Neues Krebsprojekt bei WCG gestartet!

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bme

Neues Krebsprojekt bei WCG gestartet!

#1 Ungelesener Beitrag von bme » 02.11.2007 12:49

Welcome to the Help Conquer Cancer Project

Welcome to the Help Conquer Cancer Project, and thank you for participating in this important research. The mission of our project is to improve the results of protein X-Ray crystallography, which helps researchers not only annotate unknown parts of the human proteome, but importantly, improves their understanding of cancer initiation, progression and treatment. Although our focus is cancer, results from this project will help other diseases as well.
Analyzing the results from this experiment will also lead to better understanding the underlying principles of protein crystallography. For the first time, a comprehensive crystallography image analysis will be done, which was impossible before due to computational complexity. In turn, CrystalVision will be improved to provide faster and more accurate image classification. This will lead to more protein structures being determined. In addition, determining more 3D structures of proteins will also lead to improved in silico structure prediction.
Thank you again for making vital contribution to the project. It is highly appreciated, as it would take us over 162 years on the largest computer available to us to finish this computation. Although, we expect to finish the project in about 1-2 years on the World Community Grid, we will start analyzing the data incrementally. We will keep you informed about our results at http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/wcg-hcc.html
Thank you
Help Conquer Cancer Project Team

MfG, bme! :smoking:

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Michael H.W. Weber
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#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 02.11.2007 13:11

Aha. Bei dem Projekt handelt es sich also um eines zur Verbesserung von Proteinkristallisationstechniken. Hat mit Krebs erst mal gar nichts zu tun. Aber nützt natürlich, wenn man "Krebs" außen draufschreibt, weil sich dann mehr Leute drauf stürzen. Soll jetzt aber nicht andeuten, daß das Projekt nichts taugt. Bin nur etwas verärgert, daß man hier ganz offensichtlich mit irreführenden Etiketten Werbung macht. Was dahinter steckt, wird man dann hoffentlich hier verfolgen http://www.worldcommunitygrid.org/forum ... read=16936

Michael.
Zuletzt geändert von Michael H.W. Weber am 03.11.2007 17:36, insgesamt 1-mal geändert.
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Dennis Kautz
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#3 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 02.11.2007 13:50

Berechnet werden 86,630,400 WUs, deren Dauer vom Projektbetreiber mit je 10h angegeben wird. Demnach würden ca. 98893 Jahre CPU-Zeit benötigt werden. Laut WCG-Forum dauert eine WU auf einem C2D aber nur um die 6h. Man kann also noch guter Hoffnung sein, dass wir schneller fertig werden. :)

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#4 Ungelesener Beitrag von Torbjörn Klatt » 02.11.2007 14:41

Da kommt bei mal eine generelle Frage bezüglich der CPU-Zeit auf.

Welcher CPU gilt als Vergleichs-CPU nach dem die CPU-Jahre berechnet werden? Und gibt es irgendwo eine Tabelle in der ich die gängigsten CPUs im Vergleich zu diesem Einheits-CPU aufgelistet finde?

Grüße,
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#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 03.11.2007 17:40

Ich habe den Link oben mal "optimiert", sodaß er nun wirklich auf den "thread" zeigt, den ich bei WCG gestartet hatte.

Michael.
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#6 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 07.11.2007 18:54

Die Projektbetreiber erwarten, dass mit "Help Conquer Cancer" die vorhandenen Röntgenkristallographie-Images innerhalb von zwei Jahren stattfinden kann. Mit herkömmlichen Methoden wären bis zu 162 Jahre hierfür notwendig.

http://www.tgdaily.com/content/view/34726/113/

Man erhofft sich dadurch eine bessere Diagnose von Krebs, sowie ein besseres Verständnis des Fortschreitens der Krankheit. Untersucht werden Ergebnisse von Röntgenkristallographie-Untersuchungen, hauptsächlich von verschiedenen Krebs-Subtypen.

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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.11.2007 16:14

Ich sage es ruhig noch einmal. Das Projekt hat mit Krebs nichts zu tun.

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#8 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 08.11.2007 17:53

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Ich sage es ruhig noch einmal. Das Projekt hat mit Krebs nichts zu tun.
Aber immer noch besser als Seti &Co. :D
Ich habe viel Geld für Alkohol, Weiber und schnelle Autos ausgegeben.
Den Rest hab’ ich einfach nur verprasst.

(George Best, britische Fußball-Legende)

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#9 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 08.11.2007 21:47

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Ich sage es ruhig noch einmal. Das Projekt hat mit Krebs nichts zu tun.

Michael.
Die analysierten Bilder beinhalten zum größten Teil Aufnahmen von mit Krebs in Zusammenhang gebrachten Proteinen...

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#10 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 09.11.2007 14:47

frost hat geschrieben:
Michael H.W. Weber hat geschrieben:Ich sage es ruhig noch einmal. Das Projekt hat mit Krebs nichts zu tun.

Michael.
Die analysierten Bilder beinhalten zum größten Teil Aufnahmen von mit Krebs in Zusammenhang gebrachten Proteinen...
Hat dennoch nichts mit Krebs zu tun. Ist ein reines Protein-Kristallisationsprojekt.

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#11 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 09.11.2007 14:54

Michael H.W. Weber hat geschrieben:
frost hat geschrieben:
Michael H.W. Weber hat geschrieben:Ich sage es ruhig noch einmal. Das Projekt hat mit Krebs nichts zu tun.

Michael.
Die analysierten Bilder beinhalten zum größten Teil Aufnahmen von mit Krebs in Zusammenhang gebrachten Proteinen...
Hat dennoch nichts mit Krebs zu tun. Ist ein reines Protein-Kristallisationsprojekt.

Michael.
Du gehst also davon aus, dass es keine Auswirkungen auf das Verständnis, bzw. die Diagnose von Krebs hat, wenn mit dieser Krankheit in Verbindung stehende (kristallisierte) Proteine untersucht werden?

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#12 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 11.11.2007 12:21

frost hat geschrieben:Du gehst also davon aus, dass es keine Auswirkungen auf das Verständnis, bzw. die Diagnose von Krebs hat, wenn mit dieser Krankheit in Verbindung stehende (kristallisierte) Proteine untersucht werden?
Das ist nicht deren Thema.

Michael.
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