Rosetta Python mit massivem HD-Speicheranspruch?

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Michael H.W. Weber
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Rosetta Python mit massivem HD-Speicheranspruch?

#1 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 16.10.2021 16:44

Ich musste gerade folgende Meldung entgegen nehmen, nachdem eine Maschine durch ungebeten untätiges Herumlümmeln auffiel:

Code: Alles auswählen

Rosetta@home: Notice from server
rosetta python projects needs 17415.49MB more disk space. You currently have 1658.00 MB available and it needs 19073.49 MB.
16.10.2021 15:57:44
:o

Hat jemand eine Idee, was dieses "rosetta python" neuerdings ist?

Michael.
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Jürgen
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Re: Rosetta Python mit massivem HD-Speicheranspruch?

#2 Ungelesener Beitrag von Jürgen » 16.10.2021 19:38

Python ist eine Programmiersprache, die vor allem im Unix-Umfeld verbreitet ist.
Möglicherweise habe die auf Python-Basis was entwickelt und die Windoof-Kisten kriegen eine kompelte virtuelle Maschine mit einer Unix/Linux-Umgebung 'drin, die dann als WU verschickt wird. Dann könnten 17Gb durchaus hinkommen ....
Jürgen
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Re: Rosetta Python mit massivem HD-Speicheranspruch?

#3 Ungelesener Beitrag von Kolossus » 16.10.2021 20:13

Jürgen hat geschrieben:
16.10.2021 19:38
....die Windoof-Kisten .....
Darüber müssen wir uns mal unterhalten..... :evil2:
Gruß Harald

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Re: Rosetta Python mit massivem HD-Speicheranspruch?

#4 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 17.10.2021 10:57

Tjo, das Python eine Programmiersprache ist, war mich wohl bekannt. :lol:

Mir ging es eher um die Frage, was das für WUs sind?
Rosetta hat - analog zu DeepMind's AlphaFold2 ja seit dem Sommer einen DeepLearning-Ansatz am Start - nennt sich RoseTTAfold und kann über ein Webinterface zum Modellieren eigener Proteine verwendet werden. Das Ganze nutze ich relativ häufig und weiss auch, dass die eingereichten WUs - analog zu unserem RNA World Pionier-Projekt in Sachen Job-Submission Interface (!) - auf der Rosetta@home Infrastruktur berechnet werden.
Ich hatte mich nun gefragt, ob dieses hiermit verknüpft ist.

Michael.
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