offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
grrrr. meine 4 introns hats nach nem neustart komplett zerlegt
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Dein PC hat 12GB Speicher und 4 VM's reservieren zusammen schon 16GB.grrrr. meine 4 introns hats nach nem neustart komplett zerlegt
Und dazu kommt noch Windows OS, VBoxSVC, VBoxmanage, wrappers, boinc und ...
Wie soll dass gehen?
@Christian: Muß für die VM wirklich 4GB reserviert werden oder geht's auch mit weniger.
Die VM von T4T nimmt nur 256MB und climateathome 1GB.
-
- Taschenrechner
- Beiträge: 12
- Registriert: 13.04.2012 22:28
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Es handelt sich zwar bei meinem Problem eher um ein Komfortproblem, aber:
VBoxSVC verlangt auf MacBooks nach der Grafikkarte und gibt sich nicht mit dem Intel-Chip zufrieden, außer man schreibt ihm mit gfxCardStatus vor dem Start den Chip vor. Das wurde auch bereits den Entwicklern gemeldet (https://www.virtualbox.org/ticket/11111). Nun lässt sich aber VBoxSVC zur Zeit nur durch ein Schließen von BOINC beenden, daher wäre es sinnvoll, wenn es auch bei einem Anhalten des Introns beendet wird um den Chip als Grafikerzeuger festzulegen. Oder habe ich nur nicht lange genug (2 Minuten) gewartet und VBoxSVC wird erst nach längerem Anhalten beendet? Als der Task mal von BOINC angehalten wurde, da der RAM zu voll war, wurde VBoxSVC nämlich auch beendet. Eine Umstellung auf den Chip ist nur dann möglich wenn kein Programm die Karte "braucht".
Alles in allem ist es vor allem lästig, wenn die Grafikkarte läuft, da dann der Lüfter in der Regel auf Volllast geht.
Wenn ich schon mal was schreibe: Wie lange braucht denn erfahrungsgemäß ein Zebrafisch bis er durch den Rechner geschwommen ist?
VBoxSVC verlangt auf MacBooks nach der Grafikkarte und gibt sich nicht mit dem Intel-Chip zufrieden, außer man schreibt ihm mit gfxCardStatus vor dem Start den Chip vor. Das wurde auch bereits den Entwicklern gemeldet (https://www.virtualbox.org/ticket/11111). Nun lässt sich aber VBoxSVC zur Zeit nur durch ein Schließen von BOINC beenden, daher wäre es sinnvoll, wenn es auch bei einem Anhalten des Introns beendet wird um den Chip als Grafikerzeuger festzulegen. Oder habe ich nur nicht lange genug (2 Minuten) gewartet und VBoxSVC wird erst nach längerem Anhalten beendet? Als der Task mal von BOINC angehalten wurde, da der RAM zu voll war, wurde VBoxSVC nämlich auch beendet. Eine Umstellung auf den Chip ist nur dann möglich wenn kein Programm die Karte "braucht".
Alles in allem ist es vor allem lästig, wenn die Grafikkarte läuft, da dann der Lüfter in der Regel auf Volllast geht.
Wenn ich schon mal was schreibe: Wie lange braucht denn erfahrungsgemäß ein Zebrafisch bis er durch den Rechner geschwommen ist?
-
- Admin
- Beiträge: 1920
- Registriert: 23.02.2010 22:12
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Der vboxwrapper erlaubt im Moment keine dynamische RAM-Angabe und VirtualBox erlaubt dies meines Wissens auch nicht . Man muss also bevor die VM gestartet wird die RAM-Anforderung angeben. Wir können zwar abschätzen wie viel Speicher die DNA/RNA Kombination benötigt, aber die Information können wir nur umständlich an den vboxwrapper weitergeben. Hinzu kommt das zu Beginn der Entwicklung der VM es keine Möglichkeit gab von der VM nach aussen zu kommunizieren. Sprich ich habe erst nachträglich eine RAM Erkennung in die VM integriert so dass wir jetzt wissen ob zu wenig Arbeitsspeicher die Ursache für einen Berechnungsfehler ist. Wir könnten somit auch auf eine etwas dynamischere RAM Verteilung umstellen aber kämpfen ja mit noch so vielen anderen Problemen das dies erstmal im Hintergrund steht.Crystal Pellet hat geschrieben:Dein PC hat 12GB Speicher und 4 VM's reservieren zusammen schon 16GB.grrrr. meine 4 introns hats nach nem neustart komplett zerlegt
Und dazu kommt noch Windows OS, VBoxSVC, VBoxmanage, wrappers, boinc und ...
Wie soll dass gehen?
@Christian: Muß für die VM wirklich 4GB reserviert werden oder geht's auch mit weniger.
Die VM von T4T nimmt nur 256MB und climateathome 1GB.
Das mit dem zu viele VMs starten für zu wenig RAM Problem scheint im neuesten BOINC Client gelöst worden zu sein. Offen ist noch das Problem das die VM's anscheinend weiterlaufen obwohl der Client beendet wurde. Das konnte ich bei meinen Tests nicht feststellen.
