Najmanovich Research Group

Najmanovich Research Group forscht auf dem Gebiet der molekularen Erkennung und der Bioinformatik. Dazu werden verschiedene "Docking"-Simulationen durchgeführt.

"Docking" ist eine Computer Technik, die verwendet wird, um die Wechselwirkung eines Liganden an einen Rezeptor (siehe Video) vorherzusagen. Angesichts ihrer, im Vergleich zu anderen Techniken, relativ kurzen Laufzeit, wird sie in Hochdurchsatzstudien verwendet, um Tausende von Verbindungen zur Identifizierung neuer Moleküle hinsichtlich ihrer therapeutischen Effekte zu durchforsten. Jedoch erfordern diese High-Throughput-Studien große Rechenleistung, wenn man die Anzahl der Verbindungen berücksichtigt.

Das Ziel dieses Projekts ist die Charakterisierung neuer Inhibitoren für folgende Proteine:

• Matriptase, eine Protease, die bei dem Fortschritt der Krebsentwicklung eine Rolle spielt
• Matriptase-2, eine Protease, die wichtig ist für die Regulation der Eisen-Homöostase
• GPCRs, diverse G-Protein regulierte Rezeptoren, die eine Rolle bei Diabetes spielen
• Kinasen, die für den dreifach-negativen Brustkrebs verantwortlich sind
• Die Protease aus dem Bakterium Clostridium difficile, die für die Auskeimung der Sporen verantwortlich ist.

Die Website ist nicht mehr erreichbar (04.06.2017).

Projektübersicht

Najmanovich Research Group
Name	Najmanovich Research Group
Kategorie	Bioinformatik
Ziel	Krankheitsbekämpfung
Kommerziell	nein
Homepage	boinc.med.usherbrooke.ca/nrg/

Bioinfrmatik Forschungsguppe Sherbrooke Universität, Kanada

Projektstatus

Projektstatus
Status	beendet
Beginn	06.04.2011
Ende	???

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Statistiken

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Clientprogramm

Betriebssysteme

	Windows
	Windows 64bit
	Linux
	Linux 64bit
	DOS
	MacOS X
	BSD
	Solaris
	Java (betriebssystemunabhängig)

Client-Eigenschaften

Funktioniert auch über Proxy
Normal ausführbares Programm
Als Bildschirmschoner benutzbar
Kommandozeilenversion verfügbar
Personal Proxy für Work units erhältlich
Work units auch per Mail austauschbar
Quellcode verfügbar
Auch offline nutzbar
Checkpoints

WU-Informationen

Aktuelle und genaue Details für BOINC-Projekte gibt es bei WUProp.

Name	RAM	Dauer	Deadline	Speicherplatz	Download	Upload	Mindestanforderung

Die Dauer ist die durchschnittliche Rechenzeit, die auf entsprechender CPU (Taktung in der Klammer) gebraucht wird.
Die Deadline ist die Zeitspanne, in der die Work unit berechnet sein muss.

Veröffentlichte Versionen

Die jeweils aktuellen Versionen können hier eingesehen werden.

Installation

Najmanovich Research Group benutzt die BOINC-Infrastruktur. Die Anmeldung, Installation und Konfiguration sind auf der allgemeinen BOINC-Seite beschrieben.