WU-SETS

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Norman
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Re: WU-SETS

#205 Ungelesener Beitrag von Norman » 18.02.2011 00:25

WOW! das ist mal sehr interessant. (geil) ;)

nunja, ich denke 30min-2h ohne checkpoints kann wohl fast jeder verschmerzen, ohne gleich zu explodieren, falls der rechner abschmiert und der server wird natürlich auch dabei geschont.
bei races würde ich eher 1.5-3h WU anleihern, da hier gewaltig was auf uns zu kommen wird, und ihr/du schon da was koordiniert was anzetteln könntet.
da ist für jeden was dabei könnte man sagen.

was heisst "veraltete cmc-version" ?
das hat nix mit den cmc-apps zu tun, sondern mit was anderem. ?!
die apps funktionierten ja soweit ganz prima oder ?!
fehlerhafte input etwa und evtl. verbugt ? (das wäre übel)

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Txt.file

Re: WU-SETS

#206 Ungelesener Beitrag von Txt.file » 18.02.2011 11:21

klingt doch mal sehr gut, was du so schreibst, michael. ich hoffe dass weiterhin alles so reibungslos wie möglich läuft

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Michael H.W. Weber
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Re: WU-SETS

#207 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.02.2011 22:25

Norman hat geschrieben:was heisst "veraltete cmc-version" ?
Nein, ich meinte damit, dass leider nicht Tilmans neue Kompilierungen eingesetzt wurden.

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Re: WU-SETS

#208 Ungelesener Beitrag von Norman » 18.02.2011 22:34

achso! ja das macht ja nix, weil der code ja der selbe ist und nur abbrüche durch den compiler-bug bei diversen intron_qpI aufgetreten sind.
das sollte mit der richtigkeit der ergebnisse garnix zu tun haben.
bei den cms war es ja das gleiche problem. alles andere was validiert worden ist war in ordnung nehme ich an?!
der code war ja up to date und die rfam10.0 sollte man deswegen nicht nochmal durchnudeln ;)

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Re: WU-SETS

#209 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.02.2011 22:39

Norman hat geschrieben:achso! ja das macht ja nix, weil der code ja der selbe ist und nur abbrüche durch den compiler-bug bei diversen intron_qpI aufgetreten sind.
das sollte mit der richtigkeit der ergebnisse garnix zu tun haben.
bei den cms war es ja das gleiche problem. alles andere was validiert worden ist war in ordnung nehme ich an?!
der code war ja up to date und die rfam10.0 sollte man deswegen nicht nochmal durchnudeln ;)
Das Problem an Deinem Satz ist das Wort "sollte". Dieses Wort muß ich als Wissenschaftler leider aus meinem Wortschatz ausschließen. 8) Und Nein, es besteht nicht unbedingt die Chance, die Ergebnisse außerhalb von Laboruntersuchungen auf Richtigkeit zu überprüfen - abgesehen davon, dass sie hier im Rahmen unseres Projekts von zwei unabhängigen Maschinen übereinstimmend gefunden wurden (was allerdings ein erhebliches Sicherheitsgefühl bei mir weckt).

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Re: WU-SETS

#210 Ungelesener Beitrag von yoyo » 19.02.2011 23:44

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Wir sind jetzt erstmal "kurz davor", leer zu laufen.
Was ist mit den Archiven im TODO Ordner?
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Re: WU-SETS

#211 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 20.02.2011 01:28

yoyo hat geschrieben:Was ist mit den Archiven im TODO Ordner?
Das sind parametrisierte Archive. Die habe ich uns bislang erspart, da dabei zum Teil enorme Ergebnisdateigrößen (bis zu 50 GB pro Archiv hatten wir da schon gehabt) anfallen und wir bis vor kurzem noch ganz gut Plattenplatzmangel hatten. Die können aber reingeschoeben werden, bevor wir leer laufen. Aber die Eukaryonten bitte erstmal außen vor lassen und die Archive mit dem "s" anstelle des "f" bevorzugt reinladen. Möchte nicht schon wieder "Intron_gpI-Stress" erzeugen... 8)

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#212 Ungelesener Beitrag von Norman » 20.02.2011 01:32

hau rein als "betawork" :evil2: .. platz frei, arbeitshunger etc. pp. ;)
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#213 Ungelesener Beitrag von yoyo » 20.02.2011 10:47

Welche sind denn die Euateronen Archive, die ich aussen vorlassen soll?
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Re: WU-SETS

#214 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 21.02.2011 00:47

Ich habe die Archivwarteschlange im Auge und stelle die parametrisierten ein, bevor wir leerlaufen. Gucke täglich rein, ok? Ist so wohl am einfachsten. :D

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Re: WU-SETS

#215 Ungelesener Beitrag von yoyo » 21.02.2011 09:29

Besser Du stellst sie früher rein, damit sie noch geforcastet werden können bevor sie erzeugt werden.
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Re: WU-SETS

#216 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 21.02.2011 16:56

Momentan sind ja noch 8 Archive in der Warteschlange.

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