Genome Comparison
Das auf dem World Community Grid betriebene Genome Comparison Project war ein Distributed Computing Projekt welches versuchte, einen Abgleich zwischen den verschiedenen vorhandenen Proteindatenbanken vorzunehmen. Das Projekt ähnelte von seiner Zielsetzung her SIMAP@home, benutzte aber im Unterschied zu diesem nicht FASTA, sondern den Smith-Waterman-Algorithmus.
Am 29. Juni 2007 wurde angekündigt, dass das Projekt beendet werden wird. Die letzten neuen Work units wurden am 1. Juli herausgegeben; am 21. Juli 2007 endete das Projekt.
Für geleistete Rechenzeit werden sogenannte Badges vergeben :
Bronze | Silber | Gold | Rubin | Smaragd | Saphir | Diamant 5 | Diamant 10 | Diamanr 20 | Diamant 50 | Diamant 100 |
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14 Tage | 45 Tage | 90 Tage | 180 Tage | 1 Jahr | 2 Jahre | 5 Jahre | 10 Jahre | 20 Jahre | 50 Jahre | 100 Jahre |
Inhalt
Projektübersicht
Genome Comparison | |
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Name | Genome Comparison |
Kategorie | Bioinformatik |
Ziel | Abgleich von Proteindatenbanken |
Kommerziell | nein |
Homepage | worldcommunitygrid.org/projects_showcase/archives/fgc/viewFgcOverview.do |
Dieses Projekt wird in Brasilien durchgeführt. |
Projektstatus
Projektlinks
- Hintergrundinfos
- Anmelden
- FAQ
- Statistiken
- Fortschritt des Projekts
- Forum
- Genome Comparison im WCG-Wiki
Clientprogramm
Betriebssysteme
Windows | ||
Linux | ||
DOS |
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BSD | ||
Solaris | ||
Java (betriebssystemunabhängig) |
Client-Eigenschaften
Funktioniert auch über Proxy | |
Normal ausführbares Programm | |
Als Bildschirmschoner benutzbar | |
Kommandozeilenversion verfügbar | |
Personal Proxy für Work units erhältlich | |
Work units auch per Mail austauschbar | |
Quellcode verfügbar | |
Auch offline nutzbar | |
Checkpoints |
Installation
Das Projekt wird auf der Infrastruktur des World Community Grid betrieben, insofern muss nach Installation des WCG-Clients lediglich das Projekt im eigenen Profil aktiviert werden.
Genome Comparison benutzt die BOINC-Infrastruktur. Die Anmeldung, Installation und Konfiguration sind auf der allgemeinen BOINC-Seite beschrieben.
Screenshots
BOINC Grafik
Meldungen
- 29.06.2007: Genome Comparison project near completion
Projekte des World Community Grid |
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Aktiv: OpenPandemics · Africa_Rainfall_Project · Help Stop TB · Mapping Cancer Markers · Microbiome Immunity Project · Smash Childhood Cancer · FightAIDS@home_(beendet) (ab und zu ein paar WUs) |
Beendet: AfricanClimate@Home · Computing for Clean Water · Computing for Sustainable Water · Discovering Dengue Drugs - Together Phase I & II · Drug Search for Leishmaniasis · FightAIDS@home Phase I & II · Genome Comparison · GO Fight Against Malaria · Help Conquer Cancer · Help Cure Muscular Dystrophy Phase I & II · Help Defeat Cancer · Help Fight Childhood Cancer · Human Proteome Folding Project Phase I & II · Influenza Antiviral Drug Search · Nutritious Rice for the World · Say No to Schistosoma · The Clean Energy Project Phase I · Uncovering Genome Mysteries · The Clean Energy Project Phase II · OpenZika · Outsmart Ebola Together |