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[Norman]

welche weiteren apps sind das außer der gromacs und was sollen die machen ?

[Michael H.W. Weber]

welche weiteren apps sind das außer der gromacs und was sollen die machen ?

Dafür ist es zwar eigentlich noch zu früh, da sie ja noch längst nicht in RNA World laufen, aber ganz kurz was sagen, kann ich schon: Sie dienen zur Vorhersage von RNA Sekundärstrukturen. Wenn wir mit Hilfe von Kovarianzmodellen RNAs suchen, dann passiert dies unter Kenntnis von RNA Basensequenz und Sekundärstruktur. Bisher haben wir existierende RNA Alignments benutzt, um RNAs der zugehörigen Familie in neu sequenzierten Organismen zu finden. Wir wollen nun eins drauf setzen und systematisch nach neuen RNA Familien schauen. Dazu benötigen wir unter anderem die Fähigkeit, einer RNA Sequenz eine Sekundärstruktur zuordnen zu können. Wir wollen zu Anfang zwei sich ergänzende Ansätze dazu nutzen, also zwei Applikationen.

Michael.