-
- Vereinsmitglied
- Beiträge: 953
- Registriert: 19.05.2002 15:45
- Wohnort: Weiße Elster rechtes Ufer
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Bei mir liefen 8 RNA-WorkUnits... sieben sind laut Boinc manager fertig, bei der kontrolle im meinem account sind die 7 als fehlerhaft markiert.
Dennoch laufen die WUs im hintergrund weiter.
wie soll ich verfahren....?
Abbrechen?
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10_0 for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10_1 for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 absent
Dennoch laufen die WUs im hintergrund weiter.
wie soll ich verfahren....?
Abbrechen?
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Drosophila-yakuba_CM000159.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_28840_8 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Homo-sapiens-(human)_CM000273.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_59024_3 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1349111823_42705_5 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Canis-lupus-familiaris-(dog)_CM000033.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_16492_1 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10_0 for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10_1 for task cmsvm_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10_0 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10_1 for task cmsvm_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Danio-rerio-(zebrafish)_CU651614.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_23352_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 finished
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 absent
25.10.2013 18:13:31 | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Oryzias-latipes-(Japanese-medaka)_DG000024.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_85092_10 absent
Man kann nicht alles auf einmal tun.Aber man kann alles auf einmal lassen.
-
- Admin
- Beiträge: 1920
- Registriert: 23.02.2010 22:12
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Ja abbrechen, bitte.
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
meine wus haben sich nun auch alle verabschiedet...
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
meine haben sich auch alle verabschiedet mit fehlercode -2135228409 (0xffffffff80bb0007) Unknown error number
die überleben keinen restart ob ich den client vorher beende oder boinc aus dem autostart nehme. keine ahnung.
auch die "phantom vboxheadless" vermehren sich.. habe vier WU aber acht vboxheadless knuspern die cpu weg.
das funktioniert im moment hinten und vorne nicht mit restarts.
die restlichen habe ich abgebrochen, bringt ja nix.
Norman
die überleben keinen restart ob ich den client vorher beende oder boinc aus dem autostart nehme. keine ahnung.
auch die "phantom vboxheadless" vermehren sich.. habe vier WU aber acht vboxheadless knuspern die cpu weg.
das funktioniert im moment hinten und vorne nicht mit restarts.
die restlichen habe ich abgebrochen, bringt ja nix.
Norman
- Michael H.W. Weber
- Vereinsvorstand
- Beiträge: 22435
- Registriert: 07.01.2002 01:00
- Wohnort: Marpurk
- Kontaktdaten:
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Folgende VM-WUs erzeugten auf Host 169 Fehler:
14920890 (Paket ID: 6330774, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
14920812 (Paket ID: 6330746, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
14920775 (Paket ID: 6330727, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
Michael.
14920890 (Paket ID: 6330774, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
14920812 (Paket ID: 6330746, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
14920775 (Paket ID: 6330727, alle fehlerhaft oder abgebrochen oder noch in Arbeit)
Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.
http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B
http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B
- Uwe Sänger Herzke
- Block-Bunkerer
- Beiträge: 1326
- Registriert: 31.05.2006 14:33
- Wohnort: Bremen
- Kontaktdaten:
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Meine letzte Wutz ist nach etlichen Stunden verreckt mit folgendem Fehler:
Im BM stand folgendes:
Ich habe keine Ahnung, wie viel Platz tatsächlich auf der 20GB-Partition noch frei war heut' Nacht um halb 3, aktuell sind es 6,9GB, und RNA belegt schon 0,8GB trotz fehlender Wutz. Aktuell der größte Brocken ist 'ne T4T mit 3,4GB, die aber noch keine VM gestartet hat, und die kurz nach dem Ausfall der RNA runtergeladen wurde. Vorher gab's bei denen immer eine Meldung über zu wenig vorhandenen Platz:
Freitagnachmittag um 3 waren also noch 7,1GB verfügbar neben der laufenden RNA, Samstagmorgen um halb 3 nicht mal mehr 5,7 insgesamt; seltsam.
