Ist Boinc am Ende?

[Stiwi]

Also da kommt jetzt wieder so viel unwissenheit meinerseiits zustande aber in wie weit unterscheidet sich das denn zu Boinc Central?

Scientists:

Need high-throughput computing power and can't afford the high cost of commercial clouds? We may be able to help, by giving you access to thousands of computers at no charge. We provide computing to independent researchers as well as those from academic institutions.

We support any application packaged with Docker, as well as widely-used science applications like Autodock Vina from the Scripps Research Institute.

See video tutorials on using Autodock in BOINC Central.

[Michael H.W. Weber]

Also da kommt jetzt wieder so viel unwissenheit meinerseiits zustande aber in wie weit unterscheidet sich das denn zu Boinc Central?

BOINC Central hat kein Konzept, kein Projekt-Team, kein Ziel, keine Wissenschaftler an Bord.
Und ich sehe auch keinerlei App-Vielfalt (die wissen nicht einmal, was benötigt wird) und keine Job-Submission-Interfaces - also wozu und wie soll jemand das für eigene Forschungszwecke nutzen können?
Es wird dort derselbe Fehler gemacht, wie damals bei BOINC: Irgendwas entwickeln, den Leuten vor die Füße werfen und sich dann wundern, dass keiner was mitbekommt, geschweige denn nutzt.
Und: Wer hat eigentlich die Hand drauf? Wie lange wird da noch entwickelt (ist David nicht schon in Rente)? Wo stehen die Server (USA)?

Michael.

[Stiwi]

Also da kommt jetzt wieder so viel unwissenheit meinerseiits zustande aber in wie weit unterscheidet sich das denn zu Boinc Central?

BOINC Central hat kein Konzept, kein Projekt-Team, kein Ziel, keine Wissenschaftler an Bord.
Und ich sehe auch keinerlei App-Vielfalt (die wissen nicht einmal, was benötigt wird) und keine Job-Submission-Interfaces - also wozu und wie soll jemand das für eigene Forschungszwecke nutzen können?
Es wird dort derselbe Fehler gemacht, wie damals bei BOINC: Irgendwas entwickeln, den Leuten vor die Füße werfen und sich dann wundern, dass keiner was mitbekommt, geschweige denn nutzt.
Und: Wer hat eigentlich die Hand drauf? Wie lange wird da noch entwickelt (ist David nicht schon in Rente)?

Michael.

Also eigentlich ist aus meiner Sicht da auch alles vorhanden
Anmeldung für neues Zeug:
https://boinc.berkeley.edu/central/apply.php
Job Submission bspw:
https://boinc.berkeley.edu/central/show_apps.php
Dort stehen auch ein paar Wissenschaftler

Also vllt. kann man da ja irgendwie voneinander profitieren anstatt eine Konkurrenz aufzubauen

[Michael H.W. Weber]

Ich bin mir nicht sicher, ob Du den Wiki-Artikel gelesen hast, den ich oben verlinkt habe?
Da geht es schon noch um etwas mehr als "nur" ein paar Apps nutzbar zu machen - auch wenn das erstmal unser Start und Kerngeschäft ist.

Also eigentlich ist aus meiner Sicht da auch alles vorhanden

Es sind dort seit Jahren zwei Apps aus zwei völlig verschiedenen Themenbereichen vorhanden, eine davon in drei Varianten (Autodock).
Die lange publizierte GPU-Varainte derselben App (obwohl in WCG seit Jahren im Einsatz!) ist übrigens nicht darunter.
Bedeutet: Man hat dort mal zwei Apps integriert, vom Thema aber keine Ahnung und kann somit bei Fragen auch nichts beantworten, korrigieren oder sonstwas tun.

Es war leider immer eines der MEISTBEMÄNGELTEN Probleme bei allen BOINC-Projekten, dass seitens der Projektbetreiber nicht ausreichend kommunizert wird (wir brauchen nur hochscollen und lesen, was die Kollegen an Kritik üben - da findet man diesen Punkt mehrfach wieder).
Keine Bugbereinigung, keine Rückfragenbeantwortung zur Wissenschaft, keine Ergebniskommunikation.
Oder zumindest nur in homöopatischen Mengen.

Ich denke, RNA World ist da eine beinahe singuläre Ausnahme.
Warum das wohl so ist?
Weil hier Leute sitzen, die Dinge in ihrer Freizeit, also mit echtem Interesse machen und vom Fach kommen. Vom Fach im Sinne von jahrelanger praktischer Erfahrung im Teilnehmen an BOINC-Projekten. Wir wissen, wo der Schuh drückt und arbeiten nicht top-down oder - wie ich immer so schön sage - aus dem "Elfenbeinturm" heraus.

