Discovering Dengue Drugs - Together (beendet)
Das Projekt Discovering Dengue Drugs - Together ist ein Distributed Computing Projekt aus dem Bereich der Krankheitsbekämpfung, welches auf der Infrastruktur des World Community Grid (WCG) aufsetzt. Ein Statusreport des Projekts in englischer Sprache findet sich hier.
Versucht wird, ein Mittel gegen die Flavivirus-Familie zu finden, welche unter anderem verantwortlich ist für Krankheiten wie das Dengue-Fieber, das Westnilfieber, Gelbfieber und Hepatitis-C. Hierbei wird versucht, die virale NS3-Protease zu blockieren. NS3-Protease ist ein für die Reproduktion des Virus essentielles Enzym, dessen Aminosäuresequenz bei allen Vertretern der Flavivirus-Familie starke Ähnlichkeiten aufweist. Da die atomare Struktur der NS3-Protease bekannt ist, können strukturbasierte Computerprogramme genutzt werden, um Proteaseinhibitoren zu identifizieren. Eingesetzt wird im Falle von DDDT das Programm Autodock in der Version 4.0.
Hierzu ist das Projekt in 2 Phasen eingeteilt worden. Phase 1 startete am 20.07.2007 und sollte Beginn 2008 enden. Phase 2 sollte noch im Jahr 2008 beginnen. Durch Hurrikan "Ike" im Sommer 2008 war der Betrieb in der University of Texas Medical Branch (UTMB), und damit auch die Forschung an diesem Projekt erheblich beeinträchtigt. Phase 1 endete daher erst am 10.08.2009.
Phase 2 startete am 17.02.2010. In ihr sollen die "falschen Treffer" aus Phase 1 ausgesiebt werden. Die dann übrig gebliebenen "richtigen Treffer" lassen sich wesentlich effizienter in den Laboren der UTMB testen. Die Verfügbarkeit von WUs ist bei Phase 2 intermittent, das heisst es wird im Gegensatz zu den anderen WCG-Projekten nur gelegentlich welche geben.
Nach Schätzungen der Projektwissenschaftler werden zum Abschluss des Projekts voraussichtlich etwa 50.000 CPU-Jahre Rechenzeit benötigt. Nach erfolgreichem Abschluss des Projekts plant das Projektteam ausgehend von der aktuellen Software weitergehende Forschungen an HIV, Influenza, Malaria und Tuberkulose.
Für geleistete Rechenzeit werden sogenannte Badges vergeben :
Inhalt
Projektübersicht
Discovering Dengue Drug - Together | |
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Name | Discovering Dengue Drug - Together |
Kategorie | Krankheitsbekämpfung |
Ziel | Suche von Medikamenten gegen die Flavivirus-Familie |
Kommerziell | nein |
Homepage | www.worldcommunitygrid.org/research/dddt2/overview.do |
Dieses Projekt wird in Texas, USA durchgeführt. |
Projektstatus
Projektlinks
- Hintergrundinfos
- von WCG unabhängige Homepage
- Anmelden
- FAQ
- Statistiken
- Forum
- Discovering Dengue Drugs - Together im WCG-Wiki
Clientprogramm
Betriebssysteme
Windows | ||
Linux | ||
DOS | ||
MacOS X | ||
BSD | ||
Solaris | ||
Java (betriebssystemunabhängig) |
Client-Eigenschaften
Funktioniert auch über Proxy | |
Normal ausführbares Programm | |
Als Bildschirmschoner benutzbar | |
Kommandozeilenversion verfügbar | |
Personal Proxy für Work units erhältlich | |
Work units auch per Mail austauschbar | |
Quellcode verfügbar | |
Auch offline nutzbar | |
Checkpoints |
Installation
Discovering Dengue Drugs - Together (beendet) benutzt die BOINC-Infrastruktur. Die Anmeldung, Installation und Konfiguration sind auf der allgemeinen BOINC-Seite beschrieben.
Screenshot
Meldungen
- 21.08.2007 - 09.03.2011: Current & Past Project Reports
- 30.07.2008: DDDT Single Redundancy Change
Projekte des World Community Grid |
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Aktiv: OpenPandemics · Africa_Rainfall_Project · Help Stop TB · Mapping Cancer Markers · Microbiome Immunity Project · Smash Childhood Cancer · FightAIDS@home_(beendet) (ab und zu ein paar WUs) |
Beendet: AfricanClimate@Home · Computing for Clean Water · Computing for Sustainable Water · Discovering Dengue Drugs - Together Phase I & II · Drug Search for Leishmaniasis · FightAIDS@home Phase I & II · Genome Comparison · GO Fight Against Malaria · Help Conquer Cancer · Help Cure Muscular Dystrophy Phase I & II · Help Defeat Cancer · Help Fight Childhood Cancer · Human Proteome Folding Project Phase I & II · Influenza Antiviral Drug Search · Nutritious Rice for the World · Say No to Schistosoma · The Clean Energy Project Phase I · Uncovering Genome Mysteries · The Clean Energy Project Phase II · OpenZika · Outsmart Ebola Together |