RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

Alles zum Rechenkraft.net e.V.
Nachricht
Autor
Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 22419
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk
Kontaktdaten:

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#61 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 01.08.2012 22:29

Zur bildlichen Verdeutlichung:

Was sind Pipetten? Die gibt es auch für Simultanpipettieren.
Was ist eine Cleanbench?

Ich denke, wir können viel davon lernen, wenn wir uns die kommerziellen Lösungen im Detail ansehen.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B

Bild Bild Bild

Benutzeravatar
Peter Fanghänel
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 546
Registriert: 24.01.2006 13:56
Wohnort: Berlin

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#62 Ungelesener Beitrag von Peter Fanghänel » 01.08.2012 22:48

Nun, das ist ok, so lange wir garantieren können, dass nichts bewegt wird wenn das Gerät geöffnet ist. Und wir berechnen können wie stark das Material sein muss, um eventuelle Splitter abzuhalten. Und zusätzlich die Stabilität der Halterung, damit sich der Metallkorpus selbst nicht löst und ggf gefährlich wird...
Vielleicht etwas Paranoid. Aber ich bin Laie und kann es nicht einschätzen.
Des Weiteren sind Eigenentwicklungen nicht immer günstiger als Standardprodukte. Besonders in Bezug auf die Arbeitszeit.
Zusätzlich muss beachtet werden, ob die erzielten Ergebnisse zuverlässig sind. Das ist nun aber nicht spezifisch und gilt eher allgemein.
Dunuin hat geschrieben:
Aber wie Michael möchte ich nicht, dass wir zusammen gedengelte Geräte hinstellen, in denen sich Teile mit über 10.000 upm bewegen.
Deshalb meinte ich ja das ganze in ein stabiles Stahlgehäuse, was man nicht öffnen kann, solange sich da was dreht. Wenn da was passiert, dann wenigstens nur drinnen, wo nichts passieren kann.
Bild

Benutzeravatar
Dunuin
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1743
Registriert: 23.03.2011 12:59
Wohnort: Hamburg

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#63 Ungelesener Beitrag von Dunuin » 02.08.2012 01:13

Dann nochmal eine doofe Frage zum Simultanpipettieren. Wirkt da eine einzige Sogwirkung auf alle Spitzen oder jede für sich getrennt? Wenn es letztes ist hätte ich ja gesagt man nimmt einfach eine fertige von diesen Simultanpipetten und versucht die zu verbauen. Können die dann die Spitzen auch selbst abwerfen über einen Hebel oder so? Ansonsten braucht man da ja doch wieder etwas eigenes, damit der Roboter die Spitzen auch selbst auswechseln kann.
Bild

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 22419
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk
Kontaktdaten:

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#64 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 02.08.2012 09:52

Es wirkt ein Sog auf alle Spitzen.
Die Spitzen werden mit dem Abwerfer (siehe den seitlichen Stahlbügel im Bild der Handpipetten) durch Druck von oben auf den Spitzenrand nach unten abgeworfen.
Ich habe bei einer professionellen Maschine gesehen, dass dort der Abwerfer fehlt und die Spitze stattdessen abgestreift wird, indem der Pipettenschaft von unten nach oben durch eine Klemme gezogen wird, die zu schmal ist, als dass die Spitze auch durchginge. In der Folge fällt die Spitze nach unten in einen Müllbehälter. Eine sehr simple und effektive Lösung, die lediglich eine stark veranktere Klemme und etwas Kraft im Pipettenarm erfordert.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B

Bild Bild Bild

Tim
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 931
Registriert: 05.04.2013 16:22
Wohnort: Wildau

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#65 Ungelesener Beitrag von Tim » 18.12.2015 19:53

https://www.kickstarter.com/projects/93 ... escription
http://opentrons.com/

Ich glaube das ist ganz interessant. Es soll ein OpenSource-Projekt sein. Sie verkaufen die Maschine, aber möglicherweise kann geben sie die Materialliste kostenlos oder gegen einen geringen Preis raus.