Code: Alles auswählen
<message>
Maximum disk usage exceeded
</message>
Code: Alles auswählen
Sa 26 Okt 2013 02:01:15 CEST | RNA World | [checkpoint] result cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 checkpointed
Sa 26 Okt 2013 02:11:42 CEST | RNA World | [checkpoint] result cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 checkpointed
Sa 26 Okt 2013 02:22:10 CEST | RNA World | [checkpoint] result cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 checkpointed
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | Aborting task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4: exceeded disk limit: 5753.80MB > 5722.05MB
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | [task] task_state=ABORT_PENDING for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 from request_abort
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | [sched_op] Deferring communication for 1 min 52 sec
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | [sched_op] Reason: Unrecoverable error for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | [task] result state=COMPUTE_ERROR for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 from CS::report_result_error
Sa 26 Okt 2013 02:27:47 CEST | RNA World | [task] result state=ABORTED for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 from abort_task
Sa 26 Okt 2013 02:27:58 CEST | RNA World | [checkpoint] result cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 checkpointed
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | [task] Process for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 exited, status 49664, task state 5
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | [task] task_state=ABORTED for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 from handle_exited_app
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | Computation for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 finished
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4_0 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 absent
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | Output file cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4_1 for task cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 absent
Sa 26 Okt 2013 02:28:00 CEST | RNA World | [task] result state=COMPUTE_ERROR for cmsvm_GA-p[e20-30MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000427.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1349111823_42560_4 from CS::app_finished
Code: Alles auswählen
Fr 25 Okt 2013 15:06:52 CEST | Test4Theory@Home | Requesting new tasks for CPU
Fr 25 Okt 2013 15:06:52 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] CPU work request: 178152.71 seconds; 0.32 devices
Fr 25 Okt 2013 15:06:52 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] NVIDIA work request: 0.00 seconds; 0.00 devices
Fr 25 Okt 2013 15:06:54 CEST | Test4Theory@Home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
Fr 25 Okt 2013 15:06:54 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] Server version 701
Fr 25 Okt 2013 15:06:54 CEST | Test4Theory@Home | No tasks sent
Fr 25 Okt 2013 15:06:54 CEST | Test4Theory@Home | Nachricht vom Server: Test4Theory vboxwrapper needs 484.12MB more disk space. You currently have 7145.27 MB available and it needs 7629.39 MB.
Fr 25 Okt 2013 15:06:54 CEST | Test4Theory@Home | Project requested delay of 7 seconds
Sa 26 Okt 2013 02:29:39 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] Starting scheduler request
Sa 26 Okt 2013 02:29:39 CEST | Test4Theory@Home | Sending scheduler request: To fetch work.
Sa 26 Okt 2013 02:29:39 CEST | Test4Theory@Home | Requesting new tasks for CPU
Sa 26 Okt 2013 02:29:39 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] CPU work request: 324931.68 seconds; 0.32 devices
Sa 26 Okt 2013 02:29:39 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] NVIDIA work request: 0.00 seconds; 0.00 devices
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | Scheduler request completed: got 1 new tasks
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] Server version 701
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | Project requested delay of 7 seconds
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | [task] result state=NEW for wu_1382529735_3128_0 from handle_scheduler_reply
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] estimated total CPU task duration: 68210 seconds
Sa 26 Okt 2013 02:29:40 CEST | Test4Theory@Home | [sched_op] estimated total NVIDIA task duration: 0 seconds
Sa 26 Okt 2013 02:29:41 CEST | Test4Theory@Home | [task] result state=FILES_DOWNLOADING for wu_1382529735_3128_0 from CS::update_results
Sa 26 Okt 2013 02:29:42 CEST | Test4Theory@Home | [task] result state=FILES_DOWNLOADED for wu_1382529735_3128_0 from CS::update_results
Sa 26 Okt 2013 02:33:31 CEST | Test4Theory@Home | [task] task_state=COPY_PENDING for wu_1382529735_3128_0 from start
Sa 26 Okt 2013 02:33:31 CEST | Test4Theory@Home | Starting task wu_1382529735_3128_0 using vboxwrapper version 15 (vbox64) in slot 12
-
- Admin
- Beiträge: 1920
- Registriert: 23.02.2010 22:12
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Das ist alles äußerst ungünstig das da jetzt plötzlich so viele Probleme auftauchen wo doch die Betatests zum Ende so gut gelaufen waren. Ich werde wohl erstmal das erzeugen von neuen Aufgaben anhalten.
Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung
Das dürfte im Wesentlichen das Virtual Disk Image Template sein, welches im \projects\www.rnaworld.de_rnaworld\ Datenverzeichnis liegt auch wenn keine Wutz läuft.Uwe Sänger Herzke hat geschrieben:aktuell sind es 6,9GB, und RNA belegt schon 0,8GB trotz fehlender Wutz.
Das wären ja mehr als 100 MB pro Stunde und damit um den Faktor 10 mehr Zuwachs pro Zeit als bei meinem leidigen stderr-Problemchen! Der <rsc_disk_bound> lag übrigens bei allen um den 20.10. von mir erhaltenen Wutzen bei 6 GB, bei der am 10.10. erhaltenen WU ursprünglich bei nur 2 GB. Wäre wirklich spannend zu wissen gewesen, welche Dateien in Deinem Slot so groß wurden.Uwe Sänger Herzke hat geschrieben:Freitagnachmittag um 3 waren also noch 7,1GB verfügbar neben der laufenden RNA, Samstagmorgen um halb 3 nicht mal mehr 5,7 insgesamt; seltsam.
Was die Neustartprobleme angeht, konnte ich auf meinem AMD FX und i7 erfolgreich neustarten, trotz 4 parallel laufender Wutzen bei nur 8 GB RAM auf dem FX. Habe den BOINC-Manager inkl. Anwendungen beendet, dann im Taskmanager geprüft, ob alles beendet wurde. VBoxSVC wurde nicht beendet. Dennoch Warmstart und dann BM manuell wieder gestartet (kein Autostart). Hat funktioniert soweit. Nach meiner Schätzung dürften nächste Woche die ersten VM Wutzen fertig werden (Bakterien natürlich). Bin mal gespannt, ob das was wird.