Docking@home - Neuigkeiten

[Michael H.W. Weber]

An dieser Stelle kurz eingeschoben: Wir sollten den Newsletter etwas professionalisieren. Er hat mir sehr gut gefallen und ich denke, wenn man regelmäßig etwas in dieser Art versendet, bindet man auch unsere Interessenten etwas besser ein. Ich wäre durchaus bereit, regelmäßiger etwas zu schreiben, allerdings würde ich gerne jemanden haben, der die Themen aussucht und auch die Infos dazu zusammensucht (Englisch kein Problem). Ansonsten wird es für eine Einzelperson zuviel Aufwand.

Ich habe für den [[Newsletter]] im wesentlichen ja auch Deinen Text genommen .

Ja sicher. Also das sollte jetzt auch kein Eigenlob sein. Ich war einfach ganz allgemein begeistert, in Sachen RKN Newsletter mal wieder was im Postfach zu haben und fand es so gut, dass ich das gerne regelmäßiger vorfinden würde (und dementsprechend auch etwas Zeit reinstecken würde).

Gut, daß Du all diese Dinge (hier den Newsletter) immer gleich alles ins Wiki packst. Ich denke, alle zwei bis drei Wochen könnte man schon was senden. Muß ja kein Roman sein. Im Gegenteil. Ich finde es besser, öfter was kurzes zu bekomen, als seitenlange Romane, die dann aus Zeitmangel nachher keiner mehr liest.

Michael.

[VadderSchlumpf]

Will heißen, daß man dort nur die Abfolge der Aminosäuren im Protein vorgibt und durch die Rechnungen am Ende die Proteinstruktur erhält. DF probierte ähnliches, hatte aber einen ganz anderen Ansatz (brute force).

Hallo!

Ich wollte mal fragen inwiefern Rosetta nicht "brute-force" ist. Eigentlich sieht das in der Rosetta-Grafik doch ziemlich ähnlich aus, wie früher in der Konsole bei DF. Es werden verschiedene Stellungen der einzelnen Faltungen ausprobiert und die Energie gemessen. Eine niedrigere Energie bedeutet soweit ich das verstanden habe eine wahrscheinlichere Faltung. Es wird so wie ich das ja sehe sowohl bei Rosetta als auch bei DF einfach Faltungen ausprobiert und die Energie gemessen.

Sehe ich das so richtig oder ist das eine falsche Beobachtung?

[Michael H.W. Weber]

Brute-force heißt nach meinem Verständnis, alles durchzutesten und dann aus statistischen Gründen darunter das richtige Ergebnis zu finden. Bei Rosetta ist das aber anders. Dort gibt es meines Wissens ein klares Regelwerk, das bei dem Falten berücksichtigt und über die Jahre verfeinert wird. Um es ganz genau zu sagen, müßte ich allerdings wirklich tiefer eintauchen in die Materie.

Michael.