Rfam 10.0 - RNA World Leistungsfähigkeit
Verfasst: 14.08.2010 16:03
Heute habe ich pünktlich wie angekündigt den zweiten Satz CMCALIBRATE WUs der neusten Rfam (10.0) Datenbank eingespeist. Da sind ein paar anspruchsvolle dabei...
Zum Vergleich: Die Rfam-Betreiber benötigen meines Wissens zur Kalibrierung der Rfam 10.0 fünf Monate Rechenzeit ihres HPC Clusters. Wir haben nur einen winzigen Bruchteil unserer Maschinen auf die Kalibrierungen angesetzt - nämlich nur die aktiven (!) 64-Bit Linux Systeme. Nach etwa 12 Tagen war die Hälfte der Kalibrierungen bereits abgeschlossen. Und wir verwenden im Gegensatz zu Rfam die aller neuste INFERNAL Version. Man kann daran also sehen, dass RNA World - dessen Leistungsfähigkeit täglich zunimmt, wie auf unserer Serverstatusseite zu entnehmen ist - den professionellen Ansätzen mehr als nur gewachsen ist. Ich denke, dass ist eine ganz nette Feststellung zum Wochenende.
Michael.
Zum Vergleich: Die Rfam-Betreiber benötigen meines Wissens zur Kalibrierung der Rfam 10.0 fünf Monate Rechenzeit ihres HPC Clusters. Wir haben nur einen winzigen Bruchteil unserer Maschinen auf die Kalibrierungen angesetzt - nämlich nur die aktiven (!) 64-Bit Linux Systeme. Nach etwa 12 Tagen war die Hälfte der Kalibrierungen bereits abgeschlossen. Und wir verwenden im Gegensatz zu Rfam die aller neuste INFERNAL Version. Man kann daran also sehen, dass RNA World - dessen Leistungsfähigkeit täglich zunimmt, wie auf unserer Serverstatusseite zu entnehmen ist - den professionellen Ansätzen mehr als nur gewachsen ist. Ich denke, dass ist eine ganz nette Feststellung zum Wochenende.
Michael.