Newsletter/01.06.2007

Aus Rechenkraft
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Rechenkraft.net Nachrichten Juni-Ausgabe 2007

Einleitung

Liebe Interessenten, liebe Mitglieder von Rechenkraft.net, es gibt wieder Interessantes zu berichten. In diesem Newsletter lest Ihr Infos zum Stand des RKN-Buches, von neuen Projekten, von einem geplanten eigenen RKN-Projekt und was sonst noch so geschah.

Viel Vergnügen!

Mail an die Redaktion: Der Diplomat, Post ins Forum

Stand des Rechenkraft.net e.V.-Buches

Buchtitel: "Status des ersten Rechenkraft.net Buches "Distributed & Grid Computing - Science Made Transparent for Everyone. Principles, Applications and Supporting Communities".

Wie ihr ja aus dem Forum wißt, arbeitet Rechenkraft.net e.V. an der Herstellung eines Buches zum Thema DC. Das Buch wird zunächst nur in englischer Sprache verfügbar und später über Amazon bestellbar sein. Dies liegt daran, da die große Mehrheit aller DC-Projekte aus dem englischsprachigen Raum stammen. Ich persönlich hätte natürlich ein deutsches Buch bevorzugt, finde aber weder im Moment noch in den nächsten Monaten genug Zeit, eine Übersetzung anzugehen. Das liegt nicht nur an beruflichen Gegebenheiten, sondern auch daran, daß ich bereits mit Hochdruck an unserem ersten eigenen DC-Projekt arbeite.

Unser Buch besteht bislang aus zwei einführenden Artikeln, ein allgemeiner von Prof. Wolfgang Gentzsch (das ist der Koordinator des D-Grids), der BOINC, Globus Toolkit uvm. behandelt und einer von Prof. Bernd Freislebens Arbeitsgruppe zur MAGE Infrastruktur. Warum ausgerechnet MAGE? Nun, MAGE wird aller Voraussicht nach die Infrastruktur werden, auf dessen Basis wir unsere DC-Projekte ins Rennen schicken werden. Doch dazu an anderer Stelle mehr. Diese Artikel und ein dritter (vgl. weiter unten, PlayStation 3) werden neben einer kurzen Einführung von mir den Teil "Principles" ausmachen.

Der Teil "Applications" enthält dann die Artikel der jeweiligen DC-Projektbetreiber. Dazu gehören:

Also eine ziemlich breite Abdeckung der mittels DC bearbeiteten Themen. Vijay Pande von Folding@home und David Baker von Rosetta@home hatten leider trotz Zusage später aus Zeitmangel abgesagt. David Anderson (BOINC & SETI Entwickler) hatte kein Interesse, Ian Foster (Globus Toolkit), das Team von CONDOR, Lifemapper & ?Fluids@home meldete sich nicht auf meine mehrfachen Anfragen und der Betreiber von Climate Prediction wollte nicht ohne David Anderson einen Beitrag leisten, meldete aber für zukünftige Publikationen Interesse an. Bruce Allen (Einstein@home) hatte keine Zeit und Michela Taufer (Docking@home) ist der Ansicht, daß ihr Projekt noch nicht genügend Ergebnisse abgeworfen hätte, um darüber einen Artikel für ein Buch zu schreiben.

Letzte Woche ist es mir nun gelungen Gianni De Fabritiis dafür zu gewinnen einen Artikel zum PS3GRID (also den Einsatz der PlayStation 3 / des Cell Prozessors in DC-Projekten) auszuarbeiten. Ich erwarte diesen Beitrag bis Ende Juni. Frank Mueller (baute den ersten PS3-Cluster) hat sich bislang auf meine Anfrage leider nicht gemeldet (ich werde es nochmals probieren). Schließlich werde ich jetzt noch den APS@home-Betreiber anfragen, um vielleicht doch noch ein Projekt aus der Sparte Klimaanalyse ins Boot zu bekommen. Ich denke, damit ist dann genügend Aufwand betreiben worden - irgendwann muß man das Projekt ja auch mal abschlieÃ?en.