Anmeldung für neues Zeug:
https://boinc.berkeley.edu/central/apply.php

Ja, dort kann man Interesse bekunden, eine App einsetzen zu wollen.
Wie lange wird es wohl dauern, bis die integriert wird, wo sich doch in der Sache damit keiner dort auskennt - wir also das Problem haben, dass dort IT'ler sitzen, die nun plötzlich Wissenschaft können sollen?

Ich hatte es schon zu vielen Gelegenheiten beschrieben (wir sind ja häufig genug auch als Verein IRL unterwegs auf diversen Messen): Es gibt mittlerweile einen weiter boomenden Markt an Bioinformatik-/ComputationalChemistry-Clouddiensten, die alle recht viel rechnen, aber selten verstehen wovon man spricht, wenn man ihnen mitteilt, dass ihre Ergebnisse nicht in Ordnung sind, weil die Software nicht ordentlich aufgesetzt wurde.
Wie soll ein Dockerspezialist auch verstehen, was die zwei DINA4-Seiten Programmparameter bewirken / bedeuten, die man heutzutage bei gen. AI-Tools z.B. zum ProteinDesign an das Programm übergibt? Dazu müßte man die begleitende Fachpublikation nicht nur fleissig auf der Tool-Seite verlinken, sondern sie auch gelesen und verstanden haben.

Job Submission bspw:
https://boinc.berkeley.edu/central/show_apps.php
Dort stehen auch ein paar Wissenschaftler

Ja, muss man sich erst registrieren. Habe ich gerade getan, um mir das Interface mal anzuschauen...
Die Leute die da stehen sind vermutlich diejenigen, die die App angefragt haben. Ob die jetzt reagieren, wenn ich die in der Sache mal anschreibe, um Fragen zu klären?

Also vllt. kann man da ja irgendwie voneinander profitieren anstatt eine Konkurrenz aufzubauen

Ich bin immer gerne bereit, Dinge kooperativ anzugehen - ich fürchte allerdings, da wird inhaltlich nicht viel kommen und habe inzwischen leider angesichts der aktuellen Entwicklungen in den USA Bedenken zumindest bezügl. des Serverstandorts.
Das ist aber auch nicht schlimm, mir reicht ja die kontinuierliche Entwicklung von BOINC mit dem Containerunterstützungsansatz.

Michael.

[Michael H.W. Weber]

Nachtrag:

Job Submission bspw:
https://boinc.berkeley.edu/central/show_apps.php
Dort stehen auch ein paar Wissenschaftler

Ja, muss man sich erst registrieren. Habe ich gerade getan, um mir das Interface mal anzuschauen...

Habe inzwischen von Vitalii die Freigabe bekommen und finde nun einen neuen Bereich im BOINC Central Account Namens "Job Submission" - eine Übernahme unseres Ansatzes aus RNA World von vor >10 Jahren. Sehr schön - da haben Menschen bemerkt, dass wir interessante Dinge tun.

Ich dachte, da starte ich jetzt mal schnell eine Autodock-WU.
Pustekuchen.
Und das obwohl ich mich mit MolecularDocking nun wirklich etwas auskenne...

Die Parameterseite ist nicht nur völlig undokumentiert, sondern enthält Bezeichner, an die ich mich nicht erinnern kann, dass sie von den Autodock-Entwicklern je erwähnt worden wären.
Ich finde dann nach einigem Kramen eine Videotutorialseite, mit der selbst ein Profi nichts ans Laufen bekäme.
Schaut es euch ruhig selbst einmal an, es dauert keine 3 Minuten bis zum Aus.

Nach weiterem Kramen im Netz fand ich dann im BOINC GitHub Repo immerhin ein paar Beispieldateien.
Die wollen nun seziert werden.

Kurz:
Wir wissen nun, warum da nie jobs in der Pipleine sitzen...
Es krankt exakt an den gleichen Dingen, die ich oben im Zusammenhang mit den CloudComputing-Diensten erwähnte.
Übrigens: Docker ist nicht erforderlich.

Eine Infrastruktur für JobSubmission-Interfaces ist zumindest da - das ist doch schon mal nützlich.

Michael.

[Michael H.W. Weber]

Update:

Nach weiterem Kramen im Netz fand ich dann im BOINC GitHub Repo immerhin ein paar Beispieldateien.
Die wollen nun seziert werden.

...erledigt.

Fazit:
Es funktioniert einfach gar nichts.

