Projektgesamtfortschritt?

[Thomas R]

@Thomas: Die kommende Version von RNA World wird analog zu FAH MPI unterstützen. Will heißen, dass Du eine WU dort auf allen Kernen bearbeiten kannst.

In welchen Zeitdimensionen muss man sich denn das vorstellen?
Ein paar Monate? Ein Jahr? Mehrere Jahre?
Ich habe diesbezüglich keinerlei Vorstellung.

Du muß eigentlich nur folgendes machen: Im BOINC Manager stellst du auf Deiner Kiste ein, dass er nur 50% der CPUs nutzen soll. Dann sagst Du FAH, dass es ebenfalls nur 50% nutzen soll und dann würde ich erwarten, dass RNA World/FAH recht genau 50/50 gerechnet wird. Und FAH nimmt ja kaum RAM - war zumindest früher so.

Michael.

Dabei aber bitte immer bedenken, dass RNA World für jeden Kern eine WU zieht. Und für jede WU veranschlagen die großen WUs gut 2 GB RAM. 64-Bit ist aktuell daher fast schon Pflicht und das Gesamt-RAM müßte bei 64 Kernen mindestens (!) 128 GB betragen, damit man nicht böse Überraschungen erlebt. Besser wäre es da, die Zahl der für RNA World zugänglichen Kerne zu reduzieren und auf den anderen etwas anderes zu rechnen.

Michael.

Gut - soweit verstanden.
Sogar die Konfiguration müsste ich hinbekommen.
Aber ich lese hier immer was von WU verlängern.
Muss ich das dann immer kontrollieren ob die CPU die WU auch in der anberaumten Deadline schafft?

Bei mir beginnt in Kürze die Hauptsaison, sprich - 16 Stunden Tage.
Dann ist es mir unmöglich mich mit zu verlängernden WU´s auseinanderzusetzen.

[Dunuin]

Wenn die WUs ein paar Wochen brauchen, dann hast wenigstens einige Wochenenden Zeit zum gucken, was zu lange dauern könnte

[Michael H.W. Weber]

@Thomas: Die kommende Version von RNA World wird analog zu FAH MPI unterstützen. Will heißen, dass Du eine WU dort auf allen Kernen bearbeiten kannst.

In welchen Zeitdimensionen muss man sich denn das vorstellen?
Ein paar Monate? Ein Jahr? Mehrere Jahre?
Ich habe diesbezüglich keinerlei Vorstellung.

Kommendes Jahr.

Aber ich lese hier immer was von WU verlängern.
Muss ich das dann immer kontrollieren ob die CPU die WU auch in der anberaumten Deadline schafft?

Ja, bei einigen XXL WUs kämpfen wir mit dem Problem, dass es unmöglich ist, die exakte Laufzeit vorherzusagen. Deshalb kommt es immer mal wieder vor, dass die vorhergesagte Laufzeit zu kurz ist und der BOINC-Server dann eine falsche Abgabefrist (zu früh) ausgibt. Bei den WUs vom Typ Intron_gpI, RNase_MRP und rrn wissen wir dies. Sie fallen normalerweise sofort schon dadurch auf, dass sie hunderte Stunden (falsch) vorhergesagter Laufzeit ausweisen.

Bevor Du Dich ärgerst, nimm lieber ein anderes Projekt. RNA World ist momentan angesichts der Monster WUs nichts für schwache Nerven.

Michael.

[Thomas R]

Bevor Du Dich ärgerst, nimm lieber ein anderes Projekt. RNA World ist momentan angesichts der Monster WUs nichts für schwache Nerven.

Das ist mal eine grundehrliche Aussage!
Und sowas freut mich - wenn es dem Projekt kurzfristig auch nicht dient.

Ich werd das im kommenden Jahr sicher mitbekommen wenn die neue Version verfügbar ist.
Und da ich grundsätzlich dafür bin das "Hausprojekt" zu unterstützen, werd ich sicher dabei sein.

[yoyo]

Man muss aber auch dazu sagen, dass die Monster dann aber auch monstermäßige Credits abwerfen
yoyo

[Thomas R]

Wie ist der Stand?
Schon was passiert diesbezüglich?

Michael meinte ja dass was passieren würde im neuen Jahr!
Kein Nagel - nur eine Frage!!

Ich würde gerne bei F@H meine 100.000.000 voll machen.
Wenn RNA dann so läuft wie beschrieben, bin ich sofort dabei (und sogar vielleicht mehr).

