Hallo
Was ist denn der Unterschied zwischen Rosetta@home und Robetta ???
Kann mir das mal jemand auf Deutsch erklären. Mit der Beschreibung auf Rosetta@home kann ich nichts anfangen.
Danke Bommer
Was ist da der Unterschied ???
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VadderSchlumpf
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Hallo!
So wie ich das verstanden habe ist Rosetta der Algorithmus, der die Proteinstrukturvorhersagen macht. Robetta ist der Server auf dem später die berechneten Strukturen vorliegen, auf die dann alle Wissenschaftler und Interessierte zugreifen können.
Übersetzungen der Hintergrundinfos von Rosetta@home:
http://www.rechenkraft.net/wiki/index.p ... intergrund
Da müsste das auch irgendwo stehen.
vaddi
So wie ich das verstanden habe ist Rosetta der Algorithmus, der die Proteinstrukturvorhersagen macht. Robetta ist der Server auf dem später die berechneten Strukturen vorliegen, auf die dann alle Wissenschaftler und Interessierte zugreifen können.
Übersetzungen der Hintergrundinfos von Rosetta@home:
http://www.rechenkraft.net/wiki/index.p ... intergrund
Da müsste das auch irgendwo stehen.
vaddi
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tralala
So wie ich das verstanden habe sieht es so aus:
Rosetta heißt die Software mit der die Proteinstrukturen berechnet werden. Rosetta@home testet diese Software an bekannten Proteinen, testet neue Vorhersagemethoden und dient Bakerlab als Supercomputer um in CASP7 die Strukturen von bislang unbekannten Proteinen vorherzusagen.
Robetta ist ein automatisierter Server, der vermutlich aus einem kleinen Cluster besteht, auf dem Rosetta läuft. Im Prinzip glaube ich, ist Robetta eine art mini-rosetta@home. Auch hier läuft Rosetta nur eben auf viel weniger CPUs, dafür aber lokal und spuckt Resultate nach Stunden bis Tagen aus. Robetta nimmt auch an CASP7 teil aber in der Kategorie Server Prediction. Server Prediction sind automatisierte Strukturvorhersagen, die innerhalb drei Tagen eingereicht werden müssen. Die zweite Kategorie ist human expert prediction und hier nimmt Rosetta@home teil. Das Bakerlab Team schaut sich nämlich die BOINC-Ergebnisse an und sendet demenstprechend neue WU raus, modifiziert die, vergleicht die etc. Rosetta@home ist für die eben ein ständig verfügbarer Supercomputer um ihre Vorhersagen zu verfeinern.
Die server predictions sind viel ungenauer und treffen die richtie Struktur nur ab und an (zu wenig Rechenpower und keine Möglichkeit zusätzliche Informationen in die Ergebnisinterpretation einfließen zu lassen).
Rosetta heißt die Software mit der die Proteinstrukturen berechnet werden. Rosetta@home testet diese Software an bekannten Proteinen, testet neue Vorhersagemethoden und dient Bakerlab als Supercomputer um in CASP7 die Strukturen von bislang unbekannten Proteinen vorherzusagen.
Robetta ist ein automatisierter Server, der vermutlich aus einem kleinen Cluster besteht, auf dem Rosetta läuft. Im Prinzip glaube ich, ist Robetta eine art mini-rosetta@home. Auch hier läuft Rosetta nur eben auf viel weniger CPUs, dafür aber lokal und spuckt Resultate nach Stunden bis Tagen aus. Robetta nimmt auch an CASP7 teil aber in der Kategorie Server Prediction. Server Prediction sind automatisierte Strukturvorhersagen, die innerhalb drei Tagen eingereicht werden müssen. Die zweite Kategorie ist human expert prediction und hier nimmt Rosetta@home teil. Das Bakerlab Team schaut sich nämlich die BOINC-Ergebnisse an und sendet demenstprechend neue WU raus, modifiziert die, vergleicht die etc. Rosetta@home ist für die eben ein ständig verfügbarer Supercomputer um ihre Vorhersagen zu verfeinern.
Die server predictions sind viel ungenauer und treffen die richtie Struktur nur ab und an (zu wenig Rechenpower und keine Möglichkeit zusätzliche Informationen in die Ergebnisinterpretation einfließen zu lassen).
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Uwe Sänger Herzke
- Block-Bunkerer
- Beiträge: 1326
- Registriert: 31.05.2006 14:33
- Wohnort: Bremen
- Kontaktdaten:
Der Rosetta-Algoritmus wird auch von WCG verwendet im Human Proteome Folding Projekt.
Grüße vom Sänger
