.


Audio-Beschreibung Ausführliche Audio-Beschreibung des Projekts: BOINCcast

O projeto terminou no fim de 2014.


Visão geral do projeto

InfoIcon.png SIMAP
Nome SIMAP
Categoria Bioinformatik/br
Destino Cálculo da similaridade de seqüências de proteínas de acordo com o princípio FASTA
Comercial não
Homepage boincsimap.org/boincsimap (archive.org)



 
Austria01.gif    Este projeto está sendo realizado na Áustria.


Status do projeto

InfoIcon.png Status do projeto
Status   terminado
Início 13.12.2005
Fim fim de 2014

Links do projeto

FAQ do projeto

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Cliente

Sistemas Operacionais

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Icon windows 16.png   Windows 64bit Checkbox 1.gif  
Icon linux 16.png   Linux Checkbox 1.gif  
Icon linux 16.png   Linux 64bit Checkbox 1.gif  
Android.jpg   Android Checkbox 1.gif  
Icon dos 16.png   DOS Checkbox 0.gif  
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Logo-aix.jpg   AIX Checkbox 1.gif  
Tru64 Checkbox 1.gif  
Logo-irix.gif   IRIX Checkbox 1.gif  
Icon java 16.png   Java (independente do sistema operacional)  Checkbox 0.gif  

Informação sobre as unidades de trabalho

Nome RAM Duração Tempo determinado Memória Download Upload Requisito mínimo
HMMER  45 MB  1:00 h (C2D 32bit 2,4 GHz)  8 Tage  11 MB MB 0,05 MB {{{mindestanforderung}}} oder besser


SIMAP  10 MB  0:45 h (AMDX2 32bit 3,0 GHz; C2D 32bit 2,4 GHz)  8 Tage  2 MB 1,8 MB 2,5 MB {{{mindestanforderung}}} oder besser


A duração é o tempo médio de computação que é necessário na CPU correspondente (relógio entre parênteses).
O tempo determinado é o intervalo de tempo em que a unidade de trabalho deve ser calculado.

Versões publicadas

  • 09.10.2006: HMMER 5.09
  • 09.10.2006: HMMER 5.09
  • 18.09.2006: HMMER 5.08
  • 17.09.2006: HMMER 5.07
  • 16.09.2006: HMMER 5.06
  • 13.09.2006: HMMER 5.05
  • 03.09.2006: HMMER 5.02
  • 12.07.2006: 5.10
  • 21.06.2006: 5.09
  • 19.06.2006: 5.08
  • 17.01.2006: 5.07
  • 15.01.2006: 5.06
  • 21.12.2005: 5.05
  • 19.12.2005: 5.04
  • 13.12.2005: 5.03

Screenshots

Bisher zeigt der Client noch keine eigenen Grafiken bei der Berechnung an, die allgemeinen BOINC-Screenshots zeigen aber, wie der Client arbeitet. Wenn BOINC als Bildschirmschoner läuft, wird bei diesem Projekt das BOINC-Logo angezeigt.

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Notícias

  • Deutsch nein.gif 11.11.2009: [ SIMAP - a comprehensive database of pre-calculated protein sequence similarities, domains, annotations and clusters]

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Controle de qualidade

Verificado: 29.10.2018

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