Die bisher eingegangenen Artikel sind gröÃ?tenteils korrekturgelesen worden - dafür danke ich an dieser Stelle all den eifrigen Helfern aus unserer Gemeinschaft. Wer Zeit hat, kann sich noch auf die Artikel zu The Lattice Project, Leiden Classical, SZTAKI Desktop Grid und die Einleitung von Wolfgang Gentzsch stürzen und mir einen zusammenfassenden Kommentar per eMail senden.

Was uns jetzt noch fehlt sind Beiträge zum Bereich "Community". Dort habe ich bislang nur einen recht lustigen Artikel von Eric Buehl vorliegen, der sich mit der Kühlung von Computern mittels Swimming Pool beschäftigt. Ein weiterer Artikel wird voraussichtlich von Aquarien handeln, in denen anstelle von Fischen Mainboards schwimmen. ;-) Ich selbst werde zwei Artikel schreiben, einen zum Betrieb mehrerer ATX-Mainboards an einem Netzteil und einen weiteren zur Thematik "Was macht ein gutes DC-Projekt aus". Ihr seht, daÃ? hier noch viel Platz ist für Artikel zur Thematim Overclocking, Kühlung, Bastelanleitungen. Ich hätte mir z.B. gewünscht, daÃ? wir einen Artikel mit einer Anleitung zum Aufbau unseres Clusters einbringen. Bislang hat sich dazu aber noch niemand bereit erklärt. Auch fehlen ein paar nette Bilderserien diverser "SETI-Monsterracks", wie sie bei verschiendenen Teams vorhanden sind. Solltet ihr also im Web auf interessante Seiten gestoÃ?en sein, eine Idee für eine ebenfalls interessante Thematik haben oder gar Lust verspüren, selbst einen (englisch-sprachigen) Artikel zu verfassen, so nehmt bitte umgehend per eMail Kontakt mir mir auf. Ich plane, diese Woche noch einen Einladungsartikel in so ziemlich jedes namhafte DC-Teamforum zu stellen, um für diesen Bereich des Buches genug Material zu bekommen. In ca. 3-4 Monaten soll das Buch in Druck gegangen sein, damit wir uns auf neue Projekte konzentrieren können.


Berichte zu Projekten

NanoHive@Home beendet Lauf - Keine Arbeit zur Zeit

Die NanoHive@Home-Fehlersuche bei den Werkzeugspitzen ist nun beendet. Die Ergebnisse werden zusammengetragen, analysiert und sowohl für die Ergebnis-Gallerie im Internet als auch für die wissenschaftliche Veröffentlichung aufbereitet. Sobald die Ergebnis-Gallerie vollständig ist und Veröffentlichung stattgefunden hat, wird eine E-Mail versandt. Das nächste NHAH-Projekt wird zur Zeit geplant. Die Betreiber geben vor dem Start des neuen Projekts Bescheid.


Quelle: Meldung vom 24. April 2007, http://www.nanohive-1.org/atHome

Ergebnisse des Projekts: http://www.nanohive-1.org/atHome/results_gallery.php#Results

APS@home - Ein neues Klimaforschungsprojekt

Bei APS@home handelt es sich um ein Forschungsprojekt zur Klimaanalyse, bzw. -vorhersage der Universität Manchester. Geleitet wird das Projekt von Dr. James R. Dorsey. Im einzelnen soll es darum gehen, mit Hilfe eines Dispersionsmodells den globalen KlimaeinfluÃ? lokaler Turbulenzen zu untersuchen, die durch Wälder hervorgerufen werden. Bei diesen Untersuchungen steht vor allem die Frage im Vordergrund, wie Energie und Gase (z.B. CO2) in Wäldern transportiert werden. Das Projekt soll ab 2008 von vor Ort-Experimenten im Regenwald von Borneo begleitet werden. Weitere Details sind in englischer Sprache zu finden.

