offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

[Matthias Lehmkuhl]

habe gestern ein cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.09 (vbox64) Result bekommen.
Eine positive Nachricht habe ich schon, der wrapper läuft jetzt auch mit boinc als Service Installation.
aktuell 3:30 Stunden Laufzeit bei 0,5%
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result. ... d=14923049

[Beorn]

Gibt es Pläne zu diesen Paketen neue Aufgaben mit der aktuellen 1.0.2 v1.06 Anwendung zu erzeugen?

Da diese WU noch nicht validiert wurde, gehe ich fest davon aus.

Michael.

Um nochmal auf diese Frage zurück zu kommen: Wie sieht denn die zeitliche Planung aus? Im Moment scheinen ja alle neuen 1.02 v1.09 Aufgaben im Umlauf zu sein und es sind nur ab und zu ein paar Resends verfügbar. Könnte man da nicht noch ein bißchen neue Arbeit aus den unvalidierten Paketen erzeugen?

[ChristianB]

Ich habe bereits den Großteil der Pakete ohne Resultate konvertiert und die sind in Arbeit. Es wird voraussichtlich morgen eine version 1.10 geben und dann auch wieder Testaufgaben dafür. Das ist erstmal die letzte Testversion des vboxwrapper bevor ein zentraler Bestandteil umgebaut wird. Was mit den bisher unvalidierten Ergebnissen mit dem 98,765% Bug passiert ist noch unklar da ich noch keine Strategie zur Zusammenführung (validierung) habe.

[Beorn]

Vielen Dank für die rasche Antwort und die Info zum aktuellen Stand. War mir nicht bewußt, dass die 'Crossvalidierung' mit der aktuellen Version ein größeres Problem darstellt, erinnere mich aber jetzt, dass Du dies bereits einmal im Forum angemerkt hattest...

[paparazzipeter]

Frage zum 98,765%-Bug : Gilt nach wie vor "weiterlaufen lassen", weil absehbar ein (positives) Ergebnis zu erwarten ist ? Oder sollten die WU's abgebrochen werden ?

[ChristianB]

Frage zum 98,765%-Bug : Gilt nach wie vor "weiterlaufen lassen", weil absehbar ein (positives) Ergebnis zu erwarten ist ? Oder sollten die WU's abgebrochen werden ?

Von den betroffenen Aufgaben sind nurnoch drei in Bearbeitung und die stehen unter Beobachtung. Um welche Aufgabe geht es denn?
Der 98,765%-Bug bezieht sich auf Aufgaben die direkt nach dem Start auf 98,765% springen. Bei Aufgaben wo dies erst später passiert ist es normal weil der Rechner langsamer ist als der forecast geschätzt hat.

[paparazzipeter]

Task 14922118 Paket 6330874; ging nach ca. 200 h erst auf 100% und danach auf 98,765%; Restlaufzeit erhöht sich tendenziell (sehr langsam ,z.Z ca. 4 h), indem es zyklisch runter und wieder etwas mehr rauf geht. Laufzeit z.T. bei ca. 360 h. Ich lasse die WU erst mal laufen, mal sehen, ob da was rauskommt.

[ChristianB]

Da ist alles in Ordnung. Die braucht halt nur etwas länger als geschätzt deshalb steht die jetzt bei 98,765% und keiner kann sagen wie lange noch.

[duftkerze]

15.12.2013 20:36:12 | RNA World | Aborting task cmsvm2_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_8: exceeded disk limit: 9992.87MB > 9536.74MB


und nu?

[ChristianB]

15.12.2013 20:36:12 | RNA World | Aborting task cmsvm2_GA-p[b-Lin64f-2]_1_Escherichia-fergusonii-ATCC-35469_CU928158.cir.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1358679723_865_8: exceeded disk limit: 9992.87MB > 9536.74MB


und nu?

Ist mir auch nicht ganz klar. Kann es sein das dein P:\ Laufwerk voll ist? In vielen Fällen konnte er keinen Snapshot anlegen weil angeblich die Platte voll ist. Wenn er es dann doch konnte dann wurde der ältere Snapshot nicht gelöscht und hat somit zusätzlich Plattenplatz belegt. Du bist da nicht der einzige aber die Fehermeldungen sehen immer anders aus und meistens kann der Snapshot nicht gelöscht werden.

[Matthias Lehmkuhl]

bei mir hat es heute einen cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.06 (vbox64) zerlegt.
ob das Result weitergelaufen (false negative) ist kann ich nicht genau sagen, vermute aber ja, weil die beendeten CPU Results anderer Projekte danach unter 80% CPU Nutzung liegen. Normal sind gut über 90% CPU Nutzung.
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result. ... d=14922180

Somit steht der Rechner wieder für ein neues Result mit aktuellem Wrapper zur Verfügung.

[ChristianB]

@Matthias: Dann müsstest du noch alle VBox Prozesse abschießen damit die jetzt unkontrollierte VM keine Leistung mehr zieht. Genug Arbeit müsste noch da sein um dann eine neue Aufgabe zu bekommen.