Obwohl ich die beiden Beispieldateien (eine Protein- und eine Wirkstoff-Datei im .pdbqt-Dateiformat) mit externen Tools erfolgreich auf integrität geprüft habe, kam schon beim Absenden der Eingabedaten eine Fehlermeldung vom PHP-Webinterface.
Trotzdem tauchten die Testjobs dann in meiner persönlichen Warteschlange auf - man kann einstellen, ob die Jobs aufs Grid gesandt oder von den eignenen Maschinen berechnet werden sollen und ich hatte letzteres gewählt, um sicherzustellen, dass sie auch berechnet werden und um zu schauen, was da lokal an Daten angelegt wird.
Die von mir extra bereitgestellte Maschine erhielt aber keinen einzigen Job.
Und der Serverstatus verriet auch, dass keine Autodock-Jobs verfügbar sind.

Ich habe gleich alle drei Autodock-Varianten gestetet, alles per Screenshots dokumentiert und den Entwicklern zukommen lassen.

Michael.

[Stiwi]

Ok das klingt ja nicht gut. Mal schauen wie schnell oder ob sie überhaupt reagieren. Auf jedenfall super dass du es testest und probleme meldest

[MWF]

[insert technical explanation here]

Also ich merke in diesem Thread, dass ich von all dem keine Ahnung habe. Offensichtlich ist es doch eine Menge, die man beim Aufsetzen so eines Projekts beachten muss.

Trotzdem denke ich mir, dass die Idee doch eigentlich ganz simpel ist. Und irgendwie sehe ich nicht, dass es da Hürden oder gegensätzliche Interessen gibt, die nicht lösbar sein sollen.

Ich als Nutzer will:

• den Client herunterladen & installieren
• mich ggf. anmelden
• Projekt(e) auswählen (inkl. Verlinkung auf Projekt-HP)
• auswählen, wann welches Projekt mit wieviel Power gerechnet werden soll
• den Fortschritt der Arbeitspakete bewundern
• Punkte kriegen und mich vergleichen (Projekt-HP)
• wissen, wie das Projekt vorangeht
• ab und zu den Client automatisch updaten lassen

Server- und projektseitig gibt es natürlich ein Myriade an weiteren Bedürfnissen - aber ich sehe nicht, dass der Nutzer irgendwo Abstriche machen sollte.

BOINC als Software ist okay. Aber allein schon die Meldung mit Docker ist doch schlecht umgesetzt. Welche Projekte brauchen das? Wieso muss ich das separat installieren?
Man braucht unbedingt ein paar doofe Nutzer, die das vorher testen und Feedback geben... aber daran scheitern auch Multimilliardenkonzerne....

[Kolossus]

Mir ist aufgefallen, dass bei der aktuellen „Bambus-Challenge“ bei Primegrid etliche Teams fehlen, die man ansonsten gesehen hat:
Scotch-Boinc Team, NoTeam,.....
Was soll man da sagen?

[thorsam]

Ab 1.11. wäre ich quasi in Vollzeit bereit, als IT-nutzender Forscher daran mitzuwirken, dass Rechenkraft.net sowas aufsetzt.
Ein potenter 64-kerniger Epyc-Server steht Dank des Planet3DNoW!-Teams einsatzfähig für uns bereit.
Das Projekt soll CitizenPharma heissen - der Name ist Programm und ein Konzept dafür ist im Aufbau.
Brauche dazu aber ein bis zwei Leute, die Spass daran haben, ein anständiges BOINC-Serverkonzept auf Podman-Basis mit angeschlossenen Ergebnisdatenbanken auszuarbeiten und in die Praxis umzusetzen - wo wir dann am Ende auch RNA World hinein migrieren und mit zig neuen Apps massiv ausbauen.

Ich bin davon überzeugt, dass wir damit Geschichte schreiben können.

Michael.

Genau genommen ist es ein Server-Board mit 2x 64 Kernen, 512 GB RAM und 2x Samsung 990 Pro 2 TB. Je nachdem welches RAID gefahren werden soll.
Die Internetanbindung habe ich gerade vorsorglich von 150/75 MBit/s auf 300/150 MBit/s raufgesetzt.

[Michael H.W. Weber]

Michael.

[Yeti]

Mir ist aufgefallen, dass bei der aktuellen „Bambus-Challenge“ bei Primegrid etliche Teams fehlen, die man ansonsten gesehen hat:
Scotch-Boinc Team, NoTeam,.....
Was soll man da sagen?

Bzgl. NoTEAM kann ich Dir sagen, daß wir alle keine Primegrid-Fans sind und deswegen meistens auf die Original-Primegrid-Races verzichten, Ausnahmen bestätigen die Regel

Nicht mehr und nicht weniger steckt dahinter

Yeti