Im Augenblick läuft die Alpha-Testphase, an der Rechenkraft.net e.V. mitwirkt. Die Test-WUs haben eine Laufzeit von ca. 2:50 Std. (AMD Athlon XP1700+) bzw. 1:20 Std. (AMD Athlon XP2600, TBred).

Im Wiki: APS@home


Hydrogen@home - Ein Projekt zur Wasserstoffproduktion

Bei Hydrogen@home geht es um Forschung im Bereich der Wasserstoffproduktion. Projektleiter ist Jack Shultz. Er scheint Diplom-Biologe zu sein. Details zum Projekt sind noch nicht näher bekannt, allerdings steht auf der Homepage, dass positive Überprüfungen für Interaktionen zwischen Katalasen und Wasserstoffperoxiden laufen. Katalase ist ein Enzym zur Zerstörung von Wasserstoffperoxid. Das Projekt benutzt FTDock - ein Open Source Protein-Protein-Docking Programm.

Hintergründe vom Projektbetreiber: http://hydrogenathome.org/Our_Research.html
Weitere Informationen in unserem Wiki: Hydrogen@home


Mail des Vorsitzenden an die Predictor@Home-Teilnehmer unseres Teams

Liebe Predictor@home Teammitglieder,

aufgrund verschiedener Vorkommnisse, die ihr im Detail unter der unten angegebenen URL auf Wikipedia bzw. Rechenkraft.net nachlesen könnt, möchte ich mich schweren Herzens den Teamleitern vieler anderer internationaler Predictor@home-Teams anschlieÃ?en und euch heute empfehlen, bis auf weiteres nicht mehr für Predictor@home zu rechnen.

Es wird Zeit, daÃ? die Projektleiter einiger "distributed computing"-Projekte verstehen, daÃ? unsere Unterstützung nicht vom Himmel fällt. Wir erzeugen die Ergebnisse und ohne uns gibt es die Projekte nicht. Es kann nicht sein, dass - wie bei Preditcor@home eindeutig geschehen - eine ganze DC Community von einem offensichtlich unqualifiziertem Forenadmin terrorisiert wird, Accounts bestehen bleiben, die nachweislich von einem Trojaner angelegt wurden, massivste Forenzensur eingeführt wird, uvm.

Es fällt mir nicht leicht, euch von der Unterstützung dieses Projektes abraten zu müssen und ich hoffe, daÃ? ich euch schon bald wieder ermutigen kann, dieses Projekt erneut zu unterstützen. Das wird allerdings erst dann passieren, wenn besagte Vorgänge restlos aufgeklärt und der besagte Admin gebührend in die Schranken verwiesen wurde.

Hintergrundinformationen:
http://de.wikipedia.org/wiki/Diskussion:Predictor%40home
http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=Diskussion:Predictor%40home

Dies ist eine Empfehlung, der zu folgen selbstverständlich eurer eigenen Entscheidung überlassen ist. Ich hoffe allerdings darauf, daÃ? möglichst viele sich meiner Empfehlung anschlieÃ?en, denn nur so können wir den erforderlichen Druck auf die Projektleitung ausüben, um das Projekt wieder in geordnete Bahnen zu lenken.

Beste GrüÃ?e,
Michael H.W. Weber

Rosetta@Home

Wie ich schon zuvor beschrieben habe, arbeiten wir aktiv am Entwurf von HIV Impfstoffen, die Proteinbestandteile aus der Virenhülle imitieren. Dies ist ein groÃ?es Unterfangen, mit sieben Doktoranden und Habilitationsgefährten, die hier Vollzeit an der Universität Washington mit Rosetta arbeiten, um Impfkandidaten zu entwerfen. Desweiteren arbeiten wir mit vielen kooperierenden Gruppen in Seattle, dem NIH und andernorts zusammen, die testen ob die erzeugten potentiellen Impfstoffe eine neutralisierende Wirkung auf das Virus entfalten. Diese groÃ? angelegten Projekte werden durch die "Gates foundation" und die "International AIDS Vaccine Initiative" finanziert. Ich werde natürlich alle auf dem Laufenden halten, was Fortschritte bei diesem wichtigen Problem anbelangt! Ich sollte denn auch hervorheben, dass die Design-Berechnungstechnik, die wir für HIV entwickeln auch auf andere Viren angewandt werden soll, auÃ?erdem überlegen wir, nächstes Jahr ein Influenza Projekt zu starten.

