RNA World/FAQ/br

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Quais são os objetivos da RNA World simplesmente explicados e o que me faz participar?

RNA World é projetado para o estudo da ARN (Ácido ribonucleico), é o primeiro projeto de computação distribuída que é realizado neste campo. Se você olha para o que recentemente os prêmios Nobel na Química ou Medicina (por exemplo: telomerase, ribossomos: estes são ARN [/] ARN interferência / miARNs]: um ARN menor que regula o desenvolvimento de uma célula e está diretamente relacionado ao câncer), verifica-se que a descoberta do ARN é muito importante. Você pode até precisar de tomar antibióticos nunca para pegar o seu sistema imunológico em uma infecção bacteriana sob os braços. Normalmente, estes se ligam aos componentes dos ribossomos bacterianos e, portanto, previnem a biossíntese de proteínas. O tão perturbado em suas bactérias de crescimento não pode mais se multiplicam ruins o que os macrófagos do corpo bloqueiam a invasão. Outras partes do ARN bacteriano permitem que elas se encaixem nas células humanas, resp. penetrar nisso. Naturalmente, muitos outros aspectos relacionados aos processos celulares baseados em ARN também estão no foco de pesquisadores, tais como, por exemplo se microorganismos pode ter uma forma primitiva de CRISPR sistema imunológico ou não. Como pode ser prontamente apreciado, a identificação de sequências de ARN que codificam não-proteínas é a base de conhecimento para uma vasta gama de problemas e questões. Esta informação pode até ser usada para desenvolver novos medicamentos contra doenças. Para mais informações sobre este projeto, por favor consulte descrição do projeto.

Quais aplicativos são atualmente suportados pela RNA World?

Tipo
Aplicação
Objetivo
INFERNAL 1.0.2 CMBUILD, CMCALIBRATE, CMSEARCH ARN Análise de covariância
InReAlyzer 1.0 Crie gráficos de alta resolução a partir dos resultados INFERNAL

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O RNA World suporta GPU/CUDA/STREAM?

Atualmente, os aplicativos da RNA World não podem se beneficiar da GPU (com CUDA ou STREAM). Nós Tentamos desenvolver aplicativos apropriados que podem. Estes serão fornecidos aos usuários conforme eles funcionam.

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Quanta memória RAM é necessária para executar o RNA World?

Tipo
Aplicação
Necessidade de memória RAM
INFERNAL 1.0.2 CMCALIBRATE até 2,5 GB de RAM,
geralmente menos de 600 MB de RAM
CMSEARCH até 1 GB de RAM,
geralmente menos de 100 MB de RAM
InReAlyzer 1.0 menos de 50 MB RAM

Note por favor: Em máquinas com processadores multinúcleos, o RNA World pode usar simultaneamente todos os núcleos disponíveis. Contanto que não utilizemos o modo multithread baseado em OpenMPI, isso significa que o requisito de RAM para a conclusão bem-sucedida de todos os pacotes de trabalho é adicionado.

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Quanto tempo são os tempos de execução de típicos pacotes de trabalho da RNA World em uma máquina Intel P8600 Core2Duo com 2.4GHz executando Ubuntu Linux x64?

Tipo
Aplicação
Tempo de execução
INFERNAL 1.0.2 CMCALIBRATE 20 minutos a 10 dias,
geralmente um dia
CMSEARCH alguns minutos até 100 horas,
geralmente algumas horas
InReAlyzer 1.0 alguns segundos a 5 horas,
geralmente alguns minutos

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Os resultados serão publicados e, em caso afirmativo, sob qual licença?

Todos os resultados do RNA World são publicados em revistas científicas revisadas por pares de alta qualidade, preferencialmente naquelas que oferecem uma política de acesso aberto para o público em geral.

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Existem certificados para o trabalho feito?

Sim.

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Quais são as custos de participação no RNA World?

Nenhum, exceto por sua eletricidade particular, sua rede e os custos de manutenção de hardware.

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Há privilégios disponíveis apenas para membros da equipe do Rechenkraft.net?

Por razões de justiça, não.

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Haverá ajustes de idioma no site?

Sim, uma visão geral dos idiomas já disponíveis pode ser encontrada aqui: http://www.rnaworld.de/rnaworld/language_select.php

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Haverá aplicativos otimizados para CPU (SSE, SSE2, etc.)?

Estes já estão implementados, ou seja, o pacote inicial buscado contém um programa que verifica qual tipo de aplicativo é ideal para sua máquina (x86/x64, várias versões SSE).

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É possível excluir determinados aplicativos/subprojetos?

Sim. Você pode decidir sobre suas próprias configurações do projeto RNA World que as sub-aplicações do RNA World devem suportar e quais não. De fato, se você tiver uma máquina mais antiga, ela pode ser recomendada, por ex. para excluir CMCALIBRATE, pois requer grandes quantidades de memória RAM e geralmente leva muito tempo para ser concluído.

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É possível participar de testes alfa/beta selecionando no perfil?

Sim.

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Como posso determinar os requisitos de armazenamento de cada unidade de trabalho do RNA World?

No Windows, isso é feito mais convenientemente com a ajuda do Gerenciador de Tarefas (TaskManager, abreviado TM), mas isso deve ser algo manipulado: Iniciar TM -> Clique na guia para processos -> no menu da TM em "Exibir" -> Selecionar colunas e lá "memória de trabalho - pico de trabalho" ative-lo definido na caixa de seleção.

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