[Michael H.W. Weber]

RNA World wird in Kürze ein Labor zur Verfügung haben.
Binaries für neue Apps sind auch schon im SVN abgelegt. Allerdings werde ich noch etwas brauchen, bevor wir damit rauskommen können. Ich habe u.a. vor, RNA World mittelfristig auch auf RNA-bindende Proteinstudien auszuweiten. Daran habe ich immerhin seit 1997 geforscht.
Das Labor muss neu aufgesetzt werden und das beansprucht mich derzeit voll und ganz.
Auch will ich die vorhandenen Ergebnisdaten jetzt erstmal in Form von Manuskripten zur Publikation einreichen, bevor wir die neuen Dinge von der Leine lassen. Details werde ich noch bekannt geben.
Auf jeden Fall wird es spätestens noch im Februar neue WUs (kleine) auf Basis des bestehenden Systems geben, um das aktuelle Arbeitsfeld abzuschließen. Ich wäre froh, wenn die noch im System steckenden fetten Mega-WUs abgearbeitet würden. Danach kann dann auf das neue System umgestellt werden. Allerdings sind diese WUs nach wie vor harte Brocken. Ich hatte bisher WUs mit vorausgesagten Laufzeiten von über 1000 Stunden abgelehnt, da ich nur ein Phenom II 955BE System von AMD habe und die Intel i7 da ganz anders zu Werke gehen. Seit 2013 aber habe ich das aufgegeben und rechne nun auch WUs mit bis zu 2000 Stunden vorhergesagter Laufzeit (die brauchen auf meiner Kiste erfahrungsgemäß auch mal das Doppelte der Prophezeihungslaufzeit!). Naja, einer muß sie ja wegknacken...

Michael.

[Thomas R]

Gibt es irgendwelche Neuigkeiten?

[Michael H.W. Weber]

Ich werkle gerade an der 3. RKN-Indien Kooperationsprojektpublikation, die mich doch seit Wochen schon etwas in Atem hält.
Dann muss ich mich um das RKN Buch kümmern. ENDLICH!
Danach will ich dann wirklich mal die halbfertigen RNA World Papiere angehen - habe das leider vernachlässigen müssen, da andere Dinge drücken.
An der Uni geht es mit den Labors voran, angeblich sollen die Restumbauten in 3 Wochen weitestgehend abgeschlossen sein - sagen wir also mal Ende Mai.
Auch scheint es seit letzter Woche wieder Bestrebungen zu geben, einen Hackerspace in MR einzurichten - woran ich bezügl. DIY Bilogy / Pipettierroboter, usw. sehr interessiert bin.
Schämen muss ich mich, dass noch nicht - wie angekündigt - kleine WUs im Umlauf sind. Das hängt mit einem Problem hier zu Hause zusammen, wo meine Möglichkeiten Linux zu nutzen gerade etwas limitiert sind. Brauche einfach einen neuen Laptop und hoffe, das bis Ende kommender Woche in den Griff bekommen zu haben.
Tja, und dann stehen noch die Berliner Linuxtage auf dem Plan - auch da muss noch allerlei getan werden und die Rückmeldung hier im Forum war doch mehr als frustrierend.

Michael.

[Ananas]

Dieser dynamische Credits-Multiplikator, den Yoyo eingebaut hat, macht zum Glueck etliche Fehlversuche wett. Vielleicht sollte man das als Ansporn nochmal irgendwo an einer auffaelligen Stelle propagieren, um die Motivation zu erhoehen, sich auch an die richtigen Monster-Dinger ranzutrauen.

Meine aelteste feiert bald 1-jaehriges und wenn Du wirklich zwischendurch mal "Klar Schiff" haben willst, muss irgendwas passieren.

[Michael H.W. Weber]

Die "Monster WU Hall of Fame" könnten wir auch auf der Mainpage nochmal ankündigen, was meint ihr?

Michael.

[Thomas R]

@Thomas: Die kommende Version von RNA World wird analog zu FAH MPI unterstützen. Will heißen, dass Du eine WU dort auf allen Kernen bearbeiten kannst.

In welchen Zeitdimensionen muss man sich denn das vorstellen?
Ein paar Monate? Ein Jahr? Mehrere Jahre?
Ich habe diesbezüglich keinerlei Vorstellung.

Kommendes Jahr.


Michael.

Ja gut - das "kommende" Jahr ist ja erst zur Hälfte rum.
Aber wie ist denn der Stand der Dinge.
Irgend ein Fortschritt diesbezüglich oder eine neue Zeitangabe?