Ich habe bisher noch eine ergänzende Anwendung nicht erklärt, mit der wir Proteine designen, die nicht den Virus imitieren, sondern sich mit diesem fest verbinden und ihn deaktivieren. Wir haben kürzlich das Computerdesign für ein solches Protein abgeschlossen und nun mit den experimentellen Tests begonnen. Unser nächster Schritt bei diesem Projekt ist, "Blocker" zu erzeugen die an andere Krankheitserreger binden und diese deaktivieren.


PdM Juni - Projekt des Monats bei rechenkraft.net

Im Forum wurde das Projekt des Monats Juni gewählt:
http://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?t=7693
Es heiÃ?t: QMC@Home

Ziel des 'PdM' ist es Menschen auf Projekte aufmerksam zu machen die sie vorher nicht beachtet haben und unser Wissen über das Projekt zu erweitern und somit unser Wiki zu verbessern.

WikiLink zum PdM Juni: Qmc

TeraFLOP-Leistung der BOINC-Projekte

SETI: 191,79
Climate Prediction: 53,19
Einstein: 79,07
Rosetta: 55,61
WCG: 24,86
QMC: 12,2
Spinhenge: 5,45
ABC: 4,3
Tanpaku: 5,28
Proteins: 2,6
Rectilinear Crossing Numbers: 2,14
Docking: 1,02
Zivis: 0,02

Quelle: www.boincstats.com


Zusammengetragen der Diplomat

Ein eigenes Projekt bei Rechenkraft.net?

Im Forum liest man, dass der Vorstandsvorsitzende des gemeinnützigen Rechenkraft.net e.V. ein eigenes DC-Projekt ins Leben rufen will. Es wird bereits nach Freiwilligen gesucht, die

  • sich mit Webdesign auskennen (für die DC-Projektwebseiten)
  • programmieren können (Client-Programmierung)
  • die Administration der Projekt-Server übernehmen können
  • die Forenadministration betreuen
  • Erfahrung in Public Relations haben und sie für das Einwerben von Geldern zur Verfügung stehen
  • zuverlässig und kontinuierlich am RKN-DC-Projekt mitarbeiten wollen

Rückmeldungen im Forum oder an Michael H.W. Weber

Näheres konnte man im erschienenen Tätigkeitsbericht des Rechenkraft.net e.V.-Vereins erfahren. Dort steht:

Wir erhielten von interessierten Lesern etliche Rückmeldungen zu den Artikeln in der FAZ, Nürnberger Nachrichten, usw., die bis hin zu Kooperationsgesuchen gingen, sodass wir uns entschlossen haben, in den nächsten Jahren ein eigenes, deutsches â??distributed computingâ??-Projekt im Bereich der Lebenswissenschaften aufzubauen. Es ist geplant, dieses Vorhaben nach Möglichkeit in Kooperation mit der Arbeitsgruppe â??Verteilte Systemeâ?? von Herrn Prof. Freisleben, Philipps-Universität Marburg / Fachbereich Informatik, durchzuführen, um einerseits seine â??distributed computingâ??-Infrastruktur MAGE (auch hierzu wird unser Buch einen Artikel enthalten) mit einem von uns ausgearbeiteten wissenschaftlichen Projekt und unseren Möglichkeiten des Testens seiner Infrastruktur zu kombinieren. Wir hoffen dabei auf eine fruchtbare Zusammenarbeit eines gemeinnützigen Vereins mit der Universität am Standort Marburg.

