Rosetta - Fehler beim Berechnen

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Jürgen
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Rosetta - Fehler beim Berechnen

#1 Ungelesener Beitrag von Jürgen » 17.03.2022 00:07

Nach längerer Pause wollte ich wieder Rosetta rechnen.
Allerdings läuft keine einzige WU, alle brechen nach ca. 1 min mit "Fehler beim Berechnen" ab.

Code: Alles auswählen

ERROR: Error in simple_cycpcp_predict app read_sequence() function!  The minimum number of residues for a cyclic peptide is 4.  (GenKIC requires three residues, plus a fourth to serve as an anchor).
ERROR:: Exit from: src/protocols/cyclic_peptide_predict/SimpleCycpepPredictApplication.cc line: 2264
Scheint auch bei anderen Usern so zu sein...
Jürgen
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gemini8
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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#2 Ungelesener Beitrag von gemini8 » 17.03.2022 07:34

Auf meinem 3700x läuft keine einzige, und auf dem 2700 bricht keine einzige ab.
Auf beiden Rechnern läuft Ubuntu 20; auf dem 2700 ist ältere Arbeit.
Es scheint mir, als hätten die (neueren) preetham Dinger ein Problem.
Gruß, Jens
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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#3 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 17.03.2022 13:52

Ich probiere mal aus, was bei Kolossus passiert....

Edit: Die erste Meldung, die ich bekam, war, dass keine VirtualBox installiert sei.
Da ich nicht weiß, wie diese zu installieren und zu konfigurieren ist, bin ich da leider heraus, sorry...
Gruß Harald

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Stiwi
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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#4 Ungelesener Beitrag von Stiwi » 17.03.2022 14:01

Kolossus hat geschrieben:
17.03.2022 13:52
Ich probiere mal aus, was bei Kolossus passiert....

Edit: Die erste Meldung, die ich bekam, war, dass keine VirtualBox installiert sei.
Da ich nicht weiß, wie diese zu installieren und zu konfigurieren ist, bin ich da leider heraus, sorry...
Da muss nicht viel konfiguriert werden. Einfach das entsprechende Paket laden:
https://boinc.berkeley.edu/download.php

Und ggf. im Bios CPU-Virtualisierung aktivieren.

Aber persönlich bin ich bei VirtualBox Projekten auch raus. Kenne keins was nicht ab und zu Probleme macht.
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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#5 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 17.03.2022 14:21

Stiwi hat geschrieben:
17.03.2022 14:01
......Aber persönlich bin ich bei VirtualBox Projekten auch raus. Kenne keins was nicht ab und zu Probleme macht.
Ja, auch ich traue dem Braten nicht, mir ist das Programm irgendwie immer schon suspekt gewesen :uhoh:
Gruß Harald

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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#6 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 17.03.2022 16:28

Nachtrag:
Es sind trotz fehlender VirtualBox WUs heruntergeladen und gerechnet worden.
Allerdings wurden alle zu unterschiedlichen Zeiten mit Rechenfehler abgebrochen.

Noch´n Nachtrag:
Ich habe neugieriger Weise VirtualBox installiert und gestartet bekommen (Hört, hört!)
Danach bekam ich vom Server (Rosetta??) die Message, dass mein Prozessor den benötigten Befehlssatz nicht unterstützt. Isset nich herrlich? Bild
Das war es dann mit Rosetta
Gruß Harald

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Erbitte Hilfe SiDock@home Request information

#7 Ungelesener Beitrag von Gunther » 18.03.2022 12:01

Ich komme nicht weiter mit dem BOINC Manager. Ohne mein Zutun erscheinen in "Projekte" Eintragungen und dann in "Aufgaben" und verschwinden dann wieder.
Zur Zeit ist in "Aufgabe" nur SiDock@home. Ich bringe es nicht zum Laufen; im BOINC-Bildschirmschoner erscheint "No running tasks".

Wie bediene ich den BOINC Managager korrect? Gibt es dazu Text?

Rquest information concerning proper use of Boinc Manager ; ist there a manual anywhere?
Zuletzt geändert von Gunther am 20.03.2022 13:15, insgesamt 2-mal geändert.

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Re: Erbitte Hilfe SiDock@home

#8 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 18.03.2022 13:08

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Gruß Harald

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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#9 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 21.03.2022 07:20

Hallo zusammen,
da Rosetta in der derzeitigen Version bei mir nicht läuft, wollte ich das Projekt bei mir aus Boinc entfernen.
Aber Pustekuchen! Die Schaltfläche mit der Aufschrift entfernen ist ausgegraut und nicht anwählbar.
Wie bekomme ich trotzdem das Projekt entfernt?
Gruß Harald

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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#10 Ungelesener Beitrag von gemini8 » 21.03.2022 09:55

Nutzt du einen Projektmanager?
Falls ja, musst du Rosetta entweder über diesen oder dich in Boinc vom Projektmanager abmelden.
Ansonsten würde ich versuchen, das Projekt zurückzusetzen und es dann zu entfernen.
Grundsätzlich könntest du aber auch einfach warten, bis Rosetta wieder für dich sinnvolle Arbeit hat und die vbox-Applikation deaktivieren.
Gruß, Jens
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Re: Rosetta - Fehler beim Berechnen

#11 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 21.03.2022 10:09

Super! Hat funtionuckelt! Danke dir!
Ob Rosetta irgendwann wieder ohne VB arbeitet, steht erst einmal in den Sternen.
Dann kann ich es ja wieder laden.
Ist eigentlich schade, es ist mein erstes und ältestes Projekt, welches ich seit 2008 bedient habe.
Gruß Harald

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