Rosetta@home/br
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Rosetta@home tenta prever estruturas de proteínas e ligação de proteínas. O objetivo do projeto é desenvolver métodos que possam prever com segurança estruturas de proteínas a partir de seqüências de aminoácidos. Esses métodos podem ajudar a combater doenças como câncer, HIV ou malária. O Rosetta foi desenvolvido pela Universidade de Washington e é considerado o melhor programa para prever o dobra de proteínas, uma vez que alcançou sempre muito bons resultados na CASP-competição.
Ao contrário do Human Proteome Folding Project que usa o software Rosetta, o Rosetta@home tenta melhorar o software Rosetta em si. É por isso que o projeto pertence à categoria pesquisa básica.
Uma característica especial do projeto é que você pode definir o tempo de cálculo da unidade de trabalho na sua conta. Isso não tem base científica, mas organizacional: com unidades mais longos, o servidor do projeto e a largura de banda do usuário são poupados. No entanto, cada unidade faz pelo menos uma simulação de convolução completa antes de ser terminada. Para uma proteína aleatoriamente complexa, uma unidade pode funcionar por 6 horas ou até mais, mesmo que tenha um tempo de execução muito mais curto. Antes de alterar o chamado "tempo de execução da CPU de destino", você deve ter todas as unidades abertas processadas e somente após a mudança carregar novas tarefas. [1]
Descrição detalhada do áudio do projeto (Alemão): BOINCcast
Existe um projeto separado que testa as versões do programa antes de serem adquiridas pela Rosetta. É chamado: Ralph@home.
Além da computação em grade, os pesquisadores deste projeto também tentam usar o conceito de Distributed Thinking. Para este fim, eles desenvolveram o jogo foldit, juntamente com outros membros dos departamentos de Ciência da Computação e Engenharia e Bioquímica da Universidade de Washington, onde o jogador dobra as próprias proteínas.
Inhalt
Visão geral do projeto
| Nome | Rosetta@home |
| Categoria | Biochemie/br |
| Destino | Prevendo estruturas de proteínas |
| Comercial | nein |
| Homepage | boinc.bakerlab.org/rosetta |
| Este projeto está sendo executado em Washington, EUA. |
Status do projeto
Links do projeto
- Informação
- Gráficos/Screensaver
- Ver estruturas proteicas auto-calculadas
- Junta-se
- Estatísticas
- Mailing list/Fórum
- Apoio
- Informações muito atuais sobre o status e realizações do projeto
Neuigkeiten (RSS-Feed)
- e-Library (RKN-Wiki)
Formação científica
- Introdução ao problema abordado pelo projeto
- Controle de doenças através de previsões de estrutura protéica
Estatísticas
| Wo | Übersicht | Top Teams | Top User |
|---|---|---|---|
| Projekt Home Page | Top Teams | Top User | |
| BOINCstats.com | Übersicht | Top Teams | Top User |
| stats.free-dc.org | Übersicht | Top Teams | Top User |
Clientes
Sistemas operacionais
| Windows | ||
| Windows 64bit | ||
| Linux | ||
| Linux 64bit | ||
| Android | ||
| DOS | ||
| MacOS X | ||
| MacOS X 64bit | ||
| BSD | ||
| Solaris | ||
| Java (independente do sistema operacional) |
Client propriedades
| Funktioniert auch über Proxy | |
| Normal ausführbares Programm | |
| Als Bildschirmschoner benutzbar | |
| Kommandozeilenversion verfügbar | |
| Personal Proxy für Work units erhältlich | |
| Work units auch per Mail austauschbar | |
| Quellcode verfügbar | |
| Auch offline nutzbar | |
| Checkpoints |
Configuração
Rosetta@home/br benutzt die BOINC-Infrastruktur. Die Anmeldung, Installation und Konfiguration sind auf der allgemeinen BOINC-Seite beschrieben.
Peculiaridades
- Você pode definir o tempo da execução das unidades de trabalho no site. Existem configurações de uma hora a um dia. O padrão é de 3 horas. Se a taxa de erro for baixa, recomenda-se uma duração maior.
Versões publicadas
As versões mais recentes são publicadas aqui.
Screenshots
Notícias
Últimas notícias
RSS-Feed
Der RSS-Feed von http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rss_main.php konnte nicht geladen werden: Fehler beim Parsen von XML für RSS
Links
09.03.2007:
promotional video about Rosetta@home
20.08.2006:
BOINCcast #14 - rosetta@home und Updates
10.05.2006: Open Source Bioinformatics
10.05.2006: Voltage sensor conformations in the open and closed states in ROSETTA structural models of K+ channels
06.04.2006: Next cancer breakthrough from your home PC?
11.01.2006: Protein Detectives
25.10.2005: PDB Molecule of the month
24.09.2005: Top predictions
24.09.2005: Welcome from David Baker
21.09.2005: Cracked: the puzzle of protein origami