Forums-Thread: http://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?t=7584
Tätigkeitsbericht Rechenkraft.net e.V. 2006: http://www.rechenkraft.net/download/RKNeV/RKN_Taetigkeitsbericht_2006-2007.pdf
Kontaktmöglichkeiten Michael H.W. Weber: http://www.rechenkraft.net/forum/profile.php?mode=viewprofile&u=83


Zusammengetragen der Diplomat

Stand der DC-Vault Rennen unseres Teams

BeamLink DC-Vault: http://www.dc-vault.com/
Wir belegen Platz 4 in der Gesamtwertung.

eOn

Einige Mitglieder rechnen fleiÃ?ig nebenzu bei eOn weiter. Ziel dieser beiden Teams ist es Rechenkraft.net als Gesamtteam bei DC-Vault in der Kategorie Physik auf Platz 5 zu hieven. Am Anfang waren es noch über 1.000 DC-Vault Punkte, die erreicht werden mussten, mittlerweile ist der Vorsprung von AMD User auf 513,57 DC-Vault Punkte zusammengeschrumpft.

Forums-Thread: http://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?t=7686
EOn im Wiki: Eon

OGR

Weitere Mitglieder sind auf ein altes Projekt (ebenfalls nicht-BOINC) aufgestiegen: OGR-25 von distributed.net
Bei DC-Vault belegen wir in der Kategorie Mathematik Platz 4. 252,7 Punkte trennen uns von Platz 3.

Forums-Thread: http://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?t=7567&postdays=0&postorder=asc&start=24
OGR im Wiki: OGR-25

Neues Unterforum Statistiken

Im Forum wurde ein neues Unterforum für Statistiken eingerichtet. Die Statistikfetichisten können sich dort austoben ;)

Link: http://www.rechenkraft.net/forum/viewforum.php?f=55

Interessantes aus dem Netz

Am 14.03.2007 wurde das Forum von RKN das erste Mal vom Bärtierchen (Milnesium tardigradum) besucht (http://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?t=7381&highlight=b%E4rtierchen). Ein Grund sich näher mit dem putzigen Lebewesen zu beschäftigen.

Es scheint inerhalb des Baumes des Lebens einer eigenen Familie zugehörig zu sein, die irgendwo zwischen Crustaceen und Arthropoden anzusiedeln ist, lebt je nach Spezies vegetarisch oder als Räuber und wohnt gerne in Moospolstern â?? und es macht ihm gar nichts aus, auf dem Trockenen zu sitzen.

Es ist entfernt verwandt mit den Insekten, lebt vegetarisch und wohnt gerne in Moospolstern â?? und es macht ihm gar nichts aus, auf dem Trockenen zu sitzen. Bis zu zehn Jahre lang kann das achtbeinige Lebewesen, das zum Stamm der Tardigraden gehört und nur etwa einen halben Millimeter groÃ? ist, ohne Wasser auskommen. Es kann völlig austrocknen, sodass sein Stoffwechsel nicht mehr messbar ist. Doch ein Tropfen Wasser genügt, um das Bärtierchen zu neuem Leben zu erwecken. Nach kurzer Zeit ist es dann wieder quietsch fidel.

Links zu weiteren Informationen, Bildern und Videos findet Ihr im oben genannten Thread.


Abspann

In Farbe und mit Archiv
Dieses Newsletter gibt es auch in Farbe und vernünftiger Formatierung: [1]

Anregungen, Beiträge, Ideen, Wünsche
Habt Ihr Wünsche, Ideen und Anregungen für die nächste Ausgabe des Newsletters? Dann habt ihr hier die Möglichkeit: [2]

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Redaktion
Der Diplomat, JE1SUS, Michael_H.W._Weber, Obi

Die Rechenkraft möge mit Euch sein Der Diplomat, JE1SUS, Michael H.W. Weber, yoyo

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