SIMAP (beendet)/br

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SIMAP (Similarity Matrix of Proteins, pt: matriz de similaridade de proteínas) é um banco de dados para homologias calculadas de seqüências de proteínas e fornece ferramentas de consulta especializadas pronto para usar os dados de forma eficaz. Para mais de 4 milhões de seqüências de proteínas, a similaridade para cada par de duas seqüências deve ser calculada. Esta informação é importante porque a pesquisa médica sobre certas proteínas pode ser aplicada a seqüências de proteínas semelhantes. Por exemplo, muitos resultados da pesquisa genética com ratos são transferíveis para seres humanos.

Depois que o SIMAP foi capaz de processar os dados de inventário já existentes dos vários bancos de dados de proteína mais rapidamente do que se supunha anteriormente devido às otimizações do cliente, somente as atualizações precisam ser feitas em intervalos mensais. Isso significa que às vezes não há trabalho para este projeto. Novos unidades de trabalho são anunciados muito cedo na página inicial.

Mais informações estão disponíveis em nosso FAQ do projeto.

Ausführliche Audio-Beschreibung des Projekts: BOINCcast

O projeto terminou no fim de 2014.

Visão geral do projeto

SIMAP
Nome	SIMAP
Categoria	Bioinformatik/br
Destino	Cálculo da similaridade de seqüências de proteínas de acordo com o princípio FASTA
Comercial	não
Homepage	boincsimap.org/boincsimap (archive.org)

	Este projeto está sendo realizado na Áustria.

Status do projeto

Status do projeto
Status	terminado
Início	13.12.2005
Fim	fim de 2014

Links do projeto

• Projeto (archive.org)
• Download
• Fórum (archive.org)
• e-Library (RKN-Wiki)

FAQ do projeto

• Quem usa o SIMAP?
• O que é calculado?
• O SIMAP é público?
• Quem opera o SIMAP?

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Cliente

Sistemas Operacionais

	Windows
	Windows 64bit
	Linux
	Linux 64bit
	Android
	DOS
	MacOS X
	BSD
	Solaris
	HPUX
	AIX
	Tru64
	IRIX
	Java (independente do sistema operacional)

Informação sobre as unidades de trabalho

Nome	RAM	Duração	Tempo determinado	Memória	Download	Upload	Requisito mínimo
HMMER	45 MB	1:00 h (C2D 32bit 2,4 GHz)	8 Tage	11 MB	MB	0,05 MB	{{{mindestanforderung}}} oder besser
SIMAP	10 MB	0:45 h (AMDX2 32bit 3,0 GHz; C2D 32bit 2,4 GHz)	8 Tage	2 MB	1,8 MB	2,5 MB	{{{mindestanforderung}}} oder besser

A duração é o tempo médio de computação que é necessário na CPU correspondente (relógio entre parênteses).
O tempo determinado é o intervalo de tempo em que a unidade de trabalho deve ser calculado.

Versões publicadas

• 03.05.2007: HMMER 5.09 (Windows 64)

• 03.05.2007: 5.09 (Windows 64)

• 29.12.2006: 5.10 (Linux 64)

• 09.10.2006: HMMER 5.09

• 09.10.2006: HMMER 5.09

• 18.09.2006: HMMER 5.08

• 17.09.2006: HMMER 5.07

• 16.09.2006: HMMER 5.06

• 13.09.2006: HMMER 5.05

• 03.09.2006: HMMER 5.02

• 17.07.2006: 5.11 (nur Linux_x86)

• 12.07.2006: 5.10

• 21.06.2006: 5.09

• 19.06.2006: 5.08

• 17.01.2006: 5.07

• 15.01.2006: 5.06

• 21.12.2005: 5.05

• 19.12.2005: 5.04

• 13.12.2005: 5.03

Screenshots

Bisher zeigt der Client noch keine eigenen Grafiken bei der Berechnung an, die allgemeinen BOINC-Screenshots zeigen aber, wie der Client arbeitet. Wenn BOINC als Bildschirmschoner läuft, wird bei diesem Projekt das BOINC-Logo angezeigt.

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Notícias

• 11.11.2009: [ SIMAP - a comprehensive database of pre-calculated protein sequence similarities, domains, annotations and clusters]

• 16.07.2006: BOINCcast (Folge 13): Update zu SIMAP

• 22.04.2006: BOINCcast (Folge 7): SIMAP

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Controle de qualidade

Verificado: 29.10.2018

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