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 22419
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk
Kontaktdaten:

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#66 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 22.12.2015 08:42

OK, nun sind die also endlich Online gegangen mit diesem schon länger im Web verfügbaren Projekt. Also zunächst einmal ist das Endgerät aus meiner Sicht immer noch zu teuer. Es nutzt zudem Standardlaborpipetten, die mittels Motorcontroller bedient werden und ist insofern nicht besonders innovativ.
Frappierend (und auch nicht besonders neu) sind die angebotenen Add-On Kits. Diese bedeuten, dass letztlich vor Ort ein genetisch modifizierter E. coli Stamm produziert werden kann. In der BRD und auch den USA ist dies meines Wissens nach verboten - da wird es rechtliche Schwierigkeiten geben und zwar für diejenigen, die die Kits dann vor Ort einsetzen. Ob der Vertreiber Probleme bekommen wird, hängt aus meiner Sicht davon ab, ob und falls ja, welchen E. coli Stamm die mitliefern. Ist das ebenfalls ein GVO, dann gute Nacht. Dann hätten wir den ersten mir bekannten Präzedenzfall für eine Situation in der Laien animiert von einer Firma in einem DIY-Ansatz genetisch veränderte Organismen herstellen und diese dann (natürlich ohne sich über die Problematik bewusst sein zu müssen und ohne böse Absicht) unkontrolliert in die Umwelt entlassen.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B

Bild Bild Bild

Benutzeravatar
www.rekorn.de
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 721
Registriert: 02.06.2003 15:11
Wohnort: Berlin

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#67 Ungelesener Beitrag von www.rekorn.de » 22.12.2015 20:26

Michael, ist das Thema also weiterhin aktuell?

Wenn ja, würde ich als Ausgangsbasis einen 3D-Drucker zur Positionierung des nehmen
dann eine selbstgebastelte Spritzenpumpe mit wechselbaren Pipettenaufsatz (https://de.wikipedia.org/wiki/Spritzenpumpe).
Für die Spritzenpumpe brauchst du nur ein Gestell in dem der Hub der Spritze hin und her bewegt werden kann, also ein einfacher Motor mit links und rechts Drehung sollte das fertig bringen.
Die Genauigkeit der Menge kommte auf die Umsetzung des Getriebes an, aber da gibts hier bestimmt welche, die das besser Erklären und Umsetzen können.

Zusammen mit dem 3D-Drucker dürfte das dein "Agar-Gießer" sowie dein Pipettierroboter sein.
shit happens, everyday
Bild

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 22419
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk
Kontaktdaten:

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#68 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 23.12.2015 10:15

Das Thema ist aktueller denn je. Ich habe in MR inzwischen drei Leute, die mir dabei helfen möchten, eine ähnliche Maschine zu bauen. Als Pumpsystem werden wir aber etwas ausgefeilteres verwenden. Zudem wird das Teil deutlich kleiner werden und andere Labortechniken integrieren - es geht inzwischen längst nicht mehr um einen reinen Piepttierrobotor. Ich hatte ja schon im GPS-Thread erwähnt, dass ich einiges an Elektronikbauteilen eingekauft habe und es ist ja nun auch bekannt, dass ich ein Freund von Microfluidics bin. :wink:

Ein Problem ist immer die Finanzierung, die bislang nie ausreichend war und der Hauptgrund dafür ist, dass immer alles ewig dauert und ggf. dann am Ende doch von anderen eher gemacht wird, bei denen einfach die Infrastruktur und das Geld schon da sind, sodass man sich auf's "Ideen klauen" konzentrieren kann. Ich hasse es...
Aber inzwischen steht mein Labor und die Dinge kommen endlich ins Rollen. Ich konnte sogar eine Hilfskraftstelle im Zusammenhang mit meinen Citizen Science Aktivitäten bekommen, sodass ich nun nicht mehr völlig ohne Einnahmen der Entwicklung meines Projekts (zu dem ja auch RNA World gehört) nachgehen kann.
Die wenigsten hier wissen vielleicht, dass ich seit 2012 von meinen meinen Rücklagen aus der Post-Doc-Zeit am MIT lebe, um ein offenes, vollautomatisiertes "genetic engineering"-Projekt Realität werden zu lassen - wofür ich übrigens konkrete Umsetzungsvorarbeiten durchgeführt habe. Da ich leider oft etwas zu offen über Details der Projekte spreche, sind nun schon etliche "Abstauber" in selber Angelegenheit unterwegs. Meist Leute, die sich als gleichgesinnte DIY-/OpenAccess-Leute ausgeben, am Ende aber irgend eine "company" anstreben. Mir wurde auch schon die "Mitarbeit" in derlei "companies" angeboten - wo ich dann also freundlicherweise an den von mir federführend ausgearbeiteten und in die "company" mitgebrachten Projekten mitarbeiten darf und dann fragen muss, was ich wann und wo davon veröffentlichen und damit machen darf. Ich glaub' mein Schwein pfeifft...

