WU-SETS

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Re: WU-SETS

#229 Ungelesener Beitrag von Norman » 04.03.2011 20:03

zum glück hab ich noch ein paar introns am knuspern ;)

Tim92

Re: WU-SETS

#230 Ungelesener Beitrag von Tim92 » 10.03.2011 21:35

Nur eine kleine Anmerkung zu den neuen cmsearch 2, ich finde es schade, dass die Namensgebung der WU's geändert hat.
Ich fand es immer total spannend zu sehen, was für ein Tierchen man da gerade rechnet :P
Hat das einen praktischen Nutzen?

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Norman
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Re: WU-SETS

#231 Ungelesener Beitrag von Norman » 10.03.2011 21:42

weil in den cmsearch2 WU mehrere wutzen drin stecken können kann der fasta-name nicht mehr angezeigt werden.
ok! kann schon aber da verschiedene drin stecken können hat das keinen wirklichen nutzen mehr.
find das im übrigen auch immer interessant zu lesen was da gerade berechnet wird und manchmal haben die teile lustige namen :D

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Re: WU-SETS

#232 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 10.03.2011 22:57

Tim92 hat geschrieben:Ich fand es immer total spannend zu sehen, was für ein Tierchen man da gerade rechnet :P
Das ist ja auch einer der Gründe gewesen, warum wir damit recht ausführlich umgegangen sind. :D

Wir müssen mal Yoyo fragen, ob es einen technischen Grund gibt, der verhindert, daß die Namen in den Kombinationspaketen (cmsearch2) nicht angezeigt werden können oder ob man die vielleicht doch auch da anzeigen lassen kann.

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Re: WU-SETS

#233 Ungelesener Beitrag von mxplm » 11.03.2011 00:28

Die Titel der WUs können nicht beliebig lang sein, da die Files in BOINC teilweise nach der WU benannt werden. Pfad+Filename wiederum dürfen nicht zu lang sein, weil ein häufig genutztes OS damit teilweise nicht klar kommt.

Beispiel für ein Eingabefile:

Code: Alles auswählen

cms_GA-p[BR-Lin64s]_Baumannia-cicadellinicola-str.-Hc-(Homalodisca-coagulata)_CP000238.lin.EMBL_RF01192_SNORD11B_1299013840_99020-in.zip
Jetzt stellt euch vor da stünden zwanzig lateinische Namen drin ;)

Eine bessere Stelle um alle Namen anzuzeigen wäre der Bildschirmschoner.
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Re: WU-SETS

#234 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 11.03.2011 01:31

mxplm hat geschrieben:Die Titel der WUs können nicht beliebig lang sein, da die Files in BOINC teilweise nach der WU benannt werden. Pfad+Filename wiederum dürfen nicht zu lang sein, weil ein häufig genutztes OS damit teilweise nicht klar kommt.
Ja, ist bekannt - stört aber nicht weiter. Frage ich mich jetzt, wieso es beim Zusammenlegen der WUs plötzlich stört? Das ganze Hin- und Herbenennen ist doch auch aufwändig (die Ergebnisfiles haben dann am Ende ja wieder den richtigen, langen Namen). :wink:

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Re: WU-SETS

#235 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.03.2011 06:24

In der WU stecken z.B. 5 *.fasta und 5 *.cm die alle miteinander berechnet werden. Was soll denn da jetzt bitte im wu Namen auftauchen?
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Re: WU-SETS

#236 Ungelesener Beitrag von mxplm » 11.03.2011 07:15

Michael H.W. Weber hat geschrieben:
mxplm hat geschrieben:Die Titel der WUs können nicht beliebig lang sein, da die Files in BOINC teilweise nach der WU benannt werden. Pfad+Filename wiederum dürfen nicht zu lang sein, weil ein häufig genutztes OS damit teilweise nicht klar kommt.
Ja, ist bekannt - stört aber nicht weiter.
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Re: WU-SETS

#237 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.03.2011 22:59

Ich hab den Namen des ersten fasta Files jetzt mit in den WU-Namen eingebaut. Damit sieht man wieder wie (zumindest eines) der Viehcher heisst. Gilt dann aber erst für wu-s, die demnächst gebaut werden.
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Re: WU-SETS

#238 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 14.03.2011 17:23

mxplm hat geschrieben:
Michael H.W. Weber hat geschrieben:
mxplm hat geschrieben:Die Titel der WUs können nicht beliebig lang sein, da die Files in BOINC teilweise nach der WU benannt werden. Pfad+Filename wiederum dürfen nicht zu lang sein, weil ein häufig genutztes OS damit teilweise nicht klar kommt.
Ja, ist bekannt - stört aber nicht weiter.
Doch, denn wenn der Name der WU zu lang ist, dann kann dieses OS sie nicht bearbeiten.
Ja, ist wie gesagt bekannt, stört aber nicht wirklich, da es vielleicht alle paar Millionen WUs mal vorkommt. Bei mir kam es z.B. ein einziges Mal in der gesamten Zeit seit RNA World existiert vor (inkl. Vorabtestphase).
yoyo hat geschrieben:In der WU stecken z.B. 5 *.fasta und 5 *.cm die alle miteinander berechnet werden. Was soll denn da jetzt bitte im wu Namen auftauchen?
Dieselben Namen, wie bei den nichtgebündelten WUs, hatte ich gehofft.

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Re: WU-SETS

#239 Ungelesener Beitrag von yoyo » 14.03.2011 17:41

Ich glaube ihr begreift das nicht richtig:

Früher
- war in einer WU eine fasta und eine cm. Daher war der wu name im wesentichen:
- <archiv>_<fasta>_<cm>

Jetzt
- sind in einer WU mehrere fasta und cm. Daher würde eine wu dann so heißen, wenn dort 25 (ehemalige) mini wus drin sind:
- <archiv>_<fasta1>_<cm1>_<fasta1>_<cm2>_<fasta1>_<cm3>_<fasta1>_<cm4>_<fasta1>_<cm5>_<fasta2>_<cm1>_<fasta2>_<cm2>_<fasta2>_<cm3>_<fasta2>_<cm4>_<fasta2>_<cm5>_<fasta3>_<cm1>_<fasta3>_<cm2>_<fasta3>_<cm3>_<fasta3>_<cm4>_<fasta3>_<cm5>_<fasta4>_<cm1>_<fasta4>_<cm2>_<fasta4>_<cm3>_<fasta4>_<cm4>_<fasta4>_<cm5>_<fasta5>_<cm1>_<fasta5>_<cm2>_<fasta5>_<cm3>_<fasta5>_<cm4>_<fasta5>_<cm5>

Und jetzt setzt für <fastaN> noch die entsprechenden Namen ein und ihr seht wie gigantisch lang der WU Name würde.

Daher kommt das alles nicht in den WU Namen rein!!!!

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Re: WU-SETS

#240 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 14.03.2011 17:54

So etwas in der Art hatte ich schon befürchtet.

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