Kurz zurück zum Kickstarter-Projekt:
Ich habe mir deren speziellen Motorsteuerungs-Microcontroller nicht im Detail angesehen, frage mich aber schon, warum nicht direkt der Raspi oder ein Arduino (noch simpler zu bedienen) eingesetzt wurde. Auch gibt es für beide Platformen längst spezielle Motorsteuerungsboards, die man dransteckt und gut is.
Das ganze Aluminiumgestänge ist ein Fertigstecksystem, das auf jeder MakerFaire feilgeboten wird. Auch da leider Null Eigeninnovation. Ich meine sogar, es ist eine deutsche Firma - hatte mir in Berlin einen Prospekt mitgenommen.

Bei den Spitznpumpen bin ich mir nicht sicher, ob die wirklich im sub-µL-Bereich pipettiergenau sind und ob es da überhaupt welche mit deutlich geringeren Gesamtvolumina gibt. Üblicherweise findet man sowas ja im Krankenhaus im 50 mL-Maßstab.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B

Bild Bild Bild

Benutzeravatar
www.rekorn.de
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 721
Registriert: 02.06.2003 15:11
Wohnort: Berlin

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#69 Ungelesener Beitrag von www.rekorn.de » 23.12.2015 13:23

http://www.ismatec.de/de_d/pumpen/kds_s ... n/home.htm

so eine hatte ich für meinen damaligen Arbeitgeber besorgt... da ging es darum 150µl pro Tag zu fördern...

soweit zur Genauigkeit. Was deine Innovation angeht verstehe ich die vorgehensweise nicht - was ist das Ziel? Ein schickes Gerät, das die Aufgabe ausführt mit Komponenten die sonst noch keiner verbaut hat oder ein Gerät das mit irgendwie zusammengebaut wurde, billig ist und die Funktion erfüllt... Das Aluprofile bei 3D-Druckern o.ä. verwendet werden bedingt durch die notwendige Stabilität solcher Geräte. Wenn der Arm erst mal in Fahrt ist, darf die Masse nicht das Gerät ins schwanken bringen, sonst gibt es Ungenauigkeiten.

Redest du von Einmal-Kosten? oder laufende Kosten? Um welche Höhe geht es hier?
shit happens, everyday
Bild

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 22419
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk
Kontaktdaten:

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#70 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.12.2015 05:22

www.rekorn.de hat geschrieben:http://www.ismatec.de/de_d/pumpen/kds_s ... n/home.htm

so eine hatte ich für meinen damaligen Arbeitgeber besorgt... da ging es darum 150µl pro Tag zu fördern...

soweit zur Genauigkeit.
Hast Du dazu noch grob Preise im Kopf? Ich hatte auf der Webseite jetzt auf die Schnelle nichts gefunden.
Alle anderen Infos per PN.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

http://signature.statseb.fr I: Kaputte Seite A
http://signature.statseb.fr II: Kaputte Seite B

Bild Bild Bild

Benutzeravatar
www.rekorn.de
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 721
Registriert: 02.06.2003 15:11
Wohnort: Berlin

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#71 Ungelesener Beitrag von www.rekorn.de » 24.12.2015 10:13

Teuer... das lohnt sich nicht zu kaufen, vielleicht so 2 bis 3000 euro... haben die teile mit labview angesteuert. genaue zahlen kann ich dir erst übermorgen geben oder ich finde noch zeit am abend. Diese pumpen selbst zu basteln kommt deutlich günstiger.
shit happens, everyday
Bild

Benutzeravatar
www.rekorn.de
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 721
Registriert: 02.06.2003 15:11
Wohnort: Berlin

Re: RKN als erste deutsche DIY-BioTechnology Community

#72 Ungelesener Beitrag von www.rekorn.de » 24.12.2015 16:27

So... wa eine Europaauschschreibung... 2713,20€ brutto (http://spetec.de/labortechnik/spritzenpumpe/index.php)
shit happens, everyday
Bild

Antworten

Zurück zu „Öffentliches